Browsing by Author "Santos, Ana Sofia"
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- Development and testing of microsatellite loci for the study of population genetics of Ixodes ricinus Linnaeus, 1758 and Ixodes inopinatus Estrada-Peña, Nava & Petney, 2014 (Acari: Ixodidae) in the western Mediterranean regionPublication . Velez, Rita; De Meeûs, Thierry; Beati, Lorenza; Younsi, Hend; Zhioua, Elyes; Antunes, Sandra; Domingos, Ana; Ataíde Sampaio, Daniel; Carpinteiro, Dina; Moerbeck, Leonardo; Estrada-Peña, Agustin; Santos-Silva, Maria Margarida; Santos, Ana SofiaIxodes ricinus is an important vector of several human and veterinary infectious agents. Its wide geographical distribution and permissive feeding behaviour have prompted earlier studies on its population genetics. Results were, nevertheless, not conclusive. Furthermore, no research has fully focused on the south-western distribution range of I. ricinus, where exchanges between European and North African populations are more likely to occur. The presence of an additional species, Ixodes inopinatus, in the area further confuses the topic, as the two species are hard to differentiate morphologically. The present work describes the testing of microsatellite markers previously described for I. ricinus using Portuguese and Tunisian tick populations of both species. In addition, new microsatellite loci were developed to complement the available marker toolbox. Loci showed different amplification successes across subpopulations, with Tunisian DNA less readily amplified. Altogether, 15 loci were considered suitable for genetic analyses of Portuguese subpopulations, 10 for Tunisian samples, and seven, common to both populations, were considered to be informative at the inter-continental level. A preliminary analysis of both datasets revealed two isolated populations, which can correspond to two different species. Furthermore, Tunisian specimens identified by sequencing of 16S rDNA as having I. ricinus or I. inopinatus sequence profiles all clustered together in one single population using the proposed microsatellites. This confirms that taxonomic decisions based only on 16S rRNA gene sequencing can be misleading. The application of the proposed set of microsatellite markers to a larger sample, representative of the south-western Ixodes’ distribution range, will be crucial to clarify the distribution of both species.
- Fatal Case of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever, Portugal, 2024Publication . Zé-Zé, Líbia; Nunes, Cristina; Sousa, Micaela; De Sousa, Rita; Gomes, Carla; Santos, Ana Sofia; Alexandre, Rui T.; Amaro, Fátima; Loza, Tiago; Blanco, Miriam; Alves, MJ; Tiago Loza, Miriam Blanco, Maria J AlvesWe report a fatal case of Crimean-Congo hemorrhagic fever in Portugal. An 83-year-old man, initially suspected of having Mediterranean spotted fever, was later confirmed to have Crimean-Congo hemorrhagic fever by the detection of viral genome in the patient's serum and the presence of specific IgM antibodies.
- Febre Q: do diagnóstico à investigação ecoepidemiológica de Coxiella burnetii no contexto da infeção humanaPublication . Santos, Ana SofiaObjetivo: A escassa informação disponível sobre o panorama etiológico e padrão epidemiológico nacional da febre Q, face ao seu crescente interesse no contexto europeu, levou à submissão de um projeto de investigação sobre o tema, que teve início em abril de 2011 com o apoio da Fundação para a Ciência e a Tecnologia (refª PTDC/SAUSAP/115266/2009). Constituíram objetivos principais do estudo: 1) analisar os casos de febre Q para melhor caraterizar o contexto epidemiológico e clínico da doença aguda e crónica; 2) caraterizar a diversidade genética do agente etiológico como potencial fator de virulência; 3) obter uma coleção de isolados de C. burnetii da população portuguesa e caraterizar o padrão de suscetibilidade aos antibióticos; 4) averiguar potenciais fatores de risco associados à transmissão de C. burnetii em Portugal. Neste artigo são resumidos os principais resultados obtidos até ao momento.
- Genetic variants in the IFNGR2 locus associated with severe chronic Q feverPublication . David, Susana; Castro, Liliana; Duarte, Elsa; Gaspar, Ulisses; Rodrigues, Maria Rosário da Costa; Cueto-Rojo, Maria Vanessa; Mendonça, Joana; Ferrão, José; Machado, Miguel; Poças, José; Lavinha, João; Vieira, Luís; Santos, Ana Sofia; ElsevierQ fever is a highly contagious zoonosis capable of causing large outbreaks of important health and economic consequences. Host genetic factors are believed to influence the development of severe chronic Q fever following the infection by the etiological agent, Coxiella burnetii. Targetted next generation sequencing (NGS) was performed in a case-control genetic association study on 53 confirmed Q fever cases, including 38 compatible with acute and 15 with chronic disease, and 29 samples from the general Portuguese population. Four SNPs in the IFNGR2 locus, rs78407108 G > A, rs17879956 C > T, rs7277167 C > T, and rs9974603 C > A, showed a statistically significant association to chronic Q fever, resisting the Bonferroni correction. These belonged to haplotypes significantly associated with chronic Q fever. The individual SNPs are referenced in the GTEx database as possible eQTLs. Given the direct bearing of IFNGR2 on IFN-γ signaling, the possible involvement of the associated variants with higher IFNGR2 expression could be in line with observations suggesting that IFN-γ production in chronic Q fever patients is significantly higher than in healthy controls. Further investigations are required to clarify the role of IFNGR2 signaling in association with chronic Q fever.
- Genotyping of Coxiella burnetii in sheep and goat abortion samplesPublication . Chochlakis, Dimosthenis; Santos, Ana Sofia; Giadinis, Nektarios D.; Papadopoulos, Dimitrios; Boubaris, Leonidas; Kalaitzakis, Emmanouil; Psaroulaki, Anna; Kritas, Spyridon K.; Petridou, Evanthia I.Background: Q fever, caused by Coxiella burnetii, is a zoonosis that presents a worldwide distribution and affects both humans and animals. The route of dispersal of the pathogen by ruminants into the environment usually involves stages of abortion and parturition, nevertheless the agent can, also, be detected in other animal samples. Therefore it is considered as important in terms of proper diagnosis, as well as, for epidemiology and surveillance purposes, to genotype the pathogen. The aim of the current study was to investigate the presence of different genotypes of the agent in animals that had suffered from abortion during a two-year survey in Greece. Results: Sixty nine tissue samples (37 stomach contents, 11 liver samples, 21 cotyledons) were collected from 59 abortion cases in sheep (N = 45) and goats (N = 14) from 65 farms at eight different areas of Greece. Samples were screened by qPCR and positive ones were further genotyped using a 10-locus multiple loci (ms 1, 3, 7, 12, 20, 21, 22, 26, 30 and 36) variable number of tandem repeat analysis (MLVA) method. Three genotypes were identified in sheep (A, B, C). Samples representing each of the obtained MLVA profile were further used for MST genotyping. Ten spacers (Cox 2, 5, 6, 18, 20, 22, 37, 51, 56 and 57) were amplified. A close relatedness among the identified MLVA genotypes was confirmed since they all belonged to MST group 32. Conclusions: The current study introduces into the aspect of genotyping of C. burnetii in Greece. Further studies are needed to explore the presence of more genotypes, to associate the genotypes circulating in the animal and tick population with those causing human disease in order to further expand on the epidemiological aspects of the pathogen.
- A importância da monitorização da Rede de Vigilância de Vetores REVIVE: de novos mosquitos e velhas carraças a novas ameaças em saúde pública (2011-2020)Publication . Alves, Maria João; Santos, Ana Sofia; Osório, Hugo; Sousa, Rita de; Zé-Zé, Líbia; Lopes de Carvalho, Isabel; Amaro, Fátima; Silva, Manuel; Núncio, Maria Sofia; Equipa REVIVEO programa REVIVE (Rede de Vigilância de Vetores) resulta de colaboração entre a Direção-Geral da Saúde, as Administrações Regionais de Saúde do Algarve, Alentejo, Centro, Lisboa e Vale do Tejo e Norte, a Direção Regional da Saúde da Madeira, a Direção Regional da Saúde dos Açores e o Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge. No âmbito do REVIVE é realizada a vigilância entomológica de mosquitos (Culicidae), carraças (Ixodidae) e flebótomos (Psychodidae) a nível nacional. O ano de 2020 representou o 13.º ano do programa REVIVE (2008-2020). Nesta publicação apresentam-se, de uma forma resumida, os resultados da vigilância de mosquitos e carraças realizada em 2020, e no período 2011- -2019, em todas as regiões do país, dando ênfase aos principais riscos em saúde pública em Portugal. Relativamente aos mosquitos destaca-se a presença dos mosquitos exóticos/invasores Aedes aegypti na Madeira e Aedes albopictus no norte e sul do continente e o risco da ocorrência de casos autóctones de dengue, Zika e chikungunya transmitidos por estes vetores. Na vigilância de ixodídeos, salienta-se o risco de casos de febre escaro-nodular e borreliose de Lyme e, a cada vez mais provável, ocorrência de casos de febre hemorrágica Crimeia Congo transmitida por carraças e descrita nos últimos anos em Espanha junto da fronteira com Portugal.
- Ixodídeos removidos de humanos e agentes infeciosos detetados no âmbito da Rede de Vigilância de Vetores (REVIVE), 2011-2015Publication . Silva, Maria Margarida Santos; Carvalho, Isabel Lopes de; Santos, Ana Sofia; Núncio, Maria Sofia; Sousa, Rita de; Equipa REVIVEA Rede de Vigilância de Vetores REVIVE – Ixodídeos foi desenvolvida em Portugal para vigiar e aumentar o conhecimento sobre as espécies de ixodídeos presentes e dos agentes patogénicos a estes associados. Esta rede foi estabelecida em 2011 apresentando este estudo os resultados obtidos nos primeiros cinco anos de vigilância nas carraças removidas de humanos, relativamente às espécies ixodológicas, sua abundância, sazonalidade e presença de Rickettsia e Borrelia.
- Pneumonias Atípicas: diagnósticoPublication . Santos, Ana Sofia
- Rede de Vigilância de Vetores (REVIVE): ixodídeos e bactérias patogénicas detetadas em Portugal continental durante o ano de 2019Publication . Núncio, Maria Sofia; Santos, Ana Sofia; Lopes de Carvalho, Isabel; Sousa, Rita de; Osório, Hugo; Santos-Silva, Maria Margarida; Alves, Maria João; Equipa REVIVEA Rede de Vigilância de Vetores (REVIVE) resulta da colaboração entre instituições do Ministério da Saúde (Direção-Geral da Saúde, Administrações Regionais de Saúde, Instituto dos Assuntos Sociais e da Saúde da Madeira, Direção Regional de Saúde dos Açores e Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge). A Rede divide-se em duas vertentes, REVIVE-mosquitos e REVIVE-carraças. Neste artigo apresentam-se, de forma resumida, os resultados obtidos em 2019 no âmbito do REVIVE- -carraças. Este programa, que existe há nove anos, tem como principais objetivos monitorizar a atividade de artrópodes hematófagos; caracterizar as espécies e sua ocorrência sazonal; identificar agentes patogénicos importantes em saúde pública, a densidade dos vetores, o nível de infeção e monitorizar a introdução de espécies exóticas. Das atividades desenvolvidas em 2019, destaca-se: a participação das cinco Administrações Regionais de Saúde que realizaram colheitas de carraças em 166 concelhos; nos 2409 ixodídeos colhidos não foi identificada a presença de espécies exóticas; em 982 carraças foi pesquisada a presença de borrélias e rickettsias, tendo sido observada a prevalência média de 2% e 22%, respetivamente, sobretudo em carraças colhidas a parasitar humanos. O REVIVE-carraças continua a contribuir para um conhecimento sistemático da fauna de ixodídeos de Portugal, e do seu potencial papel de vetor, constituindo uma componente dos programas de vigilância epidemiológica indispensável à avaliação do risco de transmissão de doenças potencialmente graves.
- REVIVE (Rede Nacional de Vigilância de Vetores), 2008-2014Publication . Alves, M.J.; Santos-Silva, M.M.; Osório, Hugo; Carvalho, Isabel Lopes de; Zé-Zé, Líbia; Sousa, Rita; Amaro, Fátima; Santos, Ana Sofia; Núncio, Sofia; Equipa REVIVEApresentar os resultados do programa REVIVE (Rede de Vigilância de Vetores), relativos aos anos 2008-2014.