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DPSPDNT - Artigos em revistas nacionais

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  • Hipercolesterolemia familiar homozigótica em Portugal: caracterização de casos diagnosticados geneticamente no âmbito do Estudo Português de Hipercolesterolemia Familiar, 1999-2023
    Publication . Medeiros, Ana Margarida; Alves, Ana Catarina; Miranda, Beatriz; Chora, Joana Rita; Aguiar, Patrício; Amaro, Mário; Bruges, Margarida; Ferreira, Sofia; Furtado, António; Gaspar, Ana; Gonçalves, Filipa Sousa; Lobarinhas, Goreti; Lourenço, Guilherme; Martins, Paula; Antunes, Sofia Moura; Palma, Isabel; Rato, Quitéria; Torres, Diogo; Rico, Miguel Toscano; Travessa, André; Bourbon, Mafalda
    Hipercolesterolemia Familiar (FH) é uma condição autossómica semidominante causada por variantes patogénicas ou provavelmente patogénicas nos genes LDLR, APOB e PCSK9. A FH pode apresentar-se na forma monoalélica (FH heterozigótica) ou bialélica (FH homozigótica). A forma homozigótica é mais rara e com fenótipo mais grave. Indivíduos com FH homozigótica geralmente apresentam hipercolesterolemia severa (LDL>400mg/dL), xantomas e doença cardiovascular aterosclerótica (DCVA) prematura em idade jovem. Até 2023, foram referenciados ao Estudo Português de Hipercolesterolemia Familiar 1291 casos-índex. Neste estudo foram analisados os casos com FH homozigótica. Foram identificados 15 casos com FH homozigótica: 5 com a mesma variante bialélica no LDLR, 7 com variantes bialélicas diferentes no LDLR, 1 com variantes bialélicas diferentes no PCSK9, e 2 com variantes nos genes LDLR e APOB. A maioria dos indivíduos eram adultos (73%) e do sexo feminino (87%), 13% apresentando xantomas tendinosos e 36% com DCVA. Variantes de alelo nulo estão associadas a um fenótipo mais grave e a uma menor resposta ao tratamento, sendo necessária terapêutica independente da atividade do recetor de LDL. O diagnóstico genético permite identificar com precisão as variantes e os tipos de alelos, e implementar uma abordagem terapêutica mais personalizada nestes indivíduos.
  • Análise de uma rede de similaridade genética entre a perturbação do espetro do autismo e comorbilidades do foro neurológico e neuropsiquiátrico
    Publication . Vilela, Joana; Martiniano, Hugo; Marques, Ana Rita; Santos, João Xavier; Rasga, Célia; Oliveira, Guiomar; Vicente, Astrid Moura
    A Perturbação do Espetro do Autismo (PEA) é uma perturbação do neurodesenvolvimento com apresentação clínica heterogénea, nível de gravidade variável e ocorrência de múltiplas comorbilidades. A PEA tem uma arquitetura genética complexa que se reflete na sua heterogeneidade clínica, existindo evidência de uma sobreposição de genes alterados entre esta condição e diversas comorbilidades do foro neurológico e neuropsiquiátrico. Neste estudo, construímos uma rede de interação entre doenças baseada na similaridade genética, para explorar a componente genética compartilhada entre a PEA e comorbilidades neurológicas e neuropsiquiátricas. As doenças analisadas incluem o Défice Intelectual (DI), a Perturbação de Hiperatividade/ Défice de Atenção (PHDA) e a Epilepsia, bem como outras doenças neuropsiquiátricas como a Esquizofrenia (SCZ) e a Perturbação Bipolar (PB). Usando a base de dados de doenças da DisGeNET, a similaridade genética entre as doenças analisadas foi calculada a partir do coeficiente de Jaccard entre pares de doenças, e o algoritmo de Leiden foi usado para identificar comunidades de doenças na rede. Identificámos uma comunidade heterogénea de doenças geneticamente mais semelhantes à PEA, que inclui a Epilepsia, a PB, a PHDA com apresentação combinada, e algumas perturbações no espetro da SCZ. Esta abordagem permitiu obter uma maior clarificação acerca da componente genética compartilhada entre a PEA e comorbilidades neurológicas e neuropsiquiátricas, com implicações importantes para a nosologia, fisiopatologia e o tratamento o personalizado da doença.
