Publication
Caracterização genómica de Salmonella Newport: identificação de clusters genéticos, janeiro 1991-maio 2024
| dc.contributor.author | Caeiro, Raquel | |
| dc.contributor.author | Tomás, Alexandra | |
| dc.contributor.author | Henriques, Ana Margarida | |
| dc.contributor.author | Pista, Angela | |
| dc.contributor.author | Silveira, Leonor | |
| dc.date.accessioned | 2024-10-24T14:52:28Z | |
| dc.date.available | 2024-10-24T14:52:28Z | |
| dc.date.issued | 2024-08 | |
| dc.description.abstract | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport (S. Newport) é um serotipo pouco frequente na União Europeia. No entanto, devido à sua associação com alguns surtos de origem alimentar, a sua importância não deve ser negligenciada. Em Portugal, os dados sobre a infeção por S. Newport são escassos. Este estudo teve como principais objetivos caracterizar fenotípica e genotipicamente isolados clínicos de S. Newport entre 1991 e maio de 2024, e identificar possíveis clusters genéticos. Após serotipagem, 98 isolados foram submetidos a testes de suscetibilidade aos antibióticos e sequenciação total do genoma. Apesar da maioria dos isolados estudados (96,9%) terem sido suscetíveis aos antibióticos testados, em 2024 foi identificado um isolado multirresistente, que, entre outros, continha o gene blaDHA-1. A análise core genome multilocus sequence typing (Enterobase cgMLST V2 + HierCC V1), considerando um threshold de cinco diferenças alélicas, permitiu identificar oito clusters distintos, dois dos quais de maiores dimensões: o Cluster 1, com 32 isolados de 2019, e o Cluster 2, com quatro isolados de 2022 e 18 de 2023. Embora S. Newport seja um serotipo pouco frequente em Portugal e não apresentar, na maioria dos casos, resistências aos antibióticos, é essencial manter uma vigilância laboratorial contínua, que permita de forma atempada implementar medidas de prevenção e controlo eficazes. | pt_PT |
| dc.description.abstract | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport (S. Newport) is a relatively uncommon serotype within the European Union. Nevertheless, due to the relevance of some related outbreaks, its significance should not be underestimated. In Portugal, data on S. Newport infection is scarce. The objectives of this study were to characterise clinical isolates of S. Newpor t received between Januar y 1991 and May 2024, and to identif y potential genetic clusters. Following serotyping, 98 isolates were subjected to antibiotic susceptibility testing and whole genome sequencing. Most of the isolates (96.9%) were susceptible to the tested antibiotics. However, a multidrug-resistant isolate was identified in 2024, which contained the blaDHA-1 gene, among others. The core genome multilocus sequence typing analysis (Enterobase cgMLST V2 + HierCC V1), with a threshold of five allelic dif ferences, enabled the identification of eight clusters, two of them considered as major clusters: Cluster 1, comprising 32 isolates from 2019, and Cluster 2 including four isolates from 2022 and 18 from 2023. Although S. Newpor t is an uncommon serotype in Por tugal and most of the isolates do not exhibit antibiotic resistance, it is essential to maintain a continuous laborator y surveillance programme in order to implement ef fective prevention and control measures. | pt_PT |
| dc.description.version | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | pt_PT |
| dc.identifier.citation | Boletim Epidemiológico Observações. 2023 mai-ago;12(34):10-15 | pt_PT |
| dc.identifier.issn | 0267-8357 | |
| dc.identifier.issn | 2182-8873 (em linha) | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.18/9223 | |
| dc.language.iso | por | pt_PT |
| dc.publisher | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IP | pt_PT |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | pt_PT |
| dc.subject | Salmonella Newport | pt_PT |
| dc.subject | Caracterização Genómica | pt_PT |
| dc.subject | Clusters genéticos | pt_PT |
| dc.subject | Doenças Infecciosas | pt_PT |
| dc.subject | Portugal | pt_PT |
| dc.title | Caracterização genómica de Salmonella Newport: identificação de clusters genéticos, janeiro 1991-maio 2024 | pt_PT |
| dc.title.alternative | Genomic characterization of Salmonella Newport: identification of genetic clusters, January 1991-May 2024 | pt_PT |
| dc.type | journal article | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| oaire.citation.conferencePlace | Lisboa, Portugal | pt_PT |
| oaire.citation.endPage | 15 | pt_PT |
| oaire.citation.issue | 36 | pt_PT |
| oaire.citation.startPage | 10 | pt_PT |
| oaire.citation.title | Boletim Epidemiológico Observações | pt_PT |
| oaire.citation.volume | 13 | pt_PT |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | article | pt_PT |