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- Primeiro Inquérito Serológico Nacional à infeção por SARS-CoV-2: avaliação do processo de elaboração: relatório técnicoPublication . Garcia, Ana Cristina; Santos, Joana; Gonçalves, Paulo; Roquette, RitaA doença causada pelo Coronavírus da Síndrome Respiratória Aguda Grave 2 (SARS-CoV-2), (Coronavirus Disease 2019 ou COVID-19), foi declarada como Pandemia no dia 11 de março de 2020, tendo Portugal confirmado o seu primeiro caso no dia 2 de março de 2020. As limitações de conhecimento relativas ao vírus SARS-CoV-2, incluindo as questões relacionadas com a sua capacidade de transmissão na população Portuguesa, e as potencialidades dos resultados de estudos sero-epidemiológicos na resposta às necessidades de informação para apoio à tomada de decisão no controlo da epidemia de COVID-19 justificaram a realização em Portugal do primeiro Inquérito Serológico Nacional COVID-19 (ISN COVID-19). Este estudo foi conduzido no segundo trimestre de 2020, sob a coordenação do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA), tendo os seus resultados preliminares sido publicados em 31 de julho de 2020. Estando prevista a realização de outros ISN COVID-19, foi decidido efetuar a avaliação do primeiro inquérito com o objetivo geral de avaliar o processo de elaboração desse estudo e posteriormente aplicar as recomendações daí resultantes ao processo de elaboração dos próximos ISN COVID-19. Os objetivos específicos de avaliação foram: a) Caracterizar a adequação do processo de elaboração do primeiro ISN COVID-19, tendo em conta o fim a que se destinou; e b) Identificar melhorias a introduzir no processo de elaboração do segundo ISN COVID-19. A avaliação foi realizada através de um estudo descritivo com dados essencialmente recolhidos por questionário. A população em estudo foi constituída pela equipa do ISN COVID-19 do INSA, com exceção dos elementos da equipa de avaliação, e pelos parceiros externos do projeto ISN COVID-19. Foram selecionados 11 parâmetros enquanto elementos que permitem a descrição e compreensão do processo de elaboração do primeiro ISN COVID-19, traduzindo cada um deles, uma etapa, ou, um ou vários produtos do processo, e, ou, um ou vários procedimentos seguidos na elaboração do primeiro ISN COVID-19. A cada um dos parâmetros correspondeu um tema para avaliação. Foi acrescentado como 12º tema o processo na sua globalidade. Para cada um dos 12 temas, foi avaliada a adequação ao fim a que se destinou (através de uma escala de valores de 1 (“não adequado”) a 5 (“totalmente adequado”), e identificadas recomendações a aplicar ao processo de elaboração do segundo ISN COVID-19 (através das respostas a perguntas abertas). Foi, também, recolhida informação quanto aos motivos que justificaram o valor atribuído à variável adequação ao fim a que se destinou. O questionário foi de autopreenchimento, distribuído e recolhido por via virtual, e anonimizado no que diz respeito à identidade dos participantes. Das 78 pessoas convidadas a responder ao questionário, participaram 43 (55,1 %), das quais 25 (58,1 %) classificaram a variável adequação ao fim a que se destinou da totalidade dos temas. O tema 1 (Elaboração do protocolo do primeiro ISN COVID-19) foi o que obteve maior número de respostas (n=42; 97,7 % dos participantes) e o tema 12 (Processo global de elaboração do primeiro ISN COVID-19) o menor (n=29; 67, 4%). No conjunto dos respondentes por tema, tanto a mediana como a moda dos valores atribuídos à variável adequação ao fim a que se destinou do processo de elaboração do primeiro ISN COVID-19 foram 5 (“totalmente adequado”) para os 12 temas. O segundo valor mais pontuado foi o valor 4 em todos os temas, com exceção do tema 10, relativo à comunicação dos resultados laboratoriais ao médico assistente e aos participantes no inquérito, em que foi o valor 3. Em nenhum dos temas foi observado o valor 1 (“não adequado”) e o valor 2 foi atribuído em 5 dos 12 temas. Excluindo as respostas com o valor “sem opinião”, a proporção de