  • Classificação de variantes de hipercolesterolemia familiar pelo painel de peritos do Clinical Genome Resource
    Publication . Chora, Joana Rita; Bourbon, Mafalda; em nome do FH Variant Curation Expert Panel
    hipercolesterolemia familiar (FH) é a patologia monogénica mais comum e caracteriza-se por valores muito elevados de colesterol em circulação, levando à sua deposição nas artérias e causando aterosclerose prematura. Indivíduos com FH têm variantes patogénicas, principalmente no gene LDLR (>90%), mas também nos genes APOB e PCSK9, genes estes muito importantes no metabolismo lipídico. O diagnóstico genético é o diagnóstico definitivo, mas existem atualmente mais de 3500 variantes diferentes no LDLR listadas na ClinVar, e no início deste trabalho, 565 apresentavam classificações conflituosas de patogenicidade, não permitindo assim confirmar o diagnóstico clínico nos indivíduos portadores destas variantes. Neste trabalho apresentamos o progresso da classificação de variantes no LDLR pelo FH Variant Curation Expert Panel (VCEP) do Clinical Genome Resource (ClinGen), segundo a recomendação publicada pelo mesmo grupo para classificação de variantes no gene LDLR. No processo de classificação das variantes no gene LDLR, laboratórios associados enviam dados internos de casos índex com a variante em estudo, que são colocados no Variant Curation Interface e complementados com evidências publicadas em artigos científicos e outros dados obtidos de outras bases de dados como descrito na recomendação. Cada variante é avaliada por um biocurador sénior ou dois juniores e aprovada por três revisores antes de ser publicada oficialmente na ClinVar. Atualmente avaliámos 531 variantes no gene LDLR. O FH VCEP classificou 5% destas variantes como benignas/provavelmente benignas, 39% como patogénicas/provavelmente patogénicas, 48% como variantes de significado incerto, 1% como conflituosas e 7% estão ainda em avaliação. As classificações definitivas aumentaram de 34% para 44%, e as classificações conflituosas diminuíram de 56% para 1%. O trabalho do FH VCEP visa melhorar o diagnóstico genético da FH, para o qual a classificação correta das variantes no LDLR é de extrema importância. As recomendações do FH VCEP diminuem significativamente as classificações conflituosas, melhorando o diagnóstico da FH no mundo inteiro.
  • Projeto da melhoria da qualidade laboratorial (ProMeQuaLab): Uma Só Saúde nos Países de Língua Portuguesa
    Publication . Viegas, Silvia Judite; Martinello, Flávia; Leal, Silvania da Veiga; Miranda, Armandina; Barbosa, Menilita dos Santos; Rodrigues da Luz, Nádia C Silva; Faria, Ana
    A abordagem de “Uma só Saúde” é essencial para identificar, monitorizar, controlar, prevenir e erradicar as doenças transmissíveis entre o homem e os animais, permitindo uma vigilância epidemiológica eficaz. A qualidade dos dados de diagnóstico laboratorial de doenças de origem humana e ani- mal, é imprescindível para a vigilância epidemiológica de base laboratorial eficaz das zoonoses. O ProMeQuaLab (Projeto da Melhoria da Qualidade Laboratorial) visa a ca- pacitação de técnicos no diagnóstico laboratorial, para avaliação, monitori- zação e otimização do desempenho das metodologias utilizadas, de modo a gerar informação harmonizada, padronizada e comparável, que possa ser partilhada para ser avaliada epidemiologicamente. As atividades na área clínica humana já realizadas neste projeto desde 2015, foram alargadas à área veterinária desde 2023, com planeamento de aplica- ção de questionários para caracterizar os laboratórios veterinários, avaliar o seu nível de implementação do controlo da qualidade, identificar necessida- des de formação, e implementar melhoria da capacidade instalada e forma- ção de profissionais. Os documentos já produzidos e os profissionais já formados no âmbito das atividades do ProMeQuaLab serão multiplicadores do conhecimento para aplicação na área veterinária. Promover “Uma Só Saúde” exige ampliar oportunidades de formação e profis- sionais no diagnóstico laboratorial, fortalecendo laboratórios para oferecer ser- viços de alta qualidade e contribuir para promoção da saúde humana e animal.
  • Anemia de células falciformes: avaliação da hemoglobina fetal num grupo de crianças angolanas antes e após tratamento com hidroxiureia
    Publication . Almeida, Priscilla; Costa, Alcina; Seuanes, Filomena; Romão, Raquel; Brito, Miguel; Silva, Isabel Moreira da; Miranda, Armandina
  • Estratégia Nacional para a Medicina Genómica (PT_MedGen)
    Publication . Vicente, Astrid Moura
    A Medicina Genómica utiliza a informação contida no DNA de cada individuo para informar os seus cuidados de saúde, contribuindo para diagnósticos mais precisos e atempados, para ajustar a terapêutica certa para cada individuo e para estimar a sua predisposiçao a determinadas doenças, potenciando a sua prevenção. É assim um componente-chave da Medicina Personalizada. (...)
