Browsing by Author "Lopo, Sílvia"
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- An Overview of Monkeypox Virus Detection in Different Clinical Samples and Analysis of Temporal Viral Load DynamicsPublication . Cordeiro, Rita; Pelerito, Ana; de Carvalho, Isabel Lopes; Lopo, Sílvia; Neves, Raquel; Rocha, Raquel; Palminha, Paula; Verdasca, Nuno; Palhinhas, Cláudia; Borrego, Maria José; Manita, Carla; Ferreira, Idalina; Bettencourt, Célia; Vieira, Patrícia; Silva, Sónia; Água-Doce, Ivone; Roque, Carla; Cordeiro, Dora; Brondani, Greice; Santos, João Almeida; Martins, Susana; Rodrigues, Irene; Ribeiro, Carlos; Núncio, Maria Sofia; Gomes, João Paulo; Batista, Fernando da ConceiçãoMpox is a zoonotic disease caused by the Monkeypox virus (MPXV), and since May 2022, tens of thousands of cases have been reported in non-endemic countries. We aimed to evaluate the suitability of different sample types for mpox diagnostic and assess the temporal dynamics of viral load. We evaluated 1914 samples from 953 laboratory-confirmed cases. The positivity rate was higher for lesion (91.3%) and rectal swabs (86.1%) when compared with oropharyngeal swabs (69.5%) and urines (41.2%), indicating higher viral loads for the former. Supporting this, lesion and rectal swabs showed lower median PCR C values (C = 23 and C = 24), compared to oropharyngeal swabs and urines (C = 31). Stable MPXV loads were observed in swabs from lesions up to 30 days after symptoms onset, contrasting with a considerable decrease in viral load in rectal and oropharyngeal swabs. Overall, these results point to lesion swabs as the most suitable samples for detecting MPXV in the 2022-2023 multicountry outbreak and show comparable accuracy to rectal swabs up to 8 days after symptoms onset. These findings, together with the observation that about 5% of patients were diagnosed through oropharyngeal swabs while having negative lesions, suggest that multisite testing should be performed to increase diagnostic sensitivity.
- O Biólogo na Saúde - Análises ClínicasPublication . Lopo, SílviaA área das análises clínicas tem sofrido nos últimos tempos uma importante evolução, quer ao nível da abordagem diagnóstica, quer à introdução e implementação de novas metodologias. O Biólogo profissional do ramo de laboratório deverá ter o dever e a competência necessários ao desempenho das suas tarefas de forma excelente, com base na permanente atualização da formação nas áreas funcionais consideradas fundamentais em análises clínicas e na adequação das suas capacidades à multidisciplinaridade com que os profissionais deste ramo de laboratório se defrontam diariamente, seguros de que o objetivo final do seu trabalho é a obtenção de resultados fiáveis e de qualidade reconhecida pelos pares, tendo em vista o apoio ao diagnóstico clínico e o completo esclarecimento das respetivas patologias. O título de Especialista de análises clínicas ajuda o biólogo profissional de saúde na aquisição e valorização destas competências e encontra-se alinhado com as competências exigidas pela Associação Europeia para a Análises Clínicas. Para o efeito, vão ser dadas as orientações necessárias para o pedido de atribuição do Título de Especialista em análises clínicas – Ramo de Laboratório.
- Challenging measles case definition: three measles outbreaks in three Health Regions of Portugal, February to April 2018Publication . Augusto, Gonçalo Figueiredo; Cruz, Diogo; Silva, Andreia; Pereira, Natália; Aguiar, Bárbara; Leça, Ana; Serrada, Elisabete; Valente, Paula; Fernandes, Teresa; Guerra, Fernando; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Lopo, Sílvia; Cordeiro, Rita; Sáez-López, Emma; Neto, Maria; Nogueira, Paulo Jorge; Freitas, GraçaWe report three simultaneous measles outbreaks with 112 confirmed cases in three Health Regions of Portugal, from February to April 2018. The mean age of cases was 30 years, 79% worked in a healthcare setting and 87% were vaccinated. Genotype B3 was identified in 84 cases from the three outbreaks. Primary cases in each outbreak were imported. Several cases presented with modified measles, highlighting the importance of rethinking the measles case definition for vaccinated cases.
