Caracterização fenotípica e genotípica de isolados de Salmonella Typhi e Paratyphi em Portugal, entre janeiro de 1994 e maio de 2024

Henriques, Ana Margarida; Caeiro, Raquel; Tomás, Alexandra; Silveira, Leonor; Pista, Angela

http://hdl.handle.net/10400.18/9221

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Authors

Henriques, Ana Margarida

Abstract(s)

Os serotipos Typhi e Paratyphi causam infeções sistémicas graves, sendo crucial a administração de antibioterapia adequada. No entanto, o aumento crescente da taxa de multirresistência aos antibióticos, especialmente no caso de Salmonella Typhi, dificulta a escolha dos antibióticos a administrar. Em Portugal, os casos de febre tifoide e paratifoide são raros. Com este estudo pretendeu-se identificar e caracterizar os perfis de resistência aos antibióticos de isolados de Salmonella Typhi e Salmonella Paratyphi A, B e C, entre janeiro de 1994 e maio de 2024, e avaliar a sua proximidade genética. Após confirmação do serotipo, 86 isolados foram submetidos a testes de suscetibilidade aos antibióticos e sequenciação total do genoma. Neste estudo, 60,5% dos isolados foram resistentes a pelo menos um antibiótico, dos quais 15,4% eram multirresistentes. Entre 1994-2016 todos os isolados foram suscetíveis, mas a partir de 2017 foi possível observar uma tendência crescente na resistência aos antibióticos, especialmente para S. Typhi. A resistência à pefloxacina foi a mais frequente, seguida da resistência ao ácido nalidíxico, ampicilina, trimetoprim, sulfametoxazol e cloranfenicol. Dos diversos genes de resistência identificados, destaca-se a presença do gene blaCTX- M-15 num isolado de Salmonella Typhi de 2020, resistente a antibióticos de importância crítica. Foram identificados 11 pequenos clusters. Apesar dos serotipos tifoides e paratifoides não serem endémicos em Portugal, é essencial manter uma vigilância laboratorial contínua, de forma a caracterizar os isolados circulantes em Portugal e detetar potenciais surtos.

Typhi and Paratyphi serovars are responsible for severe systemic infections that require appropriate antimicrobial therapy. However, the increasing rate of multidrug resistance, particularly in Salmonella Typhi, complicates therapeutics. In Portugal, typhoid and paratyphoid fever cases are rare. This study aimed to identify and to characterize the antibiotic resistance profiles of Salmonella Typhi and Salmonella Paratyphi A, B, and C isolates from 1994 to May 2024, and to assess their genetic proximity. Af ter serotyping confirmation, 86 isolates underwent antimicrobial susceptibilit y testing and Whole Genome Sequencing. In this study, 60.5% of the isolates were resistant to at least one antibiotic, of which 15.4% were multidrug-resistant. Between 1994 and 2016, all isolates were susceptible, but an increasing trend in antibiotic resistance was observed af ter 2017, par ticularly in S. Typhi. Resistance to pefloxacin was most frequent, followed by nalidixic acid, ampicillin, trimethoprim, sulphamethoxazole, and chloramphenicol. Among the resistance genes identified, blaCTX-M-15 gene was found in a S. Typhi isolate from 2020, resistant to critically impor tant antibiotics. Eleven small clusters were identified. Although typhoid and paratyphoid serotypes are not endemic in Por tugal, continuous laborator y surveillance is essential to characterize circulating isolates and to detect potential outbreaks.