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- Contaminação do ar no interior de edifícios não residenciais por partículas PM10 e PM2,5 (2017-2022)Publication . Cano, Manuela; Júlio, Cláudia; Pires, Ana Filipa; Aguiar, Fátima; Pais, Aida; Branco, Patrícia; Rosa, Nuno; Nogueira, AnaIntrodução: As partículas são um dos poluentes mais relevantes para a saúde humana. A sua origem pode ser natural (sais marinhos, cinzas vulcânicas, solo, pólen) ou antropogénica, resultante principalmente de processos de combustão. Nas últimas décadas, o foco tem recaído sobre o seu diâmetro aerodinâmico uma vez que está relacionado com o seu transporte e deposição no trato respiratório e a regulamentação tem incidido especialmente naquelas com diâmetro aerodinâmico igual ou inferior a 2,5 μm (PM2,5) e/ou a 10 μm (PM10). Em 2006 foi publicada em Portugal a primeira legislação relativa à qualidade do ar interior que obrigava à determinação de PM10, tendo sido estabelecido um valor de referência de 150 μg/m3. Com base na evidência científica, as sucessivas alterações na legislação, em 2013 e 2021, obrigaram igualmente a determinação de PM2,5 e adotaram como limiares de proteção valores consideravelmente mais baixos de 50 μg/m3 para as PM10 e de 25 μg/m3 para as PM2,5. Atualmente a Portaria n.º 138-G/2021, obriga à monitorização da qualidade do ar interior com a determinação de parâmetros que incluem as PM2,5 e PM10 mantendo os limiares de proteção referidos. A poluição do ar interior é reconhecida como um importante risco ambiental para a saúde pública, sendo que os níveis de poluentes no interior dos edifícios podem ser duas a cinco vezes superiores aos níveis exteriores (WHO, 2010). Objetivo: Pretende-se com este estudo dar um panorama da poluição do ar interior por partículas em locais de trabalho sem fontes específicas de contaminação. Metodologia: Ao longo de 6 anos colheram-se amostras de ar, em locais de trabalho, para determinação de partículas PM10 e PM2,5 utilizando amostradores SKC-PEM-PM10 e SKC-PEM-PM2,5, respetivamente, e filtros de PTFE de 37mm (SKC) com recurso a bombas ajustadas a um caudal de 4 L/min., num total de 6 horas, seguida de análise por gravimetria com balança digital Cahn, C31 Microbalance pelo método EPA-IP10A (1990). Foram igualmente colhidas amostras de ar no exterior para referência. Resultados: A concentração média de PM2,5 obtida nas 730 amostras de ar foi de 17 μg/m3 (4–392 μg/m3) que apesar de inferior à média de 73 amostras do exterior - 22 μg/m3 (7–139 μg/m3) – 13% destas excederam o limiar de proteção de 25 μg/m3. Paralelamente, colheram-se 727 amostras para determinação de PM10, tendo-se obtido uma concentração média de 25 μg/m3 (4–622 μg/m3) que apesar de inferior à média de 74 amostras do exterior - 44 μg/m3 (8–540 μg/m3) - excedem em 9% o limiar de proteção de 50 μg/m3. Conclusões: Os resultados indicam que, apesar regulamentação, nem sempre são cumpridos os valores de referência, seja pela contaminação do ar interior com partículas do exterior, particularmente zonas de tráfego intenso, seja pela deficiente manutenção dos equipamentos de ventilação, seja, ainda, pela existência de fontes específicas, designadamente papel, arquivo aberto, etc. A monitorização regular da qualidade do ar interior é fundamental na deteção precoce de níveis elevados de poluentes, com origem em fontes de contaminação específicas, e na tomada de medidas de mitigação com vista à proteção da saúde humana, através do controlo da exposição dos ocupantes. Salienta-se que, em edifícios de habitação menos controlados, com aquecimento e cocção de alimentos baseados na combustão, serão expectáveis concentrações consideravelmente superiores.