respostas 4 ou 5 (muito ou “totalmente adequado”) foi igual ou superior a 90,0 % em 9 dos 12 temas em avaliação. Comparativamente com os demais, o tema 10 foi o que apresentou resultados menos favoráveis. As limitações do estudo avaliativo prendem-se essencialmente com a técnica de recolha de dados utilizada e a população em estudo. As principais recomendações retiradas para o processo de elaboração de um novo Inquérito Serológico Nacional COVID-19 podem resumir-se: a) na opção por uma metodologia que assegure a comparabilidade dos resultados com os resultados do primeiro ISN COVID-19; b) no aumento da duração do período de preparação do estudo, privilegiando a precocidade de envolvimento dos parceiros; c) no aperfeiçoamento do processo de comunicação dos resultados das análises laboratoriais entre o INSA e os laboratórios de colheita, e entre estes e os participantes no inquérito; d) no reforço da equipa de recursos humanos alocados à monitorização do estudo; e e) na adequação de procedimentos específicos por etapas, segundo as recomendações específicas da avaliação, desde que não fique comprometida a exequibilidade de um futuro ISN COVID-19.
- Association of inflammatory mediators with frailty status in older adults: results from a systematic review and meta-analysisPublication . Marcos-Pérez, Diego; Sánchez-Flores, María; Proietti, Stefania; Bonassi, Stefano; Costa, Solange; Teixeira, Joao Paulo; Fernández-Tajes, Juan; Pásaro, Eduardo; Laffon, Blanca; Valdiglesias, VanessaFrailty is a geriatric syndrome defined as a status of extreme vulnerability to stressors, leading to a higher risk of negative health-related outcomes. "Inflammaging", an age-related state of low-grade chronic inflammation, is characterized by an increased concentration of pro-inflammatory cytokines and acute phase proteins. Inflammaging has been postulated as an underlying mechanism of frailty, and several studies tested the relationship between frailty and concentration of inflammatory mediators. The aim of this systematic review and meta-analysis was to test whether inflammatory mediators are overproduced in frail older adults. Among the 758 articles identified in the literature search, 50 were included in the systematic review, and 39 in the three meta-analyses, i.e., C-reactive protein (CRP), interleukin 6 (IL6), and tumor necrosis factor α. To reduce heterogeneity, meta-analyses were restricted to studies identifying frailty by the Fried et al. [1] [J. Gerontol. A. Biol. Sci. Med. Sci. 56, M146-56] phenotypic criteria. Quantitative analyses measuring the association between frailty and biomarker concentrations showed significant differences when frail subjects were compared to non-frail and pre-frail subjects for CRP and IL6. This work established strong association between inflammatory biomarkers and frailty, confirming the role of age-related chronic inflammation in frailty development.
- Acidentes domésticos e de lazer em tempos da pandemia da COVID-19 em PortugalPublication . Alves, Tatiana; Rodrigues, Emanuel; Neto, Mariana; Mexia, Ricardo; Dias, Carlos MatiasO contexto pandémico que vivemos veio realçar o significado e impacto das medidas de prevenção. Importa, assim, olharmos para eventos mais comuns, alguns deles evitáveis, como são os Acidentes Domésticos e de Lazer (ADL), em que comportamentos mais seguros no quotidiano poderão evitar impacto negativo na saúde e o recurso a serviços de saúde. A informação gerada pelo sistema EVITA permitiu desenvolver o presente estudo com o objetivo de conhecer a evolução dos episódios de ADL com necessidade de recorrência ao Serviço de Urgência, com base nos registos hospitalares, entre 2017 e 2020. Verificou-se que, desde março de 2020, tem vindo a ocorrer uma diminuição do número de episódios de ADL registados no sistema EVITA, tendo o menor valor sido registado no mês de abril (n=16 984). Os episódios de ADL registados entre março e novembro de 2020 mantiveram-se sempre abaixo dos valores observados nos períodos homólogos dos últimos quatro anos.
