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- Exposure of the Portuguese adult population to arsenic: preliminary results of a human biomonitoring studyPublication . Namorado, Sónia; Coelho, Inês; Ventura, Marta; Gueifão, Sandra; Rego, Andreia; Castanheira, Isabel; Alves Alves, Clara; Castilho, Emília; Cordeiro, Eugénio; Dinis, Ana; Gouveia, Bruna; Prokopenko, Tamara; Vargas, Patrícia; Silva, Susana; Gaio, Vânia; Nunes, Baltazar; Matias Dias, CarlosBACKGROUND AND AIM:Although arsenic is an element naturally present in the environment, it is highly toxic in its inorganic forms. Exposure can occur through consumption of drinking water and contaminated food. Long-term exposure was shown to be associated with negative health outcomes. Nevertheless, data on the Portuguese population’s exposure to arsenic is scarce. As such, the aim of this work was to assess the exposure to Arsenic in the Portuguese population using samples collected in the study "Exposure of the Portuguese Population to Environmental Chemicals: a study nested in INSEF 2015" (INSEF-ExpoQuim), developed as an aligned study of the European Human Biomonitoring Initiative (HBM4EU). METHODS: INSEF-ExpoQuim was an epidemiologic study nested in INSEF 2015 including 270 participants aged 28-39 years,living in Portugal for more than 12 months and able to follow an interview in Portuguese. Fieldwork was developed between June 2019 and February 2020. First morning urine samples were collected along with data on socio-demographic characteristics, living conditions and residential history, habits/lifestyle, nutrition, health, occupation and substance specific information covering nearly all exposure pathways. Procedures followed the guidelines of the HBM4EU project. Total urinary arsenic is currently being determined by inductively coupled plasma mass spectrometry. RESULTS:Preliminary results for 38 samples yielded total urinary arsenic concentrations ranging from 11 to 462 μg/L with an average of 86 ± 94 μg/L. After completion of the determination of the urinary arsenic levels for all the samples a complete analysis of the data will be performed. CONCLUSIONS:Results from this study will contribute to the knowledge on the Portuguese population’s exposure to arsenic and may support the development and implementation of policy measures aimed at minimizing exposure to this chemical and improving the health of the population.
- Patrones Espaciales de Mortalidad Municipal por Cáncer en Portugal y España: Proyecto AMOCAPEPublication . Fernández Navarro, Pablo; Roquette, Rita; Núñez, Olivier; Sousa-Uva, Mafalda; Nunes, Baltazar; López-Abente, GonzaloAntecedentes/Objetivos: Los patrones espaciales de la mortalidad por cáncer sugieren la existencia de factores ambientales importantes en su etiología. Estos patrones pueden no ser hechos aislados y tener una prolongación más allá de las fronteras de los países. El proyecto “Atlas de mortalidad por cáncer en Portugal y España AMOCAPE” tie-ne por objetivo proporcionar imágenes de alta resolución que mues-tren la distribución espacial de la mortalidad municipal por cáncer en España y Portugal (archipiélagos incluidos) para el periodo 2003-2012.Métodos: Los datos de mortalidad por 33 tipos de cáncer y los de población fueron proporcionados por los Institutos Nacionales de Es-tadística de cada país. Se calcularon los casos esperados municipales utilizando como referencia las tasas específicas por grupo de edad y sexo del conjunto de Portugal y España. Se obtuvieron estimadores municipales de riesgo relativo suavizados usando el modelo espacial autorregresivo de Besag-York-Mollié utilizando Integrated nested La-place approximations (INLAs) como instrumento de inferencia Baye-siana. Los resultados se presentan gráficamente.Resultados: Se observan patrones de mortalidad por distintos ti-pos de cáncer que abarcan regiones en ambos países. Así, por ejemplo, se observa un exceso de riesgo de mortalidad por cáncer de esófago que se extiende por el norte de Portugal y Noroeste de España, tanto en mujeres como en hombres. O un patrón de exceso de riesgo por cáncer de mama en la suroeste de la península Ibérica incluyendo municipios de ambos países.Conclusiones/Recomendaciones: Existen patrones de mortalidad municipal por distintos tipos de cáncer que trascienden las fronteras entre España y Portugal sugiriendo la presencia de factores de riesgo comunes en ambos países.