- Citomegalovírus: análise retrospetiva de casos suspeitos de infeção do sistema nervoso central, diagnosticados entre 2010 e 2014Publication . Lopo, Sílvia; Reis, Tânia; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Furtado, CristinaEste estudo tem como objetivo descrever as características demográficas e o quadro clínico e imunitário de doentes com suspeita de infeção viral neurotrópica e analisar a frequência das infeções por CMV nas patologias do SNC, cujo diagnóstico foi confirmado no Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) entre janeiro de 2010 e abril de 2014.
- CMV and HCV infections in HIV/non-HIV mothers and newborns: prevalence, frequency and risk factorsPublication . Lopo, Sílvia; Pereira, Maria Amável; Mendonça, Joana; Vinagre, Elsa; Reis, Tânia; Cordeiro, Dora; Almeida, Catarina; Água-Doce, Ivone; Manita, Carla; Palminha, Paula; Pádua, Elizabeth; Paixão, Maria Teresa; Carreiro, Helena; Barroso, Rosalina; Campos, Teresa; Marques, TâniaThe incidence of HIV infections in gestational age is an important Public Health issue as are concerns about co-infection with opportunistic viruses, such as CMV/HCV. Several authors refer higher ratios of congenital CMV infection in children born to HIV infected mother than in uninfected. In the case of HCV, perinatal transmission increases in cases of mothers co-infected with HIV. Aims:To study CMV/HCV infection/co-infection in HIV/non-HIV women and their newborns between 2006-2010, according to epidemiological, laboratory and clinical data; to evaluate frequency of CMV/HIV/HCV maternal-fetal transmission and analyse risk factors for infections. Methods:Plasma and/or urine of 137 HIV and 140 non-HIV women, attending a Lisbon Hospital and their 140 newborns were analysed at NIH. HIV-1 and/or HIV-2 proviral DNA nested-PCR was performed on HIV mothers and their newborn’s plasma. Maternal plasma was screened for CMV and HCV antibodies; RNA determination, genotyping and viral load were performed on women with HCV antibodies, their newborn’s plasma was also screened for HCV. Newborn’s urine was inoculated for CMV detection. Data analysis was performed using SPSS 17.0 and Fisher's exact test. Results:HIV1 vertical transmission was diagnosed in 3/140(2.1%) cases. CMV congenital infection was diagnosed in 4(2.9%) newborns from HIV women and no congenital CMV infection was diagnosed in newborns from non-HIV women. 2/137(1.5%) HIV women and 14/140(10.0%) non-HIV women were CMV seronegative. HCV infection was detected in 6(4.4%) HIV women; all had HCV positive viral load; different genotypes were found. One case of HCV perinatal transmission was diagnosed. No HCV antibodies were found in non-HIV women. No children were HIV/HCV or CMV/HCV coinfected but 2 were HIV/CMV coinfected. There is evidence of significant statistical associations with race/ethnicity and time of pregnancy. Conclusion:In this study HIV women had higher CMV/HCV antibody prevalence and frequency of maternal-fetal transmission than non-HIV women. 2/137 HIV seronegative newborns and 2/3 HIV newborns were CMV congenitally infected; this difference should be further studied, as the consequences of CMV/HCV infections may become increasingly serious and complex in the presence of HIV. This specific group is not representative of the Portuguese infected women, nevertheless the significant risk factors found and other risk factors studied without strong associations should be considered in larger studies.