- Limitações da vida diária por motivos de saúde durante o primeiro período de confinamento em contexto da pandemia da COVID-19 em PortugalPublication . Namorado, Sónia; Machado, Ausenda; Dias, Carlos Matias; Neto, MarianaA limitação das atividades da vida diária por razões de saúde é um dos indicadores utilizados para avaliação do estado de saúde da população europeia, integrando vários instrumentos de observação. Considerando que as medidas de controlo da pandemia da COVID-19 implementadas em Portugal implicaram numa primeira fase um período de confinamento de 45 dias, correspondente ao estado de emergência, esta medida poderá ter influenciado a limitação das atividades da vida diária por razões de saúde. Assim, o presente estudo teve como objetivo descrever as limitações da vida diária por razões de saúde ocorridas na população portuguesa durante o primeiro período de confinamento devido à pandemia da COVID-19. Foi avaliada a limitação sentida há pelo menos seis meses devido a problemas de saúde na realização de atividades habitualmente realizadas pelas pessoas e a situação no mês anterior à entrevista. Foram utilizados dados recolhidos por inquérito ao painel ECOS. As prevalências foram estratificadas por sexo, grupo etário, região, nível de escolaridade e situação perante o trabalho. A maioria dos respondentes (68,8%) não reportaram limitações na realização das atividades habituais por problemas de saúde nos seis meses anteriores à entrevista. No entanto, registou-se um aumento da prevalência de limitações severas e não severas face a 2018. A limitação da realização das atividades da vida diária por motivos de saúde foi mais frequente nas mulheres, nos indivíduos com mais de 65 anos, sem escolaridade ou com nível de escolaridade básico, reformados e residentes na região de Lisboa e Vale do Tejo. Durante o período de confinamento obrigatório cerca de 10% dos inquiridos reportaram um agravamento das limitações, enquanto que 6% reportou uma melhoria da sua situação. Este estudo vem mostrar que o período de confinamento levou à ocorrência de alterações na limitação da vida diária por razões de saúde, e que dada a situação atual importa continuar a estar a atento à evolução deste indicador na população portuguesa.
- O INSA na resposta à pandemia da COVID-19 [editorial]Publication . Almeida, Fernando de; Santos, Cristina AbreuO Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) é, por excelência, o Laboratório de Estado da Saúde que tem, entre outras, a missão, através do desenvolvimento das suas atividades, de responder às emergências em saúde pública, aceitar os desafios da inovação, corresponder ao imperativo ético de partilhar o conhecimento científico e dar suporte a decisões políticas e suprir lacunas de conhecimento que conduzam a ganhos em saúde. A atual pandemia veio colocar novos desafios, novas perguntas a responder, e convocar-nos para a nossa missão: sermos referência! (...)
- Biofilm formation by ST17 and ST19 strains of Streptococcus agalactiaePublication . Silvestre, Inês; Borrego, Maria José; Jordão, LuísaBacterial biofilms are an important virulence factor with a vital role in evasion from the host immune system, colonization and infection. The aim of the present study was to evaluate in vitro the effects of three environmental factors (H+, glucose and human plasma) in biofilm formation, by carrier and invasive Streptococcus agalactiae strains of ST17 and ST19 sequence types, including DNase producers and non-producers. Bacteria ability to assemble biofilms was classified based on crystal violet assay. Biofilm formation was also monitored by scanning electron microscopy. Depending on the growth medium used, each bacterial isolate could fit in different biofilm production categories. Our data showed that optimal conditions for S. agalactiae biofilm assembly were reached after 48 h incubation at pH 7.6 in the presence of glucose and inactivated human plasma. In the presence of inactivated human plasma, the biofilm biomass of ST19 strains experienced a higher increase than ST17 strains. The composition of the extracellular polymeric matrix of the three strongest biofilm producers (all from ST17) was accessed by enzymatic digestion of mature biofilms and proteins were shown to be the predominant component. The detailed identification of the extracellular protein components should contribute to the development of new therapeutic strategies to fight S. agalactiae infections.