- Occupational studies developed in Portugal in the scope of HBM4EU – Main results and way forwardPublication . Martins, Carla; Ribeiro, Edna; Ladeira, Carina; Pinhal, Herminia; Nogueira, Ana; Reis, Silvia; Louro, Henriqueta; Silva, Maria João; Viegas, SusanaIntroduction: Within the EU human biomonitoring initiative (HBM4EU), targeted national studies on occupational settings, where exposure to chemicals could occur, were performed. These studies aimed to provide information on occupational exposure to chemicals using biomonitoring approaches to support the implementation of new risk management measures (RMM) and policy actions at national and European levels. Methods: Cross-sectional studies were performed in two occupational settings: i) a setting with plating, welding and painting activities, targeting exposure to chromium VI [Cr(VI)]; and ii) a setting dedicated to processing of electronic waste (e-waste), targeting exposure to metals. Both studies included a control group obtained from the Portuguese general population, employed in different companies with no known exposure to Cr(VI) or involvement on tasks related with recycling of e-waste. Studies enrolled 50 workers and 27 controls (chromates study) and 26 workers and 12 controls (e-waste study). Spot urine samples were collected in the beginning and the end of the work week, and concentrations of metals were determined. Protocols were submitted to Ethics Committees with the approvals being granted before recruiting the studies’ participants (companies and workers). Descriptive statistical analysis was performed as well as inferential analysis (Wilcoxon test, Mann–Whitney test, and Kruskal–Wallis test). Results: Regarding chromates study, median levels obtained for workers were 0.33 µg/g crea for Cr, in the post-shift samples. Results showed that painters presented higher levels of Cr in post-shift urine samples than the control group (p<0.05), although not presenting differences between pre-shift and post-shift urine samples (p>0.05). Platers showed higher levels of Cr in post-shift urine samples when compared to pre-shift samples (p<0.05). Welders did not present statistically significant differences between pre- and post-shift samples and in relation to control group (p>0.05). Regarding RMM, the use of respiratory protection equipment by painters was identified as a promotor of lower exposures (p<0.05). Regarding e-waste study, median levels obtained for workers were 0.21, 0.43 and 12.70 µg/g crea for cadmium (Cd), mercury (Hg) and lead (Pb), respectively, in the post-shift samples. Statistically significant differences between workers and control group were found for urinary Pb levels (p<0.05), and no significant differences were found between pre- and post-shift urine samples for Cd, Hg and Pb. Conclusions: The results obtained showed that workers are exposed to metals in these occupational settings, thus, RMM in place need to be improved. Based on the results obtained, the implementation and enforcement of new regulatory actions should be considered. The results also claim attention for the need of updating the occupational limit values as it is being discussed at European level for Cr(VI), Pb and Cd due to the related health effects [3]. The differentiated data provided by biomonitoring tools demonstrated that these should be used more often to perform exposure assessment.
