DEP - Teses de doutoramento
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- Antimicrobial Resistance and Zoonotic Bacteria: Assessing interventions, risk factors and the occurrence of antimicrobial resistance in the food chain production in PortugalPublication . Costa, Miguel Mendes da; Leite, Andreia; d'Anjo, Maria CaraBackground: Resistant microorganisms that spread in the food system are a major threat to animal health and public health since they are a potential pathway of transmission to humans. This thesis evaluates: (i) antimicrobial resistance (AMR) prevalence and associated risk factors in the Portuguese food system (ii) effectiveness of interventions designed to reduce and adequate antimicrobial usage in animal production and tackle AMR. Methods: Portuguese AMR surveillance program on animals and food products data, 2014-2019, were used to estimate prevalence of AMR in Escherichia coli, Campylobacter and Salmonella samples, factors associated with Salmonella resistance, and AMR profiles. Logistic regression and clustering methods were applied. Effectiveness was assessed in a systematic review with meta-analysis. Articles were identified on PubMedTM, ScopusTM, The Cochrane LibraryTM, Web of ScienceTM, and grey literature on DANS EASYTM, WorldCatTM, RCAAPTM. Effectiveness was estimated by intervention, bacterial species, production type and population through fixed and random-effects models. Results: High prevalence of Salmonella resistance was observed, especially during summer and in post farm-stages to most antimicrobials and in summer and farms to fluoroquinolones and quinolones-F(Q). Salmonella F(Q) resistance was associated with broilers. Clusters suggested an escalating multi-drug resistance (MDR) behavior from farm to post-farm stages. Our review indicates that organic and antimicrobial-free farms, and group treatment restrictions lead to AMR reduction. Conclusions: Further attention is needed in the Portuguese food system regarding AMR behavior in particular in post-farm stages due to the potential source of MDR bacteria. Our findings support policy- and decision-making on effective interventions to reduce AMR. Keywords: food-producing animals; antimicrobial resistance; zoonotic bacteria; surveillance; food security; One Health.
- Measurement error in self-reported risk factors for cardiovascular disease: results from the first Portuguese National Health Examination SurveyPublication . Kislaya, Irina; Nunes, Baltazar; Tolonen, HannaABSTRACT - Accurate data on cardiovascular disease risk factors are essential for the design and evaluation of public health policies. Currently, self-reported data on hypertension and hypercholesterolemia constitute a primary data source for population health monitoring at European and national level. This thesis aimed to evaluate accuracy of self-reported data on hypertension and hypercholesterolemia, to quantify, and to correct measurement error bias using data from the first Portuguese Health Examination Survey (INSEF). Measurements of blood pressure and total cholesterol concentrations were used as gold-standards to estimate measurement error bias, sensitivity and specificity of selfreports, investigate error impact on outcome-exposure associations and illustrate application of multiple imputation for bias correction. Despite all the efforts to limit the error through design and fieldwork procedures, self-reported data underestimated prevalence of hypertension and hypercholesterolemia in Portuguese population. Being unequally distributed among socioeconomic subgroups, measurement errors resulted in underestimation of socioeconomic inequalities in younger and overestimation in older age groups. The study results highlight the importance of measurement error bias analysis when using self-reported data. Results from multiple imputation show the approach feasibility for measurement error bias adjustment in prevalence estimates and outcome-exposure associations when individual-level validation data is available. Health statistics on cardiovascular disease risk factors derived from self-reports should be used with caution. Integration of objective measurements in large-scale health surveys will improve the accuracy of epidemiological information on hypertension and hypercholesterolemia. RESUMO - Informação epidemiológica de qualidade sobre os fatores de risco para doenças cardiovasculares é essencial para formulação e avaliação das políticas de saúde. Atualmente, os dados autoreportados sobre hipertensão e hipercolesterolemia constituem uma fonte primária de informação para monitorização da saúde da população a nível europeu e nacional. O objetivo desta tese é avaliar a qualidade dos dados autoreportados sobre hipertensão e hipercolesterolemia, quantificar e corrigir o viés de medição