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- The Functional Landscape Of Coding Variation In The Familial Hypercholesterolemia Gene LDLRPublication . Tabet, Daniel R.; Coté, Atina G.; Lancaster, Megan C.; Weile, Jochen; Rayhan, Ashyad; Fotiadou, Iosifina; Kishore, Nishka; Li, Roujia; Kuang, Da; Knapp, Jennifer J.; Carrero, Carmela Serio; Taverniti, Olivia; Axakova, Anna; Castelli, Jack M. P.; Islam, Mohammad Majharul; Sowlati-Hashjin, Shahin; Gandhi, Aanshi; Maaieh, Ranim; Garton, Michael; Matreyek, Kenneth; Fowler, Douglas M.; Bourbon, Mafalda; Pfisterer, Simon G.; Glazer, Andrew M.; Kroncke, Brett M.; Parikh, Victoria N.; Ashley, Euan A.; Knowles, Joshua W.; Claussnitzer, Melina; Cirulli, Elizabeth T.; Hegele, Robert A.; Roden, Dan M.; MacRae, Calum A.; Roth, Frederick P.Variants in the familial hypercholesterolemia gene -the most important genetic driver of cardiovascular disease-can raise circulating low-density lipoprotein (LDL) cholesterol concentrations and increase the risk of premature atherosclerosis. Definitive classifications are lacking for nearly half of clinically encountered missense variants, limiting interventions that reduce disease burden. Here, we tested the impact of ~17,000 (nearly all possible) missense coding variants on both LDLR cell-surface abundance and LDL uptake, yielding sequence-function maps that recapitulate known biochemistry, offer functional insights, and provide evidence for interpreting clinical variants. Functional scores correlated with hyperlipidemia phenotypes in prospective human cohorts and augmented polygenic scores to improve risk inference, highlighting the potential of this resource to accelerate familial hypercholesterolemia diagnosis and improve patient outcomes.
- Uma amostra, três avaliações: Análise dos resultados em Química Clínica do PNAEQPublication . Batista, Ana; Correia, Helena; Cardoso, Ana; das Neves Pereira da Silva, Susana; Faria, Ana PaulaIntrodução: O laboratório clínico desempenha um papel fundamental na prestação de cuidados de saúde, ao fornecer informação analítica fiável e clinicamente relevante. Para garantir a qualidade dos resultados, a participação em programas de Avaliação Externa da Qualidade (AEQ) é essencial, permitindo aos laboratórios monitorizar continuamente o seu desempenho através da comparação interlaboratorial. Objetivo: Este estudo teve como objetivo avaliar o desempenho dos laboratórios participantes do Programa Nacional de Avaliação Externa da Qualidade (PNAEQ) em Química Clínica, de uma amostra controlo, em três avaliações diferentes, na determinação dos parâmetros: albumina, creatinina, glucose, potássio e sódio. Metodologia: Uma mesma amostra controlo integrada no programa de Química Clínica do PNAEQ, foi enviada duas vezes, em 2024 no mês de abril (ensaio 3 e 5) e em 2025, em fevereiro (ensaio 1), para a determinação de vários parâmetros, dos quais foram selecionados para este estudo a albumina, creatinina, glucose, potássio e sódio. A análise estatística dos resultados foi efetuada com recurso ao MS Excel, com o cálculo da média e do desvio padrão (DP), para identificação e exclusão dos resultados outliers (valores superiores à média ± 2 DP). Foram recalculados os indicadores, média e DP, e determinado o coeficiente de variação (CV%), para cada um dos parâmetros em estudo. A análise do índice de desvio (ID/z-score) apenas foi efetuada para os laboratórios que participaram nas 3 avaliações. Resultados: A percentagem de participação média para todos os parâmetros foi de 90%, variando entre 73 a 100% nas três avaliações, tendo sido a menor percentagem (73%) verificada na segunda avaliação para o parâmetro albumina. Após a exclusão dos outliers, a creatinina foi o parâmetro que apresentou maior percentagem de exclusão (média 8%) e que um CV% maior (6,88-7,04-7,08) seguida da albumina (4,20-4,71-5,21), glucose (2,94-3,11-3,53), potássio (2,23-2,83-3,49) e por último do sódio (1,67-2,55-1,81). No cálculo do ID foram considerados 24 resultados para a albumina, 26 para a creatinina e para o sódio, 29 para a glucose e 27 para o potássio. Os participantes não obtiveram valores insatisfatórios (ID >3) para a albumina, a creatinina e o sódio, apresentando a glucose e o potássio um valor de ID insatisfatório na 3ª avaliação, em diferentes participantes. Os parâmetros que obtiveram a percentagem mais elevada de ID excelente (0 < ID ≤ 0,5) e bom (0,5 < ID ≤ 2) foram a creatinina e a glucose (média de 44,87% e 52,56% (97%)); média de 42,53% e 54,02% (97%) respetivamente), seguidos do potássio (média de 43,21% e 51.85% (95%)) da albumina (média de 40,28% e 54,17% (94,44%)) e do sódio (média de 43,59% e 50,00% (94%)). Conclusões: Dos parâmetros avaliados, a creatinina apresentou o CV% maior, e todos os parâmetros, com a exceção do sódio, apresentaram uma tendência de aumento do CV% nas três avaliações. Os laboratórios que participaram nas três avaliações obtiveram um bom desempenho, embora a glucose e o potássio tenham apresentado o maior número de ID insatisfatórios. Prevê-se a repetição deste estudo, numa mesma amostra com concentrações diferentes às do presente estudo, analisada em três ou mais avaliações.
- A Multiplex Biomarker panel: A powerful tool for LSDs DiagnosisPublication . Neiva, Raquel; da Silva Gaspar, Paulo Jorge Miranda; Sousa e Silva, Lisbeth Elena; Gonçalves, Isabel; Ferreira, Sara; Diogo, Luisa; Vilarinho, LauraIntrodução / Descrição do Caso: Lysosomal Storage Disorders (DLSs) are a set of rare, chronic and multisystemic pathologies with a variable mode of presentation and severity. Acid sphingomyelinase deficiency (ASMD), historically known as Niemann–Pick disease (NPD) types A, A/B, and B, is a rare, progressive, potentially fatal lysosomal storage disease caused by pathogenic variants in SMPD1 gene. The disease manifestations frequently involve hepatosplenomegaly with progressive organ dysfunction, interstitial lung disease, and bleeding. The cellular damage caused by sphingomyelin accumulation can be irreversible and can lead to life-threatening complications with reduced life expectancy. ASMD can be underestimate and the diagnostic odyssey arise from an overlap in symptomology with other diseases, including primary hepatic disease, Gaucher disease, NPC, and lysosomal acid lipase deficiency.
- SCCS - Scientific Opinion on Tea Tree Oil (CAS/EC No. 68647-73-4 /285-377-1)Publication . Scientific Committee on Consumer Safety (SCCS)The SCCS concludes the following: 1. In light of the data provided and taking under consideration the possible classification as ‘Repr.1B’ under Regulation (EC) No 1272/2008 (CLP Regulation) and the conditions laid out in Article 15 (2) (d) of the Regulation (EC) No 1223/2009, does the SCCS consider TTO safe when used as an anti-seborrheic and anti-microbial agent in rinse-off and leave-on cosmetic products up to the maximum concentrations provided by the applicant? The SCCS considers the use of Tea Tree Oil (TTO) as an anti-seborrheic and anti-microbial agent safe in four defended product types - up to the maximum concentration of 2.0% in shampoo, 1.0% in shower gel, 1.0% in face wash and 0.1% in face cream. The assessment has considered all available data, a possible classification as ‘Repr.1B’ under Regulation (EC) No 1272/2008, the conditions laid out in Article 15 (2) (d) of the Regulation (EC) No 1223/2009 including the aggregated exposure from the defended cosmetic products and non-cosmetics uses of TTO. This Opinion is only applicable to: • TTO with chemical composition that conforms to the updated International Standard (ISO 4730:2017) in the defended final cosmetic products. • the use of TTO in the defended dermally applied cosmetic products exclusively for adults, and not in aerosolised or sprayable delivery formats that may give rise to inhalation exposure of the consumer to TTO through airborne mist/droplets of the TTO-containing products. 2. Alternatively, what is according to the SCCS, the maximum concentration considered safe for use of TTO in cosmetic products? 3. Does the SCCS have any further scientific concerns regarding the use of TTO in cosmetic products? Based on the data provided, TTO is a moderate skin sensitiser. The submission did not provide any data on the stability of TTO under the conditions of storage and use. Since the chemical composition of TTO may change due to exposure to light, heat, air and /or moisture, it is not clear how TTO will be stabilised in the final cosmetic products to prevent degradation/transformation of the components. The SCCS is therefore of the opinion that stability of TTO must be maintained in the final cosmetic products so that the components remain within the specifications of the updated ISO 4730:2017 standard. The new version of ISO standard (ISO 4730:2025), which relates to enantiomeric distribution parameters for α-terpineol in the essential oil of Melaleuca, terpinen-4-ol type (tea tree oil), should also be taken into account. The SCCS mandate does not address environmental aspects. Therefore, this assessment has not covered the safety of TTO for the environment.
- Hemocromatose - causa genética ou adquirida?Publication . Faustino, PaulaNesta comunicação oral apresentam-se e discutem-se as possíveis causas responsáveis pela a hemocromatose adquirida e genética e os seus diversos tipos. Explicam-se os principias mecanismos de absorção e reciclagem do ferro no Homem e a atuação da principal hormona responsável pela regulação dos níveis de ferro no organismo. Apresentam-se os biomarcadores bioquímicos usados no diagnóstico da doença e os métodos moleculares usados para caracterizar os genótipos de risco. Debate-se a penetrância e elevada variabilidade da doença e os seus fatores modificadores. Apresenta-se trabalho de investigação realizado no Departamento de Genética Humana do INSA no âmbito destas patologias.
- Hemoglobinopatias - InvestigaçãoPublication . Faustino, PaulaNesta comunicação oral apresentam-se as recomendações da OMS para combater a drepanocitose nos países Africanos e o papel da investigação para compreender os mecanismos da doença e desenvolver estratégias terapêuticas para a combater. Apresentam-se os fatores genéticos modificadores da doença, nomeadamente o nível de hemoglobina fetal e como esta pode ser manipulada farmacologicamente para benefício do doente. Mostram-se e discutem-se os resultados dos trabalhos de investigação de âmbito colaborativo desenvolvidos entre o INSA e algumas Instituições de Saúde Angolanas na área dos fatores genéticos modificadores das manifestações da drepanocitose. Discutem-se os tratamentos sintomáticos e os curativos, incluindo a terapia génica, e os obstáculos às suas utilizações em África.
- Find Project: Results of 8 YearsPublication . da Silva Gaspar, Paulo Jorge Miranda; Neiva, Raquel; Sousa e Silva, Lisbeth Elena; Guimarães, Fábio; Diogo, Luisa; Ferreia, Ana Cristina; Miranda, Ana; Antunes, Diana; Louro, Pedro; Ribeiro, Sara; Garcia, Paula; Rodrigues, Esmeralda; Campos, Teresa; Janeiro, Patrícia; Sousa, Sérgio; Ferreira, Sara; Silva, Carmen; Lopes, Altina; Pereira, Cristina; Nogueira, Célia; Alves, Sandra; Leão Teles, Elisa; Vilarinho, LauraIntrodução e Objectivos: Mucopolysaccharidoses (MPSs) are a group of Lysosomal Storage Disorders with multisystem involvement, presenting different degrees of severity and evolution. At early disease stages and late onset forms, diagnosis can be postponed for years or even missed. The FIND PROJECT was designed to claim awareness to the red flags of MPSs at pediatric age and to provide an useful tool for physicians to diagnose these pathologies, since most of them are amenable to enzyme replacement therapy.
- A new method for the identification of mucopolysaccharidosis and oligosaccharidosisPublication . da Silva Gaspar, Paulo Jorge Miranda; Neiva, Raquel; Sousa e Silva, Lisbeth Elena; Vilarinho, LauraIntrodução e Objectivos: Lysosomal storage disorders are a group of rare diseases that affect approximately 1 in 4,000 live births in Portugal (Pinto et al , 2004). They are characterized by multisystemic involvement and a wide range of phenotypical presentations, often overlapping with other diseases. As a result, many patients experience a lengthy process of seeking a correct diagnosis, known as the "diagnostic odyssey". To address this challenge, a new tandem mass spectrometry method has been developed for the urinary identification of both oligosaccharides and mucopolysaccharides(MPS).
- Rastreio neonatal da drepanocitose: prevalência ao nascimento de 1: 2 381 RNPublication . Rodrigues, Diogo; Marcão, Ana; Lopes, Maria de Lurdes soares; Guimarães, Fábio; Vilarinho, LauraIntrodução e Objetivos: A drepanocitose é uma das patologias monogénicas mais comuns e graves a nível mundial, sendo atualmente considerada um problema de saúde pública na Europa. Trata-se de uma doença hereditária, com transmissão autossómica recessiva, na qual os doentes apresentam uma variante estrutural anormal de hemoglobina – HbS. Com este trabalho pretendemos apresentar a prevalência ao nascimento da drepanocitose em Portugal. Metodologia: Foram rastreados para a drepanocitose 324 077 Recém-Nascidos (RN), em duas fases distintas: Fase I (05/2021 - 01/2022) 24 130 RN exclusivamente dos distritos de Lisboa e Setúbal; Fase II (02/2022 - 07/2025) 299 947 RN de todo o Português. O perfil de hemoglobinas foi estudado pelo método da eletroforese capilar, a partir de amostras de sangue seco colhidas em cartão de Guthrie, entre o 3.º e o 6.º dia de vida do RN. Resultados: No total foram identificados 152 casos de drepanocitose dos quais 135 eram homozigóticos (HbSS) e 17 heterozigóticos compostos (HbSC). Todos os doentes foram reportados a um Centro de Tratamento (CT) para confirmação e avaliação clínica. A prevalência ao nascimento de drepanocitose no nosso país é de 1:2 381 RN. Além do casos de drepanocitose, foram também identificados e reportados para CT mais 15 casos de outras hemoglobinopatias: 3 β-talassémia major, 8 HbEE, 3 HbCC e 1 HbDD. Conclusões: Estes resultados evidenciam a crescente prevalência da drepanocitose em Portugal, alinhando-se com o panorama europeu, e que parece dever-se aos fluxos migratórios mais recentes. A inclusão do rastreio neonatal da drepanocitose no painel de doenças do Programa Nacional de Rastreio Neonatal, em 2023, comprova a importância desta patologia no nosso país.