Percorrer por autor "Pista, Ângela"
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- Antimicrobial resistance of Salmonella Typhi and Paratyphi isolates in Portugal, January 1994 - June 2025Publication . Pista, Ângela; Henriques, Ana Margarida; Caeiro, Raquel; Tomás, Alexandra; Silveira, LeonorIntrodution: Typhoid and paratyphoid fever are severe systemic infections caused by Salmonella (S.) enterica subspecies enterica serovars Typhi and Paratyphi A, B and C. Transmission occurs primarily through ingestion of food or water contamined with faeces from infected individuals or via direct person-to person contact. In Europe, enteric fever is rare and mainly associated with travel to endemic countries. The increasing prevalence of multidrug resistance (MDR), particularly in S. Typhi, poses significant therapeutic challenges. Aim: Characterization of antibiotic resistance profiles of S. Typhi and Paratyphi A, B, and C isolates received in Jan 94-Jun 25
- Attributable sources of the five most prevalent non-typhoidal Salmonella serovars across ten European countriesPublication . Teunis, Gijs; Dallman, Timothy J.; Zajac, Magdalena; Skarżyńska, Magdalena; Petrovska, Liljana; Pista, Ângela; Silveira, Leonor; Clemente, Lurdes; Thépault, Amandine; Bonifait, Laetitia; Kerouanton, Annaelle; Chemaly, Marianne; Alvarez, Julio; Soderlund, Robert; Nielsen, Eva Moller; Chattaway, Marie; Burgess, Kaye; Byrne, William; Zomer, Aldert L.; van den Beld, Maaike; Hendrickx, Antoni P.A.; Franz, Eelco; Pires, Sara; Hald, Tine; Mughini-Gras, LapoNon-typhoidal Salmonella is the second most frequently reported zoonotic pathogen in the European Union and European Economic Area. Most human infections are caused by serovars Enteritidis and Typhimurium. Genomic characterisation of Salmonella isolates from humans and animals has become a routine public health surveillance tool in many countries. In this study, the relative contributions of several potential sources of human infection of the five frequently reported Salmonella serovars were estimated using machine-learning methods based on a large, cross-sectional collection of genomes from human cases, and animal and environmental sources, across ten European countries. To define the population structure, core-genome Multilocus Sequence Typing was performed. A supervised machine-learning approach was applied for source attribution in the form of a Random Forest classifier. The source and country attribution models achieved moderate accuracy (F1=0.6–0.9), which is lower than in previous studies using machine-learning on Whole Genome Sequencing data. However, attributions of human clinical isolates to different sources were generally in line with previous findings for these five serovars. While the lack of clonality in some sources hindered their prediction, it is also likely that certain sources (e.g., pets) do not serve as major contributors to human infection. Therefore, in most cases attributing these sources to the livestock species they are typically associated with, is likely appropriate. Country attributions showed that substantial human cases are attributable to countries other than their own, indicating geographical interrelatedness of sources. This highlights the value of internationally harmonised Salmonella-control policies in the food production chain.
- Caracterização fenotípica de isolados de Salmonella enterica recebidos no INSA entre 2014 e 2017Publication . Leonor, Silveira; Pista, Ângela; Machado, JorgeAs infeções por Salmonella enterica são uma das causas mais frequentes de gastroenterite aguda em todo o mundo. Entre 2014 e 2017 foram recebidas no Laboratório Nacional de Referência de Infeções Gastrintestinais do Departamento de Doenças Infeciosas do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) 1124 estirpes de Salmonella isoladas de doentes portugueses provenientes de várias zonas do país. Foram identificados 68 serotipos diferentes, sendo os mais frequentes S. 4,5:i:- (n=372; 33,1%), S. Enteritidis (n=335; 29,8%), S. Typhimurium (n=208; 18,5%), S. Rissen (n=28; 2,5%), S. Typhi (n=25; 2,2%) e S. Stanley (n=12; 1,1%). Os serotipos de Salmonella identificados no período entre 2014 e 2017 acompanham a tendência europeia, nomeadamente no que se refere à diminuição de S. 4,5:i:- e aumento de S. Enteritidis. A serotipagem e a utilização de metodologias moleculares são fundamentais para a monitorização das salmoneloses humanas, particularmente na deteção de surtos e identificação de estirpes resistentes. Neste contexto, é fundamental manter e promover a colaboração entre os diversos serviços de saúde nacionais e internacionais, de forma a garantir a vigilância e controlo das infeções gastrintestinais em geral e por Salmonella spp em particular.
