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O INSA e a resposta de emergência ao diagnóstico laboratorial da COVID-19 em Portugal
| Name: | Description: | Size: | Format: | |
|---|---|---|---|---|
| 1.33 MB | Adobe PDF |
Advisor(s)
Abstract(s)
Desde o inicio da atual pandemia da COVID-19 que o diagnóstico laboratorial
foi e continua a ser uma ferramenta imprescindível na identificação
dos casos de infeção por coronavírus SARS-CoV-2. O diagnóstico laboratorial
tem sido essencial para identificar os casos sintomáticos e em
particular assintomáticos sendo crucial na implementação de medidas
estratégicas de controlo e quebra das cadeias de transmissão do vírus.
Desde a notificação dos primeiros casos da COVID-19 em dezembro de
2019 em Wuhan, na China e em resposta à pandemia o Instituto Nacional
de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) implementou o procedimento de
diagnóstico laboratorial e coordenou a expansão da capacidade de testagem
com a criação da Rede Portuguesa de Laboratórios para o diagnóstico
da COVID-19. No âmbito desta rede foram realizados ensaios
inter-laboratoriais, para conceder aptidão aos laboratórios para a realização
do diagnóstico de deteção do SARS-CoV-2. O diagnóstico laboratorial
foi realizado através da técnica de RT- PCR em tempo real inicialmente
estabelecido com um protocolo in-house e posteriormente com a utilização
de kits comerciais. Os protocolos desenvolvidos para pesquisa do
RNA do vírus SARS-CoV-2 têm como alvo três regiões do genoma. A deteção
do RNA do vírus é efetuada em amostras respiratórias do trato superior
e inferior. No período de 1 de fevereiro a 23 de novembro de 2020,
o INSA realizou o diagnóstico laboratorial da COVID-19, através da pesquisa
do ácido ribonucleico (RNA) do SARS-CoV-2 em 90 059 amostras
respiratórias, p ela metodologia de RT-PCR. De todas as amostras
analisadas conjuntamente no INSA/Instituto Nacional de Investigação
Agrária e Veternária (INIAV), 54,5% foi procedente de hospitais, 11,5%
de ERPI/lares, 10,3% de estabelecimentos prisionais e 2,7% procedentes
da cooperação com os Países Africanos de Língua Oficial Portuguesa
(PALOP). A pesquisa de SARS-CoV-2 foi positiva em 10,2% das amostras analisadas para a pesquisa de SARS-CoV-2, sendo a maior proporção
destes casos observada nos indivíduos com idade igual ou superior
a 80 anos (14,2%). Foram analisadas 631 amostras de ensaios inter-laboratoriais,
que permitiram conceder aptidão, aos 128 laboratórios da rede
laboratorial, para a realização da deteção do SARS-CoV-2, e distribuídos
e realizados três programas de avaliação externa da qualidade para
a deteção do SARS-CoV-2 em colaboração com o Programa Nacional de
Avaliação Externa da Qualidade (PNAEQ). A importância das redes laboratoriais
foi bem evidenciada no decorrer da pandemia, constituindo uma
estrutura de resposta a nível nacional para a testagem e diagnóstico laboratorial
da COVID-19. Em Portugal, a capacidade laboratorial atualmente
instalada e a experiência adquirida no decorrer da pandemia serão uma
mais valia para a resposta a novas situações de transmissão de agentes
com potencial pandémico.
Since the beginning of the current COVID-19 pandemic, laboratory diagnosis has been and continues to be an essential tool in the identification of new cases of infection by the SARS-CoV-2 coronavirus. Laboratory diagnosis has been essential to identify symptomatic and in particular asymptomatic cases and is crucial in the implementation of strategic measures to control transmission chains. Since the notification of the first cases of COVID-19 in December 2019 in Wuhan, China and in response to the pandemic, the National Institute of Health Dr Ricardo Jorge (INSA) has implemented the laboratory diagnostic to detect the SARS-CoV-2 virus and coordinated the testing capacity expansion within the Portuguese Network of Laboratories for the diagnosis of COVID-19. Inter-laboratory tests were carried out to grant the laboratories ability to carry out the diagnosis of SARS-CoV-2. The laboratory diagnosis was performed using the RT-PCR technique in real time, initially established with an in-house protocol and later with the use of commercial kits. The protocols to detect the SARS-CoV-2 virus target three regions of the genome. Detection of the virus's RNA is performed in upper and lower respiratory tract samples. In the study period, from February 1 to November 23, 2020, INSA performed the laboratory diagnosis of COVID-19, through the research of SARS-CoV-2 ribonucleic acid (RNA) in 90 059 respiratory samples, using the RT-PCR. Of all the samples analyzed at INSA/INIAV, 54.5% (49 093) came from hospitals, 11.5% ERPI/nursing homes and 10.3% from prisons and 2.7% from cooperation with the Portuguese-speaking African countries (PALOP). 10.2% of the analyzed samples were positive for the SARS-CoV-2, with the largest proportion of these cases observed in individuals aged 80 years and over. 631 samples of inter-laboratory tests were analyzed, which allowed the detection of SARS-CoV-2 by the 128 laboratories in the laboratory network; three external quality assessment programs were distributed for the detection of SARS (PNAEQ). The importance of laboratory networks was well demonstrated during the pandemic, constituting a national response structure for the laboratory diagnosis of COVID-19. In Portugal, the laboratory capacity currently installed and the experience acquired in the course of the 2020 pandemic will be an advantage in responding to new situations of pandemic potential.
