Characterization of Clostridium Difficile: a genetic and biochemistry approach

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Imipenem Resistance in Clostridium difficile Ribotype 017, Portugal

Publication . Isidro, Joana; Santos, Andrea; Nunes, Alexandra; Borges, Vítor; Silva, Catarina; Vieira, Luís; Mendes, Aristides L.; Serrano, Mónica; Henriques, Adriano O.; Gomes, João Paulo; Oleastro, Mónica

We describe imipenem-resistant and imipenem-susceptible clinical isolates of Clostridium difficile ribotype 017 in Portugal. All ribotype 017 isolates carried an extra penicillin-binding protein gene, pbp5, and the imipenem-resistant isolates had additional substitutions near the transpeptidase active sites of pbp1 and pbp3. These clones could disseminate and contribute to imipenem resistance.

2018-04Journal article

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Resistência de Clostridium difficile do ribotipo 017 ao imipenemo: contributo da sequenciação do genoma completo

Publication . Isidro, Joana; Santos, Andrea; Nunes, Alexandra; Borges, Vítor; Silva, Catarina; Vieira, Luís; Mendes, Aristides L; Serrano, Mónica; Henriques, Adriano O; Gomes, João Paulo; Oleastro, Mónica

A infeção por Clostridium difficile é a principal causa de diarreia infeciosa associada aos cuidados de saúde. Neste estudo, caracterizámos um conjunto de estirpes clínicas de Clostridium difficile, provenientes de diversos hospitais portugueses, com o objetivo de estudar a resistência aos carbapenemos neste agente patogénico. Um total de 191 estirpes clínicas, isoladas entre 2012 e 2015 de 15 hospitais em Portugal, foram incluídas no estudo; a suscetibilidade ao imipenemo foi determinada por um método de gradiente de difusão em agar. Foram selecionadas estirpes sensíveis e resistentes ao imipenemo, para estudos fenotípicos adicionais e para contributo da sequenciação do genoma completo. A resistência ao imipenemo foi detetada em 24 (12,6%) das estirpes, 22 das quais pertencentes ao ribotipo (RT) 017 (apenas toxina B positivo), todas provenientes do mesmo hospital, durante o período em estudo, e com perfil de multiresistência. Pela análise dos dados de sequenciação dos genomas, foram identificadas duas substituições de aminoácidos (Ala555Thr e Tyr721Ser) nos domínios funcionais de duas enzimas envolvidas na síntese do peptidoglicano (penicillin-binding proteins - PBP). Uma PBP adicional foi também identificada nas estirpes RT017. Este estudo descreve pela primeira vez alterações em PBPs como base genética provável da resistência ao imipenemo em C. difficile.

2018-12Journal article

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