- Caracterização fenotípica de isolados de Shigella spp. entre 2015 e 2016Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Machado, JorgeCaracterização fenotípica de isolados de Shigella spp. entre 2015 e 2016
- Caracterização fenotípica de isolados de Shigella spp. entre 2015 e 2017Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Machado, JorgeEm Portugal, a shigelose é uma gastroenterite pouco frequente. Com este estudo pretendeu-se descrever os serotipos de Shigella spp. identificados no Laboratório Nacional de Referência de Infeções Gastrintestinais do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) entre 2015 e 2017. Foram analisadas estirpes isoladas de 53 doentes, que foram enviadas a nível nacional ao INSA para serotipagem. A suscetibilidade aos antimicrobianos foi realizada segundo as recomendações do European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Os serotipos mais frequentemente encontrados foram Sh. sonnei (n=37; 69,8%), Sh. flexneri 2 (n=7; 13,2%), Sh. flexneri 3 (n=3; 5,7%). Foi observada uma elevada percentagem de resistência à tetraciclina (47/53; 88,7%). Em 2017, todas as estirpes apresentaram resistência à ampicilina e a percentagem de estirpes com resistência à ciprofloxacina aumentou consideravelmente, de 5,0% em 2015 para 62,5% em 2017. Cerca de 50% das estirpes apresentaram resistência à azitromicina durante o período em análise. Foram detetados 4 casos de Shigella spp. multirresistentes em homens que fazem sexo com homens (HSH). O aumento de resistências aos antibióticos observados nestes dois anos alerta para a importância de uma vigilância ativa das mesmas e impõe uma articulação efetiva entre os diversos serviços de saúde envolvidos.
- Caracterização fenotípica de isolados de Shigella spp. entre 2015 e 2017Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Machado, JorgeShigella spp. é uma enterobactéria altamente infeciosa e transmitida de pessoa-a-pessoa. As infeções por Shigella são um importante problema de Saúde Pública, em particular nos países em desenvolvimento. Em Portugal, a shigelose é uma causa rara de gastroenterite. A Sh.sonnei é mais frequente na Europa e EUA e a espécie flexneri na Ásia e África. O aparecimento de espécies multirresistentes tem sido referido mundialmente, com destaque para a resistência às fluoroquinolonas e cefalosporinas. Com este estudo pretendeu-se descrever os serotipos de Shigella identificados no Laboratório Nacional de Referência de Infeções Gastrintestinais do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) entre 2015 e novembro de 2017. Foram analisadas 53 estirpes clínicas, isoladas a nível nacional e enviadas ao INSA para serotipagem. A suscetibilidade aos antimicrobianos foi realizada segundo as recomendações da EUCAST. Os serotipos mais frequentes foram Sh. sonnei (69,8%), Sh. flexneri 2 (13,2%), Sh. flexneri 3 (5,6%), Sh. flexneri 1 (3,8%), Sh. boydii 5 (3,8%), Sh. boydii 2 (1,9%) e Sh.dysenteriae 3 (1,9%). A idade dos pacientes variou entre os 1 e os 66 anos. Todas as estirpes foram resistentes a pelo menos um antibiótico. Foi observada uma elevada percentagem de resistência à tetraciclina (88,7%). O perfil de resistência mais frequente (77,4%) foi tetraciclina – trimetoprim - sulfametoxazole. A resistência às fluoroquinolonas e às cefalosporinas de 3ª e 4ª geração foi observada em, respetivamente, 22,6% e 1,9% das estirpes. Foi detetado um caso de Sh. sonnei multirresistente à ampicilina – tetraciclina – cefotaxime – ceftriaxone - ciprofloxacina - ácido nalidixico - trimetoprim-sulfametoxazole, num homem que faz sexo com homens (HSH). O serotipo mais frequente no período entre 2015 e novembro de 2017 foi Sh.sonnei, o que está de acordo com a tendência europeia. Apesar de não terem sido detetados muitos casos de resistência às fluoroquinolonas e cefalosporinas, estas não devem ser descuradas, uma vez que a sua emergência é evidente, em particular no caso dos HSH. Neste contexto, é fundamental manter e promover a colaboração entre os diversos Serviços de Saúde nacionais.
- Caracterização fenotípica e genotípica de isolados de Salmonella enterica recebidos no INSA entre 2014 e 2016Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Machado, JorgeCaracterização fenotípica e genotípica de isolados de Salmonella enterica recebidos no INSA entre 2014 e 2016
- Caracterização genotípica e fenotípica de estirpes de Escherichia coli patogénicas, Salmonella spp. e Campylobacter spp. isoladas de aves em liberdade em Portugal continentalPublication . Batista, Rita; Saraiva, Margarida; Lopes, Teresa; Silveira, Leonor; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Castro, Rita; Correia, Cristina Belo; Rodrigues, David; Henriques, Pedro; Lóio, Sara; Soeiro, Vanessa; Martins da Costa, Paulo; Oleastro, Mónica; Pista, ÂngelaAs aves são potenciais portadoras de microrganismos patogénicos que afetam os seres humanos, e podem ser disseminadoras de perigos no ambiente de produção primária de géneros alimentícios de origem vege- tal e animal. Este trabalho teve como objetivo avaliar a ocorrência, em fezes de aves em liberdade, em Portugal, de três bactérias zoonóticas causadoras de infeções no Homem. Para tal, foi avaliada a presença de Escherichia coli (E. coli), Salmonella spp. e Campylobacter spp. em 108 amostras individuais de fezes de aves e em uma amostra em pool de 50 amostras de fezes de gaivotas. Foi efetuada a caracterização fenotípica dos isolados (serotipagem e perfis de resistência a antibióticos) e dete- tados genes específicos associados à patogenicidade e à resistência a antimicrobianos, por PCR e/ou sequenciação total do genoma (WGS). Isolados de E. coli patogénicos, Salmonella spp. e Campylobacter spp. foram detetados em 8,9%, 2,8% e 9,9% das amostras, respetivamente. A resistência a antimicrobianos foi testada em 54 isolados de E. coli, tendo sido detetada em 14 (25,9%). Onze destes isolados revelaram a presença de fatores de virulência, E.coli patogénicos. Dez dos isolados de E. coli revelaram ser resistentes a múltiplos antimicrobianos (MDR) e sete eram produtores de β-lactamases de espectro alargado (ESBL). Re- lativamente aos isolados de Salmonella spp. (n=3) e Campylobacter spp. (n=9), apenas uma estirpe de Campylobacter jejuni foi identificada como MDR. A maioria dos serotipos e/ou Sequence Types (ST) identificados já tinham sido referenciados como associados a doença humana. Estes resultados mostram que as aves que fazem parte da fauna portuguesa podem ser portadoras de bactérias patogénicas capazes de causar do- ença humana, algumas delas resistentes a antimicrobianos críticos.
- Caracterização molecular e suscetibilidade aos antimicrobianos de isolados de L. monocytogenes na região de LVT em 2015Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Maia, Carla; Barreira, Maria João; Rodrigues, João; Reis, Lúcia; Machado, JorgeCaracterização molecular e suscetibilidade aos antimicrobianos de isolados de L. monocytogenes na região de LVT em 2015.
- Caraterização molecular e suscetibilidade aos antimicrobianos de isolados clínicos de Listeria monocytogenes na região de Lisboa e Vale do Tejo em 2015Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Maia, Carla; Barreira, Maria João; Rodrigues, João; Reis, Lúcia; Machado, JorgeListeria monocytogenes é o agente causal da listeriose, uma doença grave considerada de vigilância prioritária a nível europeu, com taxas de hospitalização (98,9%) e de letalidade (15,0%) elevadas. Este estudo teve como objetivo a caraterização das estirpes de L. monocytogenes recebidas no Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge em 2015. A serotipagem foi realizada por PCR multiplex, a tipagem por PFGE e também foi estudada a suscetibilidade aos antimicrobianos. O serotipo mais comum foi IVb (85,7%). A maioria das estirpes é sensível aos antimicrobianos em apreciação, com exceção de uma estirpe que apresentou resistência ao meropenemo e outra que apresentou resistência à eritromicina e ao trimetoprim/sulfametoxazol. Existe uma grande heterogeneidade de perfis de PFGE entre os isolados estudados, tendo sido detetados alguns clusters. A utilização de sequenciação de genoma completo para caraterização de estirpes, nomeadamente de L. monocytogenes está a ganhar terreno a nível mundial, vindo substituir as técnicas goldstandard. A sua aplicação no Laboratório Nacional de Referência de Infeções Gastrintestinais permitiu em 2015 a confirmação laboratorial de um surto.
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