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- Prevalência da microcefalia em Portugal entre 1997- 2016: dados do Registo Nacional de Anomalias CongénitasPublication . Braz, Paula; Antunes, Liliana; Santos, Joana; Machado, Ausenda; Dias, Carlos MatiasIntrodução: A microcefalia caracteriza-se por um perímetro cefálico muito menor que o esperado para indivíduos do mesmo sexo, idade e etnia. Os critérios de diagnóstico variam entre um perímetro cefálico inferior a 2 desvios padrão ou inferior a 3 desvios padrão da média (1). A etiologia pode estar associada a anomalias cromossómicas, à exposição a teratogénicos durante a gravidez ou a má nutrição grave mas, frequentemente, é desconhecida (2). A associação da microcefalia com a infeção pelo vírus Zika, enfatizou a necessidade de manter uma monitorização contínua das anomalias congénitas. Em Portugal esta monitorização é assegurada desde 1997 pelo Registo Nacional de Anomalias Congénitas – RENAC (3, 4). Este estudo tem como objetivo estimar a tendência anual da prevalência da microcefalia no âmbito da vigilância das anomalias congénitas. Materiais e Métodos: Foram utilizados dados do RENAC para o cálculo da prevalência da microcefalia, por 10000 nascimentos, sendo o numerador composto por recém-nascidos, fetos mortos e interrupções médicas de gravidez. Foi ajustado um modelo de regressão de Poisson ao número de casos de microcefalia de 1997-2015 (excluindo o período 2000-2009) em função do ano e total de nascimentos anual (5). No cálculo dos intervalos de confiança para a previsão do número e da prevalência de microcefalia, foi aplicado o método descrito por Dyba & Hakulinen (6). Resultados: A prevalência variou entre 0,17/10000 e 1,93/10 000. Em 2016, até Novembro, foram notificados 10 casos de microcefalia. Nas notificações recebidas entre 2010 e 2016 (n=68), 11,76% tinham uma etiologia cromossómica, 5,88% tinham exposição a fatores teratogénicos, 2,94% tinham uma síndrome genética e 79,41% não tinham etiologia conhecida. Com base no modelo estatístico utilizado e assumindo o mesmo número de nascimentos do ano 2015, estima-se que a prevalência de microcefalia em 2016 seja 1,13/10000 nascimentos [IC95% 0,15/10000 – 2,11/10000] estimando-se a notificação de 10 casos [IC95% 2 - 18]. Discussão e Conclusão: As diferenças observadas nos valores da prevalência ao longo dos anos podem depender da subnotificação de casos ao RENAC (3,4) ou da não notificação da microcefalia na presença de anomalias cromossómicas. Os dados do RENAC ao permitirem a determinação de um valor esperado para a prevalência da microcefalia possibilitam a motorização destes casos. Enquanto sistema de vigilância também permite detectar um aumento acentuado da prevalência e identificar fatores associados.
- Caracterização molecular e suscetibilidade aos antimicrobianos de isolados de L. monocytogenes na região de LVT em 2015Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Maia, Carla; Barreira, Maria João; Rodrigues, João; Reis, Lúcia; Machado, JorgeCaracterização molecular e suscetibilidade aos antimicrobianos de isolados de L. monocytogenes na região de LVT em 2015.
- Caracterização fenotípica de isolados de Shigella spp. entre 2015 e 2016Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Machado, JorgeCaracterização fenotípica de isolados de Shigella spp. entre 2015 e 2016
- Caracterização fenotípica e genotípica de isolados de Salmonella enterica recebidos no INSA entre 2014 e 2016Publication . Silveira, Leonor; Pista, Ângela; Machado, JorgeCaracterização fenotípica e genotípica de isolados de Salmonella enterica recebidos no INSA entre 2014 e 2016