  • Recomendações para a Implementação da medicina genómica nos sistemas de saúde: principais conclusões das Country Exchange Visits ao Reino Unido, Estónia e Finlândia
    Publication . Costa, Alexandra; Cardoso, Maria Luís; Lopes, Maria Fátima; Vicente, Astrid; em nome da equipa do projeto Beyond 1 Million Genomes – Delivering Personalised Medicine cross borders: Implementation in healthcare systems and societal impact (WP5)
    Para que todos os cidadãos europeus possam vir a beneficiar da medi cina genómica de forma equitativa, é essencial colmatar as assime trias existentes na Europa na implementação das análises genómicas nos cuidados de saúde. Promover o diálogo e a cooperação entre países, contribuindo para a sua capacitação e partilha de boas práticas, é essencial para o avanço da medicina genómica a nível nacional e europeu. Nesse sentido, o projeto Beyond 1 Million Genomes (B1MG) organizou três Country Exchange Visits (CEVs) a países europeus com estratégias genómicas avançadas, nomeadamente o Reino Unido, a Estónia e a Finlândia. Estas visitas promoveram uma discus são aberta sobre os pontos-chave para a implementação sustentável da medicina genómica nos serviços de saúde. Profissionais de saúde e investigadores dos países signatários da iniciativa europeia de 1 Milhão de Genomas (1+MG) participaram nesses eventos, alguns dos quais apresentaram as respetivas iniciativas nacionais para a medi cina genómica. Com base nas boas práticas apresentadas, e em exemplos reais dos países anfitriões, foram propostas recomendações em áreas essenciais à implementação sustentável da medicina genómica nos sistemas de saúde europeus, nomeadamente: (i) o envolvimento dos cidadãos e dos doentes; (ii) o investimento em infraestruturas e a regulamentação na prática clínica; (iii) a formação e capacitação de profissionais de saúde; (iv) a construção de um ecossistema sustentável baseado em sinergias entre sistemas de saúde, investigação e indústria.
  • Estudo Português de Hipercolesterolemia Familiar (1999-2021): relação fenótipo-genótipo
    Publication . Medeiros, Ana Margarida; Alves, Ana Catarina; Chora, Joana Rita; Miranda, Beatriz; Bourbon, Mafalda; em nome dos investigadores do Estudo Português de Hipercolesterolemia Familiar
    A Hipercolesterolemia Familiar (FH) é uma condição genética comum do metabolismo dos lípidos, que se encontra subdiagnosticada. Existem três genes primários associados à FH (LDLR, APOB e PCSK9) e 5 genes fenocópias (LDLRAP1, LIPA, ABCG5, ABCG8 e APOE), que conferem um fenótipo semelhante à FH. Neste trabalho pretende-se apresentar a relação fenótipo-genótipo dos indivíduos com critérios clínicos de FH referenciados ao Estudo Português de Hipercolesterolemia Familiar. Até ao fim de 2021 foram estudados molecularmente 1005 indivíduos com critérios clínicos de FH. Destes, foram confirmados geneticamente com FH (FH positivos), 417 casos-índex (408 heterozigotos e 9 homozigotos). Com os estudos familiares identificaram- se adicionalmente 581 heterozigotos e 2 homozigotos. De entre os FH positivos, os casos-índex com variantes de alelo nulo apresentam um fenótipo mais severo do que os casos-índex com variantes de alelo defeituoso. Cerca de 1% dos casos-índex foram diagnosticados com outras causas monogénicas. Dos FH negativos, 34% apresenta hiper-Lp(a), 18% tem uma hipercolesterolemia de causa poligénica e 1% possui uma variante patogénica em heterozigotia nos genes fenocópias da FH. As diferentes causas genéticas contribuem para uma variedade de fenótipos que requerem diferentes formas de gestão da doença, terapias específicas e têm implicações na estratificação do risco cardiovascular e no rastreio dos familiares, sendo por esta razão essencial que seja identificada a etiologia da hipercolesterolemia o mais precocemente possível para melhorar o prognóstico dos indivíduos com FH.
  • Transplant Open Registry Initiative
    Publication . Lima, Bruno; Henriques, Teresa; Reis, Filipe; Alves, Helena
    Health data science aims to extract knowledge from data allowing better decision-making, using multidisciplinary approaches from fields such as computation, statistics, epidemiology, and several medical knowledge domains. We live in the ‘big data’ era, with a growing availability of health data, in volume, variety, and velocity, also for tasks such as kidney transplantation. Hereby, secondary use of this health data must be encouraged to improve patient care planning, disease research, and policymaking around transplantation. This article presents the Transplant Open Registry (TxOR) website where some health data science applications on kidney transplantation are available. With it, we try to answer, some of the remaining questions on kidney transplantation in Portugal, with a new approach.