assocados à informação autoreportada utilizando os dados do primeiro Inquérito Nacional de Saúde com Exame Físico (INSEF). Considerando medições diretas da tensão arterial e do colesterol total como padrão, estimou-se a sensibilidade e a especificidade dos dados autoreportados, avaliou-se o impacto do erro da medição nas estimativas da prevalências e medidas de associação. Adicionalmente, o trabalho desenvolvido ilustrou a aplicação de imputação múltipla para correção de viés de medição. Os dados autoreportados subestimaram a prevalência de hipertensão e hipercolesterolemia na população portuguesa comparativamente às medições diretas. O grau diferencial de viés por estatuto socioeconómico leva a subestimação das desigualdades socioeconómicas nos mais jovens e superestimação nos grupos com a idade mais avançada. Os resultados do estudo realçam a importância da análise de viés associados à medição na utilização dos dados autoreportados. Os resultados da imputação múltipla indicam a viabilidade desta estratégia no ajuste das estimativas da prevalência e medidas de associação quando estão disponíveis a nível individual os dados das medições diretas. As estatísticas de saúde derivadas dos dados autoreportados devem ser usadas com cautela. A integração das medições objetivas nos inquéritos de saúde de base populacional permitirá obter informação epidemiológica de melhor qualidade para monitorização da hipertensão e hipercolesterolemia.
- Ciência de dados e politicas públicas de saúde: exemplos práticosPublication . Santos, Joana Raquel Raposo dos; Chiavegatto Filho, Alexandre Dias PortoA ciência de dados é uma área do conhecimento impulsionada pela mudança do atual paradigma tecnológico e cientifico, que decorre do aumento do volume de dados, tipo, acesso, armazenamento e desenvolvimento computacional e tecnológico. Esse conhecimento tem permitido importantes avanços em vários setores, mas a contribuição da ciência de dados para as políticas públicas em saúde ainda encontra-se pouco explorada. Objetivo: Analisar se técnicas de ciência de dados, como algoritmos preditivos de inteligência artificial (machine learning), técnicas de clusterização de individuos e métodos causais para estudos observacionais podem contribuir para a área das políticas de saúde, identificando grupos-alvo para os quais programas e campanhas possam ser direcionados, permitindo uma alocação mais eficiente de recursos e contribuindo para a elaboração de medidas que auxiliem no desenho e avaliação de políticas públicas de saúde. Métodos: Foram utilizados dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde do Brasil (DATASUS) para caracterização sociodemográfica dos municípios brasileiros, e do Inquérito Nacional de Saúde de Portugal de 2014 para caracterizar a população residente em Portugal. Para a análise preditiva foram utilizados alguns dos algoritmos mais populares de machine learning, como regressão logística penalizada, random forest, gradient boosting trees e análises de agrupamento com componentes principais. Para a avaliação de um programa público de saúde (Mais Médicos) foram utilizados escores de propensão (propensity score) com pareamento. Resultados: Foram escritos um total de três artigos científicos, sendo que dois foram publicados e um encontra-se em revisão. O primeiro foi publicado na International Journal of Public Health, e trata-se de uma avaliação do Mais Médicos com métodos de escore de propensão. O escore permitiu um pareamento entre unidades municipais (n = 395) com uma boa performance, em que 86 das 97 covariáveis apresentaram um bom balanceamento (medido pela diferença média padronizada, inferior a 25%). O segundo artigo foi publicado na Health Policy and Technology e realizou uma análise de agrupamento de componentes principais para identificar grupos homogêneos entre indivíduos sem plano privado de saúde (n = 12.134). Foram identificados três agrupamentos de indivíduos (indivíduos de meia idade profissionalmente ativos, indivíduos envelhecidos com práticas saudáveis e aqueles psicologicamente vulneráveis), o que pode auxiliar na elaboração de políticas públicas direcionadas. O terceiro artigo encontra-se atualmente em avaliação e realizou uma análise preditiva de inteligência artificial (machine learning) para ausência laboral por motivos de doença com uma amostra populacional do Inquérito Nacional de Saúde (n=6.249), obtendo uma AUC de 0,67 pelo algoritmo de random forest. Conclusão: A ciência de dados pode ter um papel importante na melhoria da evidência em políticas públicas, especialmente no caso de superar dificuldades de abordagens mais tradicionais, como no estabelecimento de contrafactuais em estudos quase experimentais e por meio da realização de análises preditivas de machine learning para a alocação prioritária de recursos.
