Repository logo
 
Publication

Resistência de Clostridium difficile do ribotipo 017 ao imipenemo: contributo da sequenciação do genoma completo

2018-12Journal article Open access
Simple item page
dc.contributor.authorIsidro, Joana
dc.contributor.authorSantos, Andrea
dc.contributor.authorNunes, Alexandra
dc.contributor.authorBorges, Vítor
dc.contributor.authorSilva, Catarina
dc.contributor.authorVieira, Luís
dc.contributor.authorMendes, Aristides L
dc.contributor.authorSerrano, Mónica
dc.contributor.authorHenriques, Adriano O
dc.contributor.authorGomes, João Paulo
dc.contributor.authorOleastro, Mónica
dc.date.accessioned2019-01-04T18:12:41Z
dc.date.available2019-01-04T18:12:41Z
dc.date.issued2018-12
dc.description.abstractA infeção por Clostridium difficile é a principal causa de diarreia infeciosa associada aos cuidados de saúde. Neste estudo, caracterizámos um conjunto de estirpes clínicas de Clostridium difficile, provenientes de diversos hospitais portugueses, com o objetivo de estudar a resistência aos carbapenemos neste agente patogénico. Um total de 191 estirpes clínicas, isoladas entre 2012 e 2015 de 15 hospitais em Portugal, foram incluídas no estudo; a suscetibilidade ao imipenemo foi determinada por um método de gradiente de difusão em agar. Foram selecionadas estirpes sensíveis e resistentes ao imipenemo, para estudos fenotípicos adicionais e para contributo da sequenciação do genoma completo. A resistência ao imipenemo foi detetada em 24 (12,6%) das estirpes, 22 das quais pertencentes ao ribotipo (RT) 017 (apenas toxina B positivo), todas provenientes do mesmo hospital, durante o período em estudo, e com perfil de multiresistência. Pela análise dos dados de sequenciação dos genomas, foram identificadas duas substituições de aminoácidos (Ala555Thr e Tyr721Ser) nos domínios funcionais de duas enzimas envolvidas na síntese do peptidoglicano (penicillin-binding proteins - PBP). Uma PBP adicional foi também identificada nas estirpes RT017. Este estudo descreve pela primeira vez alterações em PBPs como base genética provável da resistência ao imipenemo em C. difficile.pt_PT
dc.description.abstractClostridium dif ficile is a major cause of healthcare-associated infections. Here, we characterized C. dif ficile strains isolated in Por tuguese hospitals, in order to search for impenem resistance and the underlying genetic determinants. Imipenem susceptibility testing by agar gradient dif fusion was per formed on 191 C. dif ficile strains, isolated from 15 portuguese hospitals, between 2012-2015. Some of the imipenem-resistant and imipenem-susceptible strains were selected for downstream phenotypic analyses and for whole genome sequencing (WGS). Resistance to imipenem was detected in 24 (12.6 %) strains, 22 of which were ribotype (RT) 017 strains, only positive for toxin B, isolated in the same hospital, and presenting resistance to several other antibiotics. Through analysis of WGS data, two amino acid changes (Ala555Thr and Tyr721Ser) targeting the transpeptidase domain of two penicillin-binding proteins (PBP) were identified. An additional PBP was also identified in this ribotype. We describe, for the first time, mutations in PBP-encoding genes as the probable genetic basis for C. dif ficile imipenem resistance.pt_PT
dc.description.sponsorshipEste trabalho foi financiado pelo INSA (projeto 2016DDI1284) e pela Fundação para a Ciência e Tecnologia (bolsa de investigação no âmbito do projeto Pest-C/EQB/LA0006/2011; programa IF IF/00268/2013/CP1173/CT0006, a MS; bolsa de doutoramento PD/BD/105738/2014, a ALM).pt_PT
dc.description.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionpt_PT
dc.identifier.citationBoletim Epidemiológico Observações. 2018;7(Supl 10):1-50pt_PT
dc.identifier.issn0874-2928
dc.identifier.issn2182-8873 (em linha)
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.18/5692
dc.language.isoporpt_PT
dc.publisherInstituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IPpt_PT
dc.relationCharacterization of Clostridium Difficile: a genetic and biochemistry approach
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/pt_PT
dc.subjectClostridium difficilept_PT
dc.subjectRibotipo 017pt_PT
dc.subjectResistência ao Imipenemopt_PT
dc.subjectDiagnósticopt_PT
dc.subjectInfecções Gastrointestinaispt_PT
dc.subjectDoenças Infecciosaspt_PT
dc.subjectSequenciação de Nova Geraçãopt_PT
dc.subjectSequenciação do Genoma Completopt_PT
dc.subjectSaúde Públicapt_PT
dc.subjectPortugalpt_PT
dc.titleResistência de Clostridium difficile do ribotipo 017 ao imipenemo: contributo da sequenciação do genoma completopt_PT
dc.title.alternativeResistance of Clostridium difficile from ribotype 017 to imipenem: contribution of the whole genome sequencingpt_PT
dc.typejournal article
dspace.entity.typePublication
oaire.awardTitleCharacterization of Clostridium Difficile: a genetic and biochemistry approach
oaire.awardURIinfo:eu-repo/grantAgreement/FCT/COMPETE/PEst-C%2FEQB%2FLA0006%2F2013/PT
oaire.awardURIinfo:eu-repo/grantAgreement/FCT//PD%2FBD%2F105738%2F2014/PT
oaire.citation.conferencePlaceLisboa, Portugalpt_PT
oaire.citation.endPage16pt_PT
oaire.citation.issueSupl 10pt_PT
oaire.citation.startPage11pt_PT
oaire.citation.titleBoletim Epidemiológico Observaçõespt_PT
oaire.citation.volume7pt_PT
oaire.fundingStreamCOMPETE
project.funder.identifierhttp://doi.org/10.13039/501100001871
project.funder.identifierhttp://doi.org/10.13039/501100001871
project.funder.nameFundação para a Ciência e a Tecnologia
project.funder.nameFundação para a Ciência e a Tecnologia
rcaap.rightsopenAccesspt_PT
rcaap.typearticlept_PT
relation.isProjectOfPublication0c766506-6307-4045-921c-39b8158f5e3c
relation.isProjectOfPublication6b1b9a19-262e-4e87-8d79-6925673471e6
relation.isProjectOfPublication.latestForDiscovery6b1b9a19-262e-4e87-8d79-6925673471e6

Files

Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
Boletim_Epidemiologico_Observacoes_NEspecia10-2018_artigo3.pdf
Size:
577.17 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description:
Download

Collections

DDI - Artigos em revistas nacionais
DGH - Artigos em revistas nacionais