Since the beginning of the current COVID-19 pandemic, laboratory diagnosis has been and continues to be an essential tool in the identification of new cases of infection by the SARS-CoV-2 coronavirus. Laboratory diagnosis has been essential to identify symptomatic and in particular asymptomatic cases and is crucial in the implementation of strategic measures to control transmission chains. Since the notification of the first cases of COVID-19 in December 2019 in Wuhan, China and in response to the pandemic, the National Institute of Health Dr Ricardo Jorge (INSA) has implemented the laboratory diagnostic to detect the SARS-CoV-2 virus and coordinated the testing capacity expansion within the Portuguese Network of Laboratories for the diagnosis of COVID-19. Inter-laboratory tests were carried out to grant the laboratories ability to carry out the diagnosis of SARS-CoV-2. The laboratory diagnosis was performed using the RT-PCR technique in real time, initially established with an in-house protocol and later with the use of commercial kits. The protocols to detect the SARS-CoV-2 virus target three regions of the genome. Detection of the virus's RNA is performed in upper and lower respiratory tract samples. In the study period, from February 1 to November 23, 2020, INSA performed the laboratory diagnosis of COVID-19, through the research of SARS-CoV-2 ribonucleic acid (RNA) in 90 059 respiratory samples, using the RT-PCR. Of all the samples analyzed at INSA/INIAV, 54.5% (49 093) came from hospitals, 11.5% ERPI/nursing homes and 10.3% from prisons and 2.7% from cooperation with the Portuguese-speaking African countries (PALOP). 10.2% of the analyzed samples were positive for the SARS-CoV-2, with the largest proportion of these cases observed in individuals aged 80 years and over. 631 samples of inter-laboratory tests were analyzed, which allowed the detection of SARS-CoV-2 by the 128 laboratories in the laboratory network; three external quality assessment programs were distributed for the detection of SARS (PNAEQ). The importance of laboratory networks was well demonstrated during the pandemic, constituting a national response structure for the laboratory diagnosis of COVID-19. In Portugal, the laboratory capacity currently installed and the experience acquired in the course of the 2020 pandemic will be an advantage in responding to new situations of pandemic potential.
Description
Membros das Equipas (por ordem alfabética): Alexandra Nunes, Ana Duarte, Ana Margarida Henriques, Ana Paula Rodrigues, Ana Pelerito, Ana Paula Grilo,
Ana Rita Cascão, Ana Teresa Almeida, Anabela Santos Silva, Anabela Vilares, Ângela Pista, Augusta Correia, Carla Feliciano, Carla Manita, Carla Roque,
Carla Rio, Carla Silva, Carla Valongo, Carlos Ribeiro, Célia Rodrigues Bettencourt, Cláudia Marques, Cristina Correia, Cristina Ferro, Cristina Matos,
Cristina Veríssimo, Diogo Ribeiro, Dora Cordeiro, Elizabeth Pádua, Elsa Vinagre, Fátima Martins, Fernanda Vilarinho, Fernanda Martins, Helena Cortes
Martins, Helena Rocha, Hugo Osório, Idalina Ferreira, Inês Costa, Inês João, Irene Rodrigues, Isabel Albergaria, Isabel Lopes de Carvalho, Isabel Moura,
Ivone Água-Doce, Joana Isidro, João Paulo Gomes, João Rodrigues, João Santos, Jorge Machado, José Vicente Constantino, Juliana Inês Santos, Laura
Almeida, Leonor Silveira, Líbia Zé-Zé, Lígia Reis, Liliana Matos, Lisbeth Silva, Lourdes Bento, Lúcia Vieira, Lucinda Santos, Luísa Cavaleiro, Magda
Antunes, Márcia Faria, Margarida Vaz, Maria Assunção António, Maria da Conceição Moreira, Maria Francisca Coutinho, Maria Isabel Sousa, Maria João
Gargaté, Maria João Alves, Maria José Borrego, Maria Lavajo, Marisa Encarnação, Miguel Fevereiro, Mónica Oleastro, Nuno Verdasca, Patrícia Barros,
Patrícia Conde, Patrícia Vieira, Paula Bajanca-Lavado, Paula Cristóvão, Paula Palminha, Paula Teixeira, Paulo Gonçalves, Paulo Parreira, Pedro Lacerda,
Pedro Marques, Pedro Pechirra, Raquel Guiomar, Raquel Neves, Raquel Marques, Raquel Rocha, Raquel Rodrigues, Raquel Sabino, Rita Cordeiro, Rita
de Sousa, Rita Macedo, Rita Matos, Rita Roquette, Rosa Costa, Rosa Vilaça, Salomé Gomes, Sandra Alves, Sílvia Lopo, Sofia Moura, Sónia Baptista,
Sónia Silva, Susana Gomes, Susana Martins, Susana Silva, Suza Almeida, Tânia Reis, Teresa Lopes, Tiago Luís, Vera Manageiro, Vítor Borges
Agradecimentos: Aos Colegas que prestam apoio ao SAL, à equipa de seguranças do INSA e às Colegas do PNAEQ, pelo suporte prestado à Rede Laboratorial; Ao Serviço de Saúde Ocupacional do INSA.
Agradecimentos: Aos Colegas que prestam apoio ao SAL, à equipa de seguranças do INSA e às Colegas do PNAEQ, pelo suporte prestado à Rede Laboratorial; Ao Serviço de Saúde Ocupacional do INSA.
Keywords
COVID-19 Pandemia da COVID-19 Infeção por SARS-CoV-2 Respostas de Saúde Pública Diagnóstico Laboratorial Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da COVID-19. Laboratório de Estado da Saúde Infecções Respiratórias Saúde Pública Portugal
Pedagogical Context
Citation
Boletim Epidemiológico Observações. 2020;9(Supl 12):9-18
Publisher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IP