- Avaliação da exequibilidade de um estudo de efetividade da vacina antigripal contra casos graves de gripe, na época 2015-16, em Portugal: o projeto EVA HospitalPublication . Gómez, Verónica; Gomes, Victor; Poças, José; Côrte-Real, Rita; Peres, Maria João; Rodrigues, Ana Paula; Machado, Ausenda; Nunes, BaltazarIntrodução/Objetivo do trabalho: O projeto EVA Hospital é a componente portuguesa do estudo multicêntrico europeu I-MOVE+ (Integrated Monitoring of Vaccines Effects in Europe) e pretende obter estimativas da efetividade da vacina antigripal (EVA) contra gripe confirmada laboratorialmente em doentes com 65 e mais anos hospitalizados com infeção respiratória aguda grave (SARI). Na época 2015-16 este estudo teve como objetivo avaliar a exequibilidade da sua implementação em Portugal. Material e Métodos: Participaram no estudo o Centro Hospitalar de Setúbal e o Centro Hospitalar de Lisboa Central. Os doentes com SARI foram identificados no serviço de urgência e recrutados nas enfermarias participantes no estudo. Utilizou-se um delineamento caso controlo teste-negativo, onde os casos, doentes com SARI com diagnóstico laboratorial positivo para vírus da gripe, foram comparados com os controlos negativos para gripe. A informação epidemiológica foi obtida pelo médico através de questionário com consulta de processo clínico e dos dados na Plataforma de Dados de Saúde (PDS). O diagnóstico laboratorial foi efetuado por Multiplex/RT-PCR em exsudado da nasofaringe pelos laboratórios dos centros hospitalares. Resultados: Foram recrutados 81 indivíduos com SARI, dos quais 52 tinham critérios de inclusão. Não se verificaram valores omissos na informação sociodemográfica e nas datas de internamento/alta, início de sintomas e colheita de exsudado. A utilização da PDS foi fulcral para o reduzido número de omissos quanto à toma da vacina antigripal (2,5%) e data (21%). Foram identificados 16 casos de gripe (87,5% do subtipo A(H1)pdm09 e 6,3% do tipo B) e 36 controlos. Na comparação de casos e controlos, foram encontradas diferenças significativas quanto à toma de antivirais (mais frequente nos casos – 62,5% vs 8,3%) e cancro hematológico (mais prevalente nos casos – 12,2% vs 0%). A cobertura da vacina antigripal foi de 41,7% nos controlos, face a 18,8% nos casos, indicando o efeito protetor da vacina, apesar de estatisticamente não significativo. Conclusões: Verificou-se que é exequível implementar um estudo desta tipologia em contexto hospitalar, sendo possível recrutar doentes com SARI, com informação com qualidade, em particular no que respeita à toma e data da vacina antigripal. Os resultados indicam que a cobertura da vacina antigripal nos controlos é superior à cobertura nos casos, resultado a favor da hipótese de proteção da vacina sazonal 2015-2016.
- Genomic structure and insertion sites of Helicobacter pylori prophages from various geographical originsPublication . Vale, Filipa F.; Nunes, Alexandra; Oleastro, Mónica; Gomes, João P.; Sampaio, Daniel A.; Rocha, Raquel; Vítor, Jorge M. B.; Engstrand, Lars; Pascoe, Ben; Berthenet, Elvire; Sheppard, Samuel K.; Hitchings, Matthew D.; Mégraud, Francis; Vadivelu, Jamuna; Lehours, PhilippeHelicobacter pylori genetic diversity is known to be influenced by mobile genomic elements. Here we focused on prophages, the least characterized mobile elements of H. pylori. We present the full genomic sequences, insertion sites and phylogenetic analysis of 28 prophages found in H. pylori isolates from patients of distinct disease types, ranging from gastritis to gastric cancer, and geographic origins, covering most continents. The genome sizes of these prophages range from 22.6-33.0 Kbp, consisting of 27-39 open reading frames. A 36.6% GC was found in prophages in contrast to 39% in H. pylori genome. Remarkably a conserved integration site was found in over 50% of the cases. Nearly 40% of the prophages harbored insertion sequences (IS) previously described in H. pylori. Tandem repeats were frequently found in the intergenic region between the prophage at the 3' end and the bacterial gene. Furthermore, prophage genomes present a robust phylogeographic pattern, revealing four distinct clusters: one African, one Asian and two European prophage populations. Evidence of recombination was detected within the genome of some prophages, resulting in genome mosaics composed by different populations, which may yield additional H. pylori phenotypes.