- Epidemiologia do CMVPublication . Lopo, SílviaO citomegalovírus (CMV) é um vírus ubíquo, sem predomínio sazonal conhecido e com uma prevalência que varia, nos EUA, entre 50% e 85% em adultos (CDC, 2006). A epidemiologia do CMV é diferente nas várias regiões do mundo e nos diferentes grupos etários e socioeconómicos. Geralmente, os grupos socioeconómicos mais elevados apresentam uma seroprevalência mais baixa e adquirem a infeção mais tarde. A caracterização do estado imunitário da população residente em Portugal Continental, no âmbito do 2º Inquérito Serológico Nacional, permitiu conhecer a prevalência do CMV no País e estudar alguns aspetos epidemiológicos, contribuindo para determinar que grupos na população apresentam maior prevalência e que grupos estão mais suscetíveis a casos incidentes (Lopo et al., 2004a). Os resultados indicam que a infeção pelo CMV é muito prevalente na população estudada (77,0%) e ocorre sobretudo nos primeiros anos de vida. No entanto, a partir do grupo etário dos 10 aos 14 anos, verificou-se um aumento da prevalência em indivíduos do sexo feminino, o que poderá corresponder a um maior contacto que os indivíduos do sexo feminino têm com crianças que podem estar a excretar vírus, o que representará um modo de transmissão horizontal do CMV e um risco para as mulheres grávidas e para as trabalhadoras em jardins de infância. O facto de 24,5% e 18,5% de mulheres em idade fértil (dos 20 aos 29 anos e dos 30 aos 44 anos respetivamente) serem suscetíveis para o CMV, leva-nos a admitir um considerável risco para a infeção congénita por este vírus. O CMV é a principal causa de infeção viral congénita, com uma incidência mundial que varia entre 0,4% e 2,2% do total de nascimentos e com um quadro de infeção que pode envolver qualquer órgão e variar entre padrões de doença ligeiros e limitados, até apresentações graves e disseminadas da doença, resultando em mais de 20% de mortalidade perinatal e uma morbilidade com impacto social e económico. A infeção primária materna durante a gestação é responsável por cerca de 40% de transmissão intrauterina, em contraste aos 0,5% estimados em infeções recorrentes durante a gravidez. Segundo estudos efetuados por diferentes grupos de trabalho portugueses, a proporção da infeção congénita pelo CMV numa população da região de Lisboa e numa população da Beira Interior utilizando o método de referência (deteção de vírus na urina pelo método de cultura shell-vials) foi de 0,7% e 0,4%, respetivamente (Lopo et al, 2004b; Almeida et al, 2010); Paixão e col., utilizando a técnica de PCR em amostras de sangue obtidos dos Guthrie Cards, encontraram uma proporção da infeção congénita pelo CMV, de 1,1% em Portugal Continental e Ilhas e de 0,7% na região de Lisboa (Paixão et al, 2009). O rastreio serológico pré-concecional para o CMV, aconselhado desde 2006 na circular normativa nº2/DSMIA, como componente básico dos cuidados pré-concecionais, vem acentuar a importância em conhecer, nas mulheres que pretendem engravidar o seu perfil imunitário para o CMV (Ministério da Saúde, 2006). Para mulheres gestantes, a fonte mais provável de infeção é o contacto com urina ou saliva de crianças. Nos casos em que se deteta a suscetibilidade às infeções causadas por este vírus, o clínico tem a possibilidade de elucidar as mulheres sobre os riscos associados à aquisição de infeção pelo CMV durante a gravidez e sugerir a adoção de medidas preventivas que reduzam a transmissão do vírus, diminuindo a possibilidade de ocorrência de infeção congénita e que passam sobretudo por alterações simples de comportamento. Ainda em fase de ensaios clínicos encontram-se algumas terapêuticas experimentais de imunização passiva e de administração de antivíricos a grávidas infetadas pelo CMV. Com o objetivo de diminuir a mortalidade e as sequelas da infeção pelo CMV, são utilizadas terapêuticas com compostos antivíricos, nomeadamente com o ganciclovir, nas crianças gravemente afetadas. A prevenção mais eficaz da infeção congénita pelo CMV requer a implementação de um esquema de vacinação. No entanto, enquanto se aguarda o desenvolvimento e disponibilização de uma vacina adequada, são necessárias medidas de prevenção e acompanhamento das grávidas. Continua a existir a necessidade em aumentar o conhecimento sobre o impacto em Saúde Pública da infeção congénita pelo CMV e a sua associação com os deficits nestas crianças, uma vez que o seu acompanhamento envolve enormes custos financeiros. Apesar de, tanto quanto é do nosso conhecimento, ainda não ter sido publicado nenhum estudo sobre os custos sociais do CMV em Portugal, a infeção congénita por este vírus já é reconhecida nos EUA e em vários países da Europa, como um condicionante social importante, devido aos elevados custos, quer associados ao tratamento e apoio às crianças com sequelas, quer ao absentismo profissional dos pais e ao acompanhamento das famílias afetadas.