- O paradigma da contaminação fecal de águas balneares, nem sempre o humano é culpadoPublication . Santos, Maria Leonor; Brandão, João; Valério, ElisabeteE. coli, coliformes, enterococos intestinais, estas bactérias foram durante décadas a luz do sol na luta contra a propagação de doenças transmissíveis por águas de consumo e recreativas. A sua presença em massas de água correlaciona-se diretamente com a doença humana. No entanto, essa correlação não é total. Há uma percentagem de casos em que a sua presença não tem implicações na saúde humana. Como resolver estes casos, de forma a identificar as fontes de contaminação fecal? A Biotecnologia respondeu a esta questão. O genoma das Bacteroides spp., bactérias pertencentes à flora intestinal de animais de sangues quentes e dificeis de cultivar em laboratório, apresentam pequenas variações de acordo com espécies que colonizam, indicando assim se a presença do seu material genético numa água é de origem humana, bovina, canídea, suína ou avícola, por exemplo. A sua pesquisa para determinar fontes de contaminação fecal em massas de água denomina-se de Microbial Source Tracking. Este método não veio substituir a utilização das bactérias intestinais tradicionais, que são indicadores simples e eficientes, mas veio dar resposta à procura das fontes biológicas de uma contaminação fecal.
- Emergence of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis of the Beijing lineage in Portugal and Guinea-Bissau: a snapshot of moving clones by whole-genome sequencingPublication . Perdigão, João; Silva, Carla; Maltez, Fernando; Machado, Diana; Miranda, Anabela; Couto, Isabel; Rabna, Paulo; Florez de Sessions, Paola; Phelan, Jody; Pain, Arnab; McNerney, Ruth; Hibberd, Martin L.; Mokrousov, Igor; Clark, Taane G.; Viveiros, Miguel; Portugal, IsabelThe Beijing genotype comprises a highly disseminated strain type that is frequently associated with multidrug resistant (MDR) tuberculosis (TB) and increased transmissibility but, countries such as Portugal and Guinea-Bissau fall outside the regions phylogeographically associated with this specific genotype. Nevertheless, recent data shows that this genotype might be gradually emerging in these two countries as an underlying cause of primary MDR-TB. Here, we describe the emergence of Mycobacterium tuberculosis Beijing strains associated with MDR-TB in Portugal and Guinea-Bissau demonstrating the presence of the well described superclusters 100-32 and 94-32 in Portugal and Guinea-Bissau, respectively. Genome-wide analysis and comparison with a global genomic dataset of M. tuberculosis Beijing strains, revealed the presence of two genomic clusters encompassing isolates from Portugal and Guinea-Bissau, GC1 (n = 121) and GC2 (n = 39), both of which bore SNP signatures compatible with the 100-32/B0/W148 and 94-32/Central Asia Outbreak clades, respectively. Moreover, GC2 encompasses a cross-border cluster between Portugal, Guinea-Bissau and Brazil thus supporting migration-associated introduction of MDR-TB and subsequent clonal expansion at the community-level. The comparison with global Beijing datasets demonstrates the global reach of the disease and its complex dissemination across multiple countries while in parallel there are clear microevolutionary trajectories towards extensively drug resistant TB.