- Assédio psicológico e presentismo no local de trabalhoPublication . Neto, Mariana; Ferreira, Aristides; Martinez, Luís; Costa Ferreira, PaulaObjetivo: O Assédio psicológico no trabalho é uma preocupação crescente para gestores e trabalhadores, pelos efeitos negativos que tem na organização e na produtividade. Constitui também preocupação crescente para os profissionais de saúde pelos efeitos, por vezes devastadores, que têm sobre a saúde. No entanto, poucos estudos têm investigado a forma como o Assédio psicológico no trabalho se relaciona com o Burnout e a perda de Bem-estar e de como, no conjunto, afetam a produtividade dos trabalhadores, traduzida em formas de Presentismo. Assim, o objetivo do presente estudo foi examinar os efeitos de mediação, considerando a análise de relações diretas e indiretas, do Burnout e do Bem-estar psicológico na relação entre o Assédio no trabalho e a perda de produtividade devida a qualquer das dimensões do Presentismo (Trabalho não completado e Concentração). Método: Recorreu-se a modelos de equações estruturais (SEM) para análise de dados de um estudo transversal, recolhidos por Computer Assisted Web Interview – CAWI, referente a uma amostra de 353 trabalhadores de uma empresa portuguesa de serviços de âmbito nacional. Foram consideradas as seguintes variáveis: Assédio no trabalho (Quine, 1999), Burnout (MBI – Exaustão emocional), Bem-estar psicológico (GHQ-28) e as perdas de produtividade devido ao presentismo (SPS-6) (Trabalho não completado e Concentração). Todas as variáveis apresentaram características psicométricas aceitáveis. Resultados: O modelo final revelou um ajuste aceitável. Verificou-se que o assédio no trabalho teve um efeito significativo sobre o Presentismo por duas vias: diretamente, afetando a dimensão Trabalho não completado e indiretamente, afetando a Concentração. Esta última via foi mediada pelos efeitos do Burnout e pela perda de Bem-estar psicológico. Conclusões e recomendações: Os profissionais de saúde ocupacional devem estar cientes de que o Burnout e a perda de Bem-estar podem ter como causa primária o Assédio no trabalho e que as perdas de produtividade podem ser um sinal de alerta. Os gestores e as chefias devem ter em conta que, no mecanismo subjacente à perda de produtividade dos trabalhadores, poderão estar situações de Assédio no trabalho devido aos efeitos diretos e ao impacto negativo sobre o Burnout e Bem-estar.
- Harmonizing methods for wildlife abundance estimation and pathogen detection in Europe - a questionnaire survey on three selected host-pathogen combinationsPublication . Sonnenburg, J.; Ryser-Degiorgis, M.P.; Kuiken, T.; Ferroglio, E.; Ulrich, R.G.; Conraths, F.; Gortázar, C.; Staubach, C.; APHAEA project partnersBACKGROUND: The need for wildlife health surveillance as part of disease control in wildlife, domestic animals and humans on the global level is widely recognized. However, the objectives, methods and intensity of existing wildlife health surveillance programs vary greatly among European countries, resulting in a patchwork of data that are difficult to merge and compare. This survey aimed at evaluating the need and potential for data harmonization in wildlife health in Europe. The specific objective was to collect information on methods currently used to estimate host abundance and pathogen prevalence. Questionnaires were designed to gather detailed information for three host-pathogen combinations: (1) wild boar and Aujeszky's disease virus, (2) red fox and Echinococcus multilocularis, and (3) common vole and Francisella tularensis. RESULTS: We received a total of 70 responses from 19 European countries. Regarding host abundance, hunting bags are currently the most widely accessible data source for widely distributed mid-sized and larger mammals such as red fox and wild boar, but we observed large differences in hunting strategies among countries as well as among different regions within countries. For small rodents, trapping is the method of choice, but practical applications vary among study sites. Laboratory procedures are already largely harmonized but information on the sampled animals is not systematically collected. CONCLUSIONS: The answers revealed that a large amount of information is available for the selected host-pathogen pairs and that in theory methods are already largely harmonized. However, the comparability of the data remains strongly compromised by local differences in the way, the methods are applied in practice. While these issues may easily be overcome for prevalence estimation, there is an urgent need to develop tools for the routine collection of host abundance data in a harmonized way. Wildlife health experts are encouraged to apply the harmonized APHAEA protocols in epidemiological studies in wildlife and to increase cooperation.
- Defeitos Genéticos das Doenças Mitocondriais: Abordagem por Sequenciação de Nova GeraçãoPublication . Nogueira, Célia; Pereira, Cristina; Silva, Lisbeth; Vieira, Luis; Leão Teles, Elisa; Rodrigues, Esmeralda; Campos, Teresa; Janeiro, Patricia; Costa, Claúdia; Gaspar, Ana; Soares, Gabriela; Bandeira, Anabela; Martins, Esmeralda; Santos, Helena; Vilarinho, LauraObjetivos:O objetivo deste projeto de investigação é desenvolver uma estratégia de sequenciação de nova geração para a identificação das alterações genéticas em doentes suspeitos de doenças mitocondriais sem caracterização molecular.
- Early 2016/17 vaccine effectiveness estimates against influenza A(H3N2): I-MOVE multicentre case control studies at primary care and hospital levels in EuropePublication . Kissling, Esther; Rondy, Marc; I-MOVE/I-MOVE+ study teamWe measured early 2016/17 season influenza vaccine effectiveness (IVE) against influenza A(H3N2) in Europe using multicentre case control studies at primary care and hospital levels. IVE at primary care level was 44.1%, 46.9% and 23.4% among 0-14, 15-64 and ≥ 65 year-olds, and 25.7% in the influenza vaccination target group. At hospital level, IVE was 2.5%, 7.9% and 2.4% among ≥ 65, 65-79 and ≥ 80 year-olds. As in previous seasons, we observed suboptimal IVE against influenza A(H3N2).