- Evaluation of the antiviral activity of an aqueous extract from Solidago virgaurea against Herpes simplex virus type 2Publication . Mendes, Ana Rita; Lopo, Sílvia; Ascensão, Lia; Falé, Pedro; Serralheiro, Luisa; Caeiro, Maria FilomenaHerpes simplex virus type 2 (HSV-2) is widely distributed through the human population, infecting more than 500 million people globally [1]. Although typically causing mild diseases this virus may be responsible for severe infections, mainly in immunocompromised patients. Currently, there is a number of systemic antiviral agents against herpesvirus, the most commonly used being acyclovir and related drugs. However, long term treatments with these drugs may result in the development of resistance, especially in immunocompromised patients, which leads to a continuous search for new and better therapeutic alternatives [2]. According to the World Health Organization plants are the best sources for obtaining a wide variety of drugs [3]. So, in the last decades many pharmacological and chemical studies have focused on medicinal plants to the discovery of new natural antiviral compounds.
- Genital Herpes in a STD outpatient clinic in LisbonPublication . Lopo, Sílvia; Roque, Carla; Costa, Inês; Borrego, Maria José; Azevedo, JacintaIntroduction: Genital Herpes is the major cause of genito-ulcerative disease affecting a considerable number of individuals worldwide and is a chronic, life-long viral infection caused by both HSV1 or HSV2. Most cases of recurrent genital herpes are caused by HSV2, being the leading cause of genital ulcer disease in developing countries, but the proportion of anogenital herpetic infections attributed to HSV1 are increasing, especially in young women and MSM. The prevalence in the general population ranges from 10% to 80% and depends on socio-economic factors. Seropositivity rates are higher in women than in men and increase with age. Reactivation and subclinical shedding is more frequent in genital infections caused by HSV2 than by HSV1, which reaffirm the importance of laboratory confirmation of clinical diagnosis. Aims: Retrospective study of the role of HSV1 and HSV2 infections in genital ulcerations from a population of a Sexually Transmitted Diseases Outpatient Clinic, according to epidemiological, laboratory and clinical data. Methodology: 56 ulcer genital/urethral swabs from patients suspected of HSV infection were sent to the National Institute of Health (NIH), in Lisbon, between April 2015–April 2016. HSV1 and HSV2 were determined by a quantitative commercial real-time PCR kit, which targets a fragment of 162 bp of a region located in the US7 gene for HSV1 and a fragment of 177 bp of a region located in the US2 gene for HSV2. The 56 swabs were also inoculated in Vero cell cultures for determination of cytopathic effect. Results: HSV infection in genital/urethral swabs were detected in 30 (53.6%) of 56 samples. The symptoms of the positive cases were genital ulcerations in vulva or penis and/or perineum and the clinical diagnosis was genital herpes infection. In 7 of the 30 positive cases (23.3%) HSV1 DNA was detected (2 man and 5 women with age ranges between 17 and 27 years old); and in 23 of the 30 positive cases (76.7%) HSV2 DNA was detected (18 man and 5 women, with age ranges between 17 and 62 years old). Five of the 7 HSV1 positive cases were primoinfections (71.4%) and in the 23 HSV2 positive cases, 3 (13.0%) were primoinfections and 8 (34.8%) were the first ulcer episode but not primoinfections. HSV DNA viral load values varied between 21848–87474493 cop/ml in HSV1 cases and between 1177– 31160846336 cop/ml in HSV2 cases. We didn’t find direct correlation between viral load and primary vs recurrent infection although the higher viral load was found in HSV2 first episode cases. Cytophatic effect was observed in all positive PCR cases. All positive cases were treated with valacyclovir and resolved after treatment. Comments: To identify HSV genital infections is important for the specific treatment, for preventing the transmission of HSV to partners, and to prevent the risk of acquiring and transmitting HIV. In our study 53.6% cases were positive for HSV genital infection; because of social, demographic and migratory tendency, the population at risk for STI continues to grow and experience an increased burden of disease. We also observed in this population an increasing proportion of HSV1 genital primoinfection, which is in accordance to the literature. In the present study we confirmed the usefulness of real-time PCR for HSV DNA detection in genital ulcerations. Concerning the correlation of viral load with subtype, the differences should be further evaluated with an increase number of clinical cases.
- Infeção por parvovírus B19 durante a gravidez: análise retrospetiva de casos suspeitos diagnosticados no INSA (2009-2012)Publication . Lopo, Sílvia; Reis, Tânia; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Gargaté, Maria João
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