- Avaliação da exposição das mulheres portuguesas em idade fértil a mercúrio: a perspetiva da biomonitorização humanaPublication . Santiago, Susana; Namorado, Sónia; Dias, Carlos Matias; Martins, Carla; Santos, Mariana; Castanheira, Isabel; Carvalho, Cristina; Assunção, RicardoPrivilegiado pela sua situação geográfica, Portugal tem como tradição alimentar o consumo de peixe. Contudo, este consumo está também associado à presença de mercúrio, na forma de metilmercúrio. A elevada suscetibilidade de alguns grupos populacionais a este composto, nomeadamente as mulheres grávidas pelas consequências desta exposição para os fetos, torna imperativo conhecer o risco destes grupos populacionais. Assim, o presente estudo, através de uma abordagem de biomonitorização humana, teve como objetivo principal avaliar a exposição das mulheres portuguesas em idade fértil ao mercúrio. Foram selecionadas aleatoriamente 300 mulheres em idade fértil (25-44 anos) participantes no Inquérito Nacional de Saúde com Exame Físico (INSEF), um estudo transversal de prevalência representativo a nível nacional e regional, e estimada a sua exposição a mercúrio através da determinação do teor de mercúrio total (THg) em amostras de sangue total por espectrofotometria de absorção atómica com decomposição térmica e amalgamação. Os resultados obtidos revelaram a presença de mercúrio em 298 amostras, com valores entre 0,6 e 32,0μg/L, e um valor médio de 5,9 ± 4,2μg/L. Verificou-se que 48% das amostras apresentaram valores de concentração de mercúrio superiores a 5,0μg/L e cerca de 13% apresentaram valores superiores a 10,0μg/L, representando, por isso, um risco de danos para a saúde. Com base nos resultados obtidos, é recomendável reduzir a exposição das mulheres portuguesas em idade fértil ao mercúrio, nomeadamente, se este corresponder a um período em que se planeie gravidez, por forma a prevenir potenciais consequências para a saúde. Estratégias de informação e comunicação do risco deverão ser desenvolvidas, testadas e implementadas em Portugal, por forma a contribuir para escolhas mais saudáveis e evitar a exposição a mercúrio.
- Hemocromatose hereditária associada ao gene HFE: resultados do diagnóstico molecular, correlação genótipo-fenótipo e importância da qualidade laboratorialPublication . Fonseca, Pedro; Loureiro, Pedro; Gomes, Susana; Faustino, Paula; Gonçalves, JoãoA hemocromatose hereditária (HH) associada ao gene HFE, dado ser uma doença autossómica recessiva com penetrância incompleta, deve obedecer a uma estratégia de análise molecular que compreenda, em primeiro lugar, a pesquisa das alterações moleculares que ocorrem mais frequentemente no referido gene (p.H63D e p.C282Y). Deve dar-se prioridade à pesquisa da alteração p.C282Y já que esta, quando presente em homozigotia, não havendo outros fatores de risco associados, permite confirmar a doença em indivíduos com fenótipo clínico sugestivo de HH e/ou apresentam biomarcadores séricos indicadores de sobrecarga em ferro, nomeadamente saturação da transferrina e ferritina elevadas. Neste trabalho, o estudo molecular de 1838 doentes com parâmetros clínicos e/ou bioquímicos relacionados com HH, revelou a presença de homozigotia para a alteração p.C282Y em 4% dos indivíduos analisados, valor muito acima do estimado para a população em geral (~0,09%) enquanto que a homozigotia para p.H63D foi de 7,9%, o qual corresponde a duas vezes o valor previsto para a população em geral (~4%). Ou seja, estes resultados, sustentam que a referida pesquisa, antecedida de aconselhamento genético, deverá ser realizada para confirmar (em indivíduos com índices bioquímicos de sobrecarga em ferro) a suspeita de HH. O diagnóstico molecular antecedido da ocorrência dos sintomas graves da HH, permite antecipar a vigilância clínica, prevenindo a progressão da doença para as manifestações mais graves que incluem, por exemplo, cirrose e carcinoma hepatocelular. Complementarmente, valoriza-se também a importância da participação dos laboratórios em ensaios de avaliação externa da qualidade, o que permite melhorar o desempenho dos mesmos no âmbito da genotipagem, interpretação de resultados e qualidade dos relatórios.