- ReporTree: a surveillance-oriented tool to strengthen the linkage between pathogen genetic clusters and epidemiological dataPublication . Mixão, Verónica; Pinto, Miguel; Sobral, Daniel; Di Pasquale, Adriano; Gomes, João Paulo; Borges, VítorBackground: Genomics-informed pathogen surveillance strengthens public health decision-making, playing an important role in infectious diseases' prevention and control. A pivotal outcome of genomics surveillance is the identification of pathogen genetic clusters and their characterization in terms of geotemporal spread or linkage to clinical and demographic data. This task often consists of the visual exploration of (large) phylogenetic trees and associated metadata, being time-consuming and difficult to reproduce. Results: We developed ReporTree, a flexible bioinformatics pipeline that allows diving into the complexity of pathogen diversity to rapidly identify genetic clusters at any (or all) distance threshold(s) or cluster stability regions and to generate surveillance-oriented reports based on the available metadata, such as timespan, geography, or vaccination/clinical status. ReporTree is able to maintain cluster nomenclature in subsequent analyses and to generate a nomenclature code combining cluster information at different hierarchical levels, thus facilitating the active surveillance of clusters of interest. By handling several input formats and clustering methods, ReporTree is applicable to multiple pathogens, constituting a flexible resource that can be smoothly deployed in routine surveillance bioinformatics workflows with negligible computational and time costs. This is demonstrated through a comprehensive benchmarking of (i) the cg/wgMLST workflow with large datasets of four foodborne bacterial pathogens and (ii) the alignment-based SNP workflow with a large dataset of Mycobacterium tuberculosis. To further validate this tool, we reproduced a previous large-scale study on Neisseria gonorrhoeae, demonstrating how ReporTree is able to rapidly identify the main species genogroups and characterize them with key surveillance metadata, such as antibiotic resistance data. By providing examples for SARS-CoV-2 and the foodborne bacterial pathogen Listeria monocytogenes, we show how this tool is currently a useful asset in genomics-informed routine surveillance and outbreak detection of a wide variety of species. Conclusions: In summary, ReporTree is a pan-pathogen tool for automated and reproducible identification and characterization of genetic clusters that contributes to a sustainable and efficient public health genomics-informed pathogen surveillance. ReporTree is implemented in python 3.8 and is freely available at https://github.com/insapathogenomics/ReporTree .
- Avaliação da Segurança de Nanomateriais de Celulose InovadoresPublication . Vital, Nádia; Silva, Maria João; Kranendonk, M.; Louro, HenriquetaIntrodução: Na sociedade atual verifica-se uma preocupação acrescida com a exposição humana a materiais que, embora previamente considerados seguros, poderão revelar-se perigosos para a saúde quando usados à nanoescala. Este poderá ser o caso dos nanomateriais de celulose (CNMs), produzidos de fontes naturais, explorados para diversas aplicações, em particular na indústria alimentar. Podem ser usados como aditivos alimentares (e.g. estabilizadores ou espessantes), fonte de fibra não calórica, ou em embalagens alimentares(1). Antecipa-se um aumento da exposição humana, por ingestão de alimentos contendo CNMs, contaminados através das embalagens alimentares ou por acumulação no ambiente(1). Porém, o conhecimento sobre a sua segurança, em particular os seus efeitos no trato gastrointestinal (GIT), permanece limitado(1). É imperativo estudar os seus potenciais efeitos no organismo após ingestão oral, antes da sua colocação no mercado, avaliando a sua segurança com base nas recomendações da Autoridade Europeia para a Segurança Alimentar(2). Objetivos: Este trabalho visou investigar os potenciais efeitos de dois CNMs no GIT, através da avaliação de potenciais efeitos citotóxicos e genotóxicos em dois modelos celulares intestinais humanos (Caco-2 e HT29-MTX-E12). Metodologia: Estudaram-se duas celuloses micro/nanofibriladas (CNFs) inovadoras, produzidas a partir de polpa kraft branqueada industrial de Eucalyptus globulus. A citotoxicidade foi avaliada pelos ensaios MTT e clonogénico, enquanto a genotoxicidade foi analisada pelos ensaios do micronúcleo e do cometa. Resultados: Não se observou efeitos citotóxicos após exposição aos CNFs nas concentrações testadas, independentemente da linha celular utilizada. Também, não se observaram alterações cromossómicas nas duas linhas celulares expostas a cada CNFs através do ensaio do micronúcleo. Porém, os resultados do ensaio do cometa revelaram a indução de quebras no DNA das células HT29-MTX-E12, após 3h e 24h de exposição para as duas CNFs. Esse efeito foi inconsistente nas células Caco-2 após um tratamento semelhantes com as mesmas amostras. Conclusões: Os resultados obtidos suscitam preocupação sobre a segurança destas CNMs, pois observou-se um efeito genotóxico que deverá continuar a ser investigado, através de testes complementares. Destaca-se a importância de investigar os efeitos genotóxicos, associados a um potencial efeito carcinogénico, para além de uma simples análise da sua citotoxicidade, como é frequentemente utilizada para afirmar a biocompatibilidade de CNMs. Assim, deverá promover-se novas metodologias de produção, uma maior purificação ou uma alteração das propriedades físico-químicas destas CNFs, para reduzir a sua toxicidade, prevenindo, assim, eventuais efeitos nefastos na saúde humana. Referências: 1. Vital N, Ventura C, Kranendonk M, Silva MJ, Louro H. Toxicological Assessment of Cellulose Nanomaterials: Oral Exposure. Nanomaterials [Internet]. 2022 Sep 27; 12(19): 3375 2. EFSA Scientific Committee. Guidance on risk assessment of nanomaterials to be applied in the food and feed chain: human and animal health. EFSA Journal [Internet]. 2021 Aug 3; 19(8):6768
- Contaminação de superfícies por fungos em habitação: Um risco para a saúdePublication . Júlio, Cláudia; Rosa, Nuno; Almeida, Cristina; Cano, ManuelaIntrodução: Existe suficiente evidência epidemiológica de que os ocupantes de edifícios com problemas de humidade excessiva e contaminação de superfícies por fungos, têm um risco acrescido de desenvolver sintomas respiratórios, infeções respiratórias e de exacerbar crises de asma. No interior de edifícios, a relativa abundância de diferentes espécies de fungos tende a seguir o padrão exterior, embora as concentrações interiores sejam geralmente mais baixas. Segundo o Organização Mundial de Saúde a existência de crescimento visível de bolores em superfícies é uma forte evidência da exposição humana a estes agentes (1). Objetivo: O objetivo deste estudo é evidenciar que o aparecimento de fungos em superfícies está relacionado com o aumento da concentração de esporos suspensos no ar e/ou de colónias fúngicas nas superfícies e que as espécies isoladas são, na sua maioria, semelhantes. Metodologia: Foram colhidas amostras de ar no exterior (referência) e no interior de uma habitação T2 situada no piso térreo onde, na sequência de uma rutura de canalização de águas residuais, se observou o desenvolvimento visível de bolor nas paredes, em novembro de 2022. A amostragem em duplicado de fungos viáveis no ar foi realizada utilizando o amostrador MAS-100 e placas de Agar Extrato de Malte suplementadas com cloranfenicol. Nas superfícies foram realizadas amostragens de fungos utilizando dois métodos, placas de contacto e zaragatoas posteriormente inoculadas em Agar de Extrato de Malte suplementadas com cloranfenicol. Resultados: As concentrações de fungos obtidas no ar interior da habitação, quarto e escritório, foram superiores a 10512 UFC/m3 ultrapassando as concentrações do exterior de 1356 UFC/m3. Das colónias isoladas no interior 46% têm potencial patogénico. Foram encontradas 17 estirpes diferentes (7 espécies e 10 géneros) no interior, incluindo no ar e nas superfícies e 13 (3 espécies e 10 géneros) no exterior. Conclusões: Os resultados revelaram que as concentrações de fungos obtidas no interior da habitação são no mínimo 8 vezes superiores às do Exterior, tomadas como referência. A presença de espécies como Aspergillus glaucus, Exophiala dermatitidis, Conibiobolus coronatus apenas presentes nas amostras do interior, apresentam potencial patogénico, podendo causar osteomielite e artrite séptica, infeções cutâneas ou pulmonares, doença rinofacial crónica (2, 3). Somos levados a concluir que os esporos fúngicos encontrados no ar interior têm origem nas superfícies contaminadas em virtude do excesso de água. O ar interior é um importante determinante de saúde para os ocupantes pelo que é urgente identificar, mitigar e prevenir situações de humidade persistente que potenciam o crescimento microbiano em superfícies.