- Impact of infant pneumococcal vaccination on pneumococcal pneumonia hospitalizations in older adultsPublication . Kislaya, Irina; Rodrigues, Ana Paula; Sousa-Uva, Mafalda; Gómez, Verónica; Gonçalves, Paulo; Froes, Filipe; Nunes, BaltazarPneumonia is an important cause of morbidity, mortality and expenditure of health resources. Since the introduction of conjugated pneumococcal vaccines (PCV) in infant immunization programs in 2000s, there is consistent evidence of pneumonia reduction in vaccinated children1. Limited data are available on indirect effect of infant immunization on pneumonia burden in unvaccinated population subgroups. This study aims to assess the indirect effect of the introduction of infant 7-valent (PCV7) and 13-valent (PCV13) pneumococcal conjugated vaccines on the pneumonia burden among adults aged 65 or more years in Portugal, comparing trends in Pneumococcal Pneumonia (PP) hospitalization rates before and after the introduction of the PCV7/PCV13.
- Mathematical Modelling of the Impact of Non-Pharmacological Strategies to Control the COVID-19 Epidemic in PortugalPublication . Caetano, Constantino; Morgado, Maria Luísa; Patrício, Paula; Pereira, João E.; Nunes, BaltazarIn this paper, we present an age-structured SEIR model that uses contact patterns to reflect the physical distance measures implemented in Portugal to control the COVID-19 pandemic. By using these matrices and proper estimates for the parameters in the model, we were able to ascertain the impact of mitigation strategies employed in the past. Results show that the March 2020 lockdown had an impact on disease transmission, bringing the effective reproduction number (R(t)) below 1. We estimate that there was an increase in the transmission after the initial lift of the measures on 6 May 2020 that resulted in a second wave that was curbed by the October and November measures. December 2020 saw an increase in the transmission reaching an R(t) = 1.45 in early January 2021. Simulations indicate that the lockdown imposed on the 15 January 2021 might reduce the intensive care unit (ICU) demand to below 200 cases in early April if it lasts at least 2 months. As it stands, the model was capable of projecting the number of individuals in each infection phase for each age group and moment in time.
- COVID-19 vaccine effectiveness among healthcare workers: a hospital-based cohort studyPublication . Gaio, Vânia; Santos, Ana João; Amaral, Palmira; Faro Viana, João; Antunes, Isabel; Pacheco, Vânia; Paiva, Artur; Pinto Leite, Pedro; Antunes Gonçalves, Lígia; Araújo, Lucília; Silva, Adriana; Matias Dias, Carlos; Kislaya, Irina; Nunes, Baltazar; Machado, AusendaObjectives: Healthcare workers (HCWs) were the first to be prioritised for COVID-19 vaccination. This study aims to estimate the COVID-19 vaccine effectiveness (VE) against SARS-CoV-2 symptomatic infection among HCWs in Portuguese hospitals. Design: Prospective cohort study. Setting and participants: We analysed data from HCWs (all professional categories) from three central hospitals: one in the Lisbon and Tagus Valley region and two in the central region of mainland Portugal, between December 2020 and March 2022. VE against symptomatic SARS-CoV-2 infection was estimated as one minus the confounder adjusted HRs by Cox models considering age group, sex, self-reported chronic disease and occupational exposure to patients diagnosed with COVID-19 as adjustment variables. Results: During the 15 months of follow-up, the 3034 HCWs contributed a total of 3054 person-years at risk, and 581 SARS-CoV-2 events occurred. Most participants were already vaccinated with a booster dose (n=2653, 87%), some are vaccinated with only the primary scheme (n=369, 12.6%) and a few remained unvaccinated (n=12, 0.4%) at the end of the study period. VE against symptomatic infection was 63.6% (95% CI 22.6% to 82.9%) for HCWs vaccinated with two doses and 55.9% (95% CI -1.3% to 80.8%) for HCWs vaccinated with one booster dose. Point estimate VE was higher for individuals with two doses taken between 14 days and 98 days (VE=71.9%; 95% CI 32.3% to 88.3%). Conclusion: This cohort study found a high COVID-19 VE against symptomatic SARS-CoV-2 infection in Portuguese HCWs after vaccination with one booster dose, even after Omicron variant occurrence. The small sample size, the high vaccine coverage, the very low number of unvaccinated individuals and the few events observed during the study period contributed to the low precision of the estimates.
- Investigação com base em múltiplas fontes de dados e as diferentes prioridades de investigação ao longo da emergência COVID-19Publication . Nunes, BaltazarSobre investigação com base em múltiplas fontes de dados e as diferentes prioridades de investigação ao longo da emergência COVID-19.
- AMOCAPE: atlas de mortalidade por cancro em Portugal e EspanhaPublication . Roquette, Rita; Sousa Uva, Mafalda; Nunes, Baltazar; Matias Dias, CarlosNesta sessão foram apresentados os principais resultados da investigação que tem sido desenvolvida no projecto AMOCAPE, na área da mortalidade por cancro na Península Ibérica. Os resultados integrarão o Atlas de Mortalidade por Cancro em Portugal e Espanha, 2003-2012, que será disponibilizado em 2020.
- Avaliação da época de vigilância ICARO - Mortalidade: 2022Publication . Silva, Susana; Torres, Ana Rita; Rodrigues, Ana Paula; Nunes, Baltazar; Neto, Mariana; Matias Dias, CarlosO objetivo deste trabalho foi o cálculo de estimativas de excessos de mortalidade potencialmente associados ao calor extremo no verão de 2022. Para isso analisámos apenas os períodos de calor extremo com potencial impacte na mortalidade identificados pelo Sistema ÍCARO, que decorreu entre 1 de maio e 30 de setembro de 2022.
- Health and economic impact of seasonal influenza mass vaccination strategies in European settings: A mathematical modelling and cost-effectiveness analysisPublication . Sandmann, Frank; van Leeuwen, Edwin; Bernard-Stoecklin, Sibylle; Casado, Itziar; Castilla, Jesús; Domegan, Lisa; Gherasim, Alin; Hooiveld, Mariëtte; Kislaya, Irina; Larrauri, Amparo; Levy-Bruhl, Daniel; Machado, Ausenda; Marques, Diogo; Martínez-Baz, Iván; Mazagatos, Clara; McMenamin, Jim; Meijer, Adam; Murray, Josephine; Nunes, Baltazar; O'Donnell, Joan; Reynolds, Arlene; Thorrington, Dominic; Pebody, Richard; Baguelin, MarcIntroduction: Despite seasonal influenza vaccination programmes in most countries targeting individuals aged ≥ 65 (or ≥ 55) years and high risk-groups, significant disease burden remains. We explored the impact and cost-effectiveness of 27 vaccination programmes targeting the elderly and/or children in eight European settings (n = 205.8 million). Methods: We used an age-structured dynamic-transmission model to infer age- and (sub-)type-specific seasonal influenza virus infections calibrated to England, France, Ireland, Navarra, The Netherlands, Portugal, Scotland, and Spain between 2010/11 and 2017/18. The base-case vaccination scenario consisted of non-adjuvanted, non-high dose trivalent vaccines (TV) and no universal paediatric vaccination. We explored i) moving the elderly to "improved" (i.e., adjuvanted or high-dose) trivalent vaccines (iTV) or non-adjuvanted non-high-dose quadrivalent vaccines (QV); ii) adopting mass paediatric vaccination with TV or QV; and iii) combining the elderly and paediatric strategies. We estimated setting-specific costs and quality-adjusted life years (QALYs) gained from the healthcare perspective, and discounted QALYs at 3.0%. Results: In the elderly, the estimated numbers of infection per 100,000 population are reduced by a median of 261.5 (range across settings: 154.4, 475.7) when moving the elderly to iTV and by 150.8 (77.6, 262.3) when moving them to QV. Through indirect protection, adopting mass paediatric programmes with 25% uptake achieves similar reductions in the elderly of 233.6 using TV (range: 58.9, 425.6) or 266.5 using QV (65.7, 477.9), with substantial health gains from averted infections across ages. At €35,000/QALY gained, moving the elderly to iTV plus adopting mass paediatric QV programmes provides the highest mean net benefits and probabilities of being cost-effective in all settings and paediatric coverage levels. Conclusion: Given the direct and indirect protection, and depending on the vaccine prices, model results support a combination of having moved the elderly to an improved vaccine and adopting universal paediatric vaccination programmes across the European settings.
- Monitorização da Mortalidade 2020Publication . Torres, Ana Rita; Silva, Susana; Nunes, Baltazar; Matias Dias, Carlos; Rodrigues, Ana PaulaA monitorização da mortalidade por todas as causas é uma ferramenta útil na identificação de fenómenos de saúde, ou desastres de elevada gravidade ou de elevada incidência na população e impacto na mortalidade. Em Portugal, a monitorização da mortalidade é realizada, desde 2007, pelo Departamento de Epidemiologia do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, permitindo estimar impactos associados a diversos eventos tais como: epidemias de gripe, COVID-19, períodos de temperaturas extremas e acidentes. Este relatório tem como objetivos, descrever a evolução da mortalidade por todas as causas durante o ano de 2020 [semana 01/2020 (30 de dezembro de 2019 a 05 de janeiro de 2020) à semana 53/2020 (28 de dezembro de 2020 a 03 de janeiro de 2021)], bem como identificar e analisar os períodos de excesso de mortalidade por todas as causas ocorridos. No período em estudo, foram registados 125.770 óbitos em Portugal, tendo sido identificados quatro períodos de excesso de mortalidade a nível nacional (totalizando 8.073 óbitos em excesso): 1. 23 março a 12 abril: 1.057 óbitos em excesso; temporalmente coincidente com a primeira onda pandémica de COVID-19; 2. 25 a 31 de maio: 363 óbitos em excesso; temporalmente coincidente com um período de temperaturas elevadas, embora este não tenha sido identificado pelo sistema de vigilância ÍCARO como um período de calor extremo com potenciais impactos na mortalidade; 3. 06 julho a 02 agosto: 2.199 óbitos em excesso; temporalmente coincidente com um período de calor extremo, identificado pelo sistema de vigilância ÍCARO; 4. 26 outubro a 03 de dezembro: 4.454 óbitos em excesso; temporalmente coincidente com a segunda onda pandémica de COVID-19. Este período de excesso de mortalidade ainda não terminou à data da publicação deste relatório. Estes períodos de excesso de mortalidade a nível nacional foram observados em todas as regiões do país, à exceção da Região Autónoma da Madeira. Ocorreram, ainda, excessos de mortalidade a nível regional durante a epidemia de gripe de 2019/2020, nas regiões Norte, Centro e Algarve que não se traduziram em excessos de nível nacional. De modo análogo, ocorreram excessos de 3 mortalidade regionais nas semanas contíguas aos períodos de calor extremo verificados em 2020, em particular, no Algarve, Alentejo e Lisboa e Vale do Tejo que não se traduziram em excessos de mortalidade a nível nacional. Observaram-se excessos de mortalidade acima dos 45 anos, existindo um gradiente crescente com a idade, quer em relação à magnitude, quer em relação ao número de períodos em excesso de mortalidade. Sublinha-se que nos anos anteriores em vigilância,raramente foram observados excessos de mortalidade abaixo dos 65 anos, pelo que o excesso observado entre os 45 e 64 anos de idade no final do ano de 2020, e que se estende para o início de 2021, é um sinal de importante impacto na mortalidade. Dada a coincidência temporal, podemos concluir que a maioria dos períodos de excessos de mortalidade identificados quer a nível nacional, quer a nível regional, terão estado potencialmente associados a fenómenos amplamente conhecidos por poderem ter impactos na mortalidade, particularmente, as epidemias de gripe e COVID-19 e os períodos de calor extremo. Não podemos, no entanto, excluir que a variação da mortalidade observada durante os períodos de calor de 2020 não tenha sido indiretamente afetada pela pandemia de COVID-19 (por uma possível menor utilização e acesso aos serviços de saúde). No entanto, em relatório anterior estimou-se que o excesso de mortalidade observado durante o período de calor extremo de julho teve a magnitude esperada para um período de calor extremo da sua intensidade. Por fim, referira-se que desde o início da epidemia de COVID-19 em Portugal, a mortalidade por todas as causas teve um acréscimo não significativo de 4 % em relação à média de anos anteriores, mesmo nos períodos sem excessos de mortalidade, o que se traduziu num aumento do risco de morrer na população com 45 e mais anos durante o ano de 2020, quando comparado com o observado nos 5 anos anteriores.