- Measuring the impact of influenza vaccination national strategy among the at risk Portuguese populationPublication . Machado, Ausenda; Nunes, Baltazar; Larrauri, AmparoYearly seasonal influenza vaccine is recommended to individuals with chronic conditions or aged ≥65 years (high-risk group). However, for these high-risk individuals, the vaccine coverage has been lower than targeted, vaccine effectiveness may be altered by age or presence of chronic conditions and the impact of the vaccination strategy is still unknown. With focus in the high-risk group, this thesis aimed contributing to the national influenza strategy by providing information on i) influenza vaccine coverage and associated factors; ii) vaccine effectiveness and iii) impact of influenza vaccination strategy at population level. Results indicate that the proportion of individuals with vaccine uptake for four consecutive seasons was only 27%. Age, having a chronic condition and use of health care were positively associated to vaccine uptake. Vaccine effectiveness was estimated in 52% against medically-attended influenza and 32% against influenza hospital admissions in the ones aged ≥65 years. The tested hypothesis of an effect modification of the vaccine by age or chronic conditions, was inconclusive, probably due to lack of power. The impact of influenza vaccination strategy indicate that on average, during the period 2014/15-2017/18, the strategy averted 715 primary care medically attended influenza; 1833 hospitalizations and 383 intra-hospital. The influenza vaccine strategy had consistent and positive benefit in the high-risk population. To maximize the impact, efforts should be conducted to increase the vaccine coverage and the results of this thesis could be used to design targeted strategies. The continuous monitoring of the vaccine effectiveness and population impact could contribute in this effort. RESUMO - A vacina contra a gripe é recomendada anualmente a indivíduos alto-risco de complicações, nomeadamente aqueles com doenças crónicas ou idade ≥65 anos. Contudo, a cobertura da vacina neste grupo de alto-risco é inferior à meta estabelecida, a efetividade pode ser modificada pela idade e pela doença crónica e o impacto da estratégia de vacinação é desconhecido. Com foco nos individuos de alto-risco, esta tese pretendeu contribuir para a estratégia de vacinação contra a gripe fornecendo informações sobre a i) cobertura vacinal e fatores associados, ii) efetividade da vacina e iii) impacto a nível populacional da estratégia de vacinação. Os resultados indicam que a proporção de indivíduos com toma da vacina nas 4 épocas foi de 27%. A idade, ter doença crónica e utilização de cuidados de saúde estavam positivamente associados à toma de vacina. A hipótese de modificação de efeito da vacina pela idade e comorbilidades foi inconclusiva, decorrente provavelmente da falta de potência do estudo. ). A efetividade da vacina foi estimada em 52% na redução de consultas e em 32% na redução de hospitalizações nos indivíduos com ≥65 anos. Por último, a estratégia de vacinação preveniu em média, durante o período em análise (2014/15-2017/18), 715 consultas, 1833 hospitalizações e 383 óbitos intra-hospitalares. A estratégia de vacinação contra a gripe teve benefícios positivos na população de alto-risco. Para maximizar este impacto devem ser realizados esforços para aumentar a cobertura e os resultados desta tese podem ser importantes no delineamento de intervenções direcionadas. A contínua monitorização da efetividade e do impacto da vacina na população poderiam contribuir para esse objetivo.
- Spatial Epidemiology of Cancer: data types, spatial aggregation and geographical patterns in mainland PortugalPublication . Roquette, Rita; Painho, Marco; Nunes, BaltazarThe importance of research on the spatial epidemiology of cancer has been progressively recognized and the number of studies in this field has been increasing steadily, having experienced significant growth over the last decade. Overall, spatial epidemiology is a comprehensive research area that covers a variety of subjects. Among those subjects, and particularly in the case of spatial epidemiology of cancer, one important topic is the level of spatial data aggregation. The analysis of individual data may present ethical data protection issues, so geographically-aggregated data are often used in epidemiological research. Conversely, the analysis of aggregated data also raises certain methodological issues, such as: a) the importance of calculating standardized rates (usually by sex and age) to allow for the comparison of different geographical units; b) the need to take into account the fact that the results obtained at a given level of geographical aggregation cannot be extrapolated as true for other levels of aggregation; and c) the possible existence of the “small numbers problem” and the relevance of using smoothed rates to try to solve it. This thesis takes a first look at this subject through a systematic review of the literature on the spatial epidemiology of cancer. The findings show that the questions which are considered most frequently in the literature consist of: a) the methodology used; b) the spatial distribution of cancer and its temporal evolution; and c) risk factors. The thesis then seeks to address these three aspects. In order to do that, several methodological issues related to the research of the spatial epidemiology of cancer are evaluated and the mortality distribution of all types of cancer is analyzed. Given the high rates of incidence and mortality due to colorectal cancer among the Portuguese population, this cancer type is taken as a case-study, and the distribution of its incidence and mortality is studied and compared with the distribution of the prevalence of the main risk factors. With regard to methodology, it is find that data aggregation at the municipality level makes it possible to obtain detailed information on the geographical distribution of cancer in mainland Portugal, and simultaneously address the small numbers problem. The use of statistical methods to calculate smoothed rates based on the spatial vicinity of the units under analysis also contributes to solving this latter problem. x Doctoral Programme in Information Management As far as cancer’s spatial distribution patterns are concerned, it is find significant heterogeneity across the municipalities of mainland Portugal, both when examining overall cancer mortality and when specifically looking at colorectal cancer incidence and mortality. Regarding the mortality distribution of all cancer types, it is find that the highest mortality rates tend to cluster around Oporto (on the north coast), Lisbon (on the west coast) and in the municipalities of southeast mainland Portugal. With respect to colorectal cancer, it are detected different patterns of incidence and mortality. The distribution of colorectal cancer incidence is more heterogeneous than that of colorectal cancer mortality. In addition, both colorectal cancer incidence and mortality exhibit especially high values for men in two municipalities in the center of mainland Portugal, which seems to call for a more detailed analysis of this area. In terms of risk factors, the following main risks, which have been identified as having a possible association with colorectal cancer, were considered: tobacco smoking; alcohol intake; and dietary behavior. Screening, as a secondary prevention measure aimed at the early detection of cancer and mortality reduction, was also considered in the analysis. However, data on these risk factors are representative only at much more aggregated geographic units, such as NUTS II. Therefore, a detailed analysis of association could not be performed. Finally, the natural background radiation in mainland Portugal was also analyzed, computing a mean by municipalities, and the conclusion is that its association with colorectal cancer is generally weak. This work points to a variety of interesting topics to study in future research, such as: a) to apply the same methodologies to other cancer types; b) to study the geographical association of risk factors, like socio-demographic and environmental risk factors, with cancer incidence and mortality; c) to test other spatial methods in the research of spatial epidemiology of cancer in Portugal, like, for an instance, kriging or multilevel models; and d) to establish suitable methodologies to study spatial epidemiology of cancer in the Portuguese islands.
- Violence against older adults: multidimensional perspectivePublication . Santos, Ana João; Ribeiro, Oscar; Nunes, BaltazarThe first theoretical reference to violence against older adults appeared in 1975, firstly described as “Granny battering”. Since then, the field has dealt with controversy over concepts, definitions and theoretical models used to describe and conceptualise the problem. The difficulties of the fields conceptual development can be partly attributed to the multidimensionality of the construct. Violence against older adults can be defined and categorised according to different dimensions (e.g., abuse types, victim, perpetrator and context), and its theoretical and conceptual development has coexisted with the difficulty of including the various categories of each of these dimensions (and the range of possible presentations) in conceptualisations sufficiently objective for its operationalization and, consequently, for its empirical validation. This thesis recognises that multidimensionality is an essential feature for understanding violence against older adults, since victimisation experiences are characterised, defined and understood within the interplay of abusive behaviours, victims, perpetrators and contexts. Bearing these assumptions in mind, the thesis presents a series of studies that aimed to describe the multidimensionality of violence within community dwelling older adults and to provide a more complex representation of victimisation experiences in a description of configurations encompassing more than one of the problems’ dimensions. First a brief review of the research history and the fields conceptual development is presented, including the multidimensional perspective (chapter I and II). It follows the study empirical work that involves a secondary analysis of data from the Ageing and Violence research project. This was a project that took place between 2011 and 2014, and was conducted by the National Heath Institute Doutor Ricardo Jorge. In the study presented in chapter IV, we determined the impact of employing two different measures to evaluate psychological violence and reflect whether family dynamics is being included within the prevalence of this form of violence. Chapter V includes two studies. The first is a contribution to the validation of two short versions of the Geriatric Depression Scale, both of which have shown to be an appropriate instrument to measure depressive symptoms in old age. The second study proposes an in-depth analysis of the relationship between depressive symptoms and violence, by examining its association with both the individuals’ characteristics and distinct violence dimensions. In chapter VI we describe the main evoked emotions and feelings of community-dwelling older adults who have experienced violence and explore the association between these emotions and individual and distinct violence dimensions. The following two studies (chapter VII) sought to describe and characterise multidimensionality of violence against older adults. The first uses latent class analysis to categorise violence occurrence into subgroups considering two of the problems dimensions - abusive behaviours and appointed perpetrators. The second study is a qualitative study on the narratives and perceptions of self-reported victims. The relationship between victim and abusive individual is considered the key element based upon which we examine the ageing process and the interplay with violence occurrence. Overall, the findings from the different studies suggest: (i) violence against older adults is a construct that encompasses distinct phenomena (Intimate Partner Violence grown old and neglect) sharing common features; (ii) violence against older adults is best characterised by considering different dimensions (e.g., context dyad victim-perpetrator, abusive behaviours and severity); (iii) the dyad victim-perpetrator is one of the most important dimensions, followed by severity and type of abusive behaviours; (iv) the interplay of these different dimensions helps apprehend the nature and dynamics of different elder abuse configurations. In chapter VIII (contribution to the thesis in the form of a chapter of the book manual entitled “Manual sobre “Vítimas de crime e violência: Práticas de intervenção” [Victims of Crime and Violence: Intervention Practices]), we recognise the difficulty of developing a single intervention and, through a case study, we reflect on the importance of the nature of the relationship between victim and abusive individual for the responses´ appropriateness. Altogether, these studies advance new knowledge on violence against community-dwelling older adults, providing important clues to victimisation configurations-types to which practitioners can tailor specific responses, creating more comprehensive and, hopefully, more effective interventions.
- Trajetórias do bem-estar: efeitos temporais dos determinantes psicossociais da saúde em contexto laboralPublication . Neto, Mariana; Reis, Maria de Fátima Calado Varela; Miguel, José Manuel Domingos PereiraIntrodução: Um ambiente psicossocial adverso no trabalho está associado a alterações da saúde relacionadas com o stresse, indicando vários inquéritos europeus que cerca de 25% dos trabalhadores vivenciam situações de stresse e que metade estão expostos a algum tipo de exigências excessivas. Para efeitos do estudo, foi desenvolvido com base na revisão da literatura científica, um modelo simplificado do ambiente psicossocial do trabalho, segundo três dimensões: (1) condições de trabalho, onde foram incluídos os fatores previstos no modelo Job Demands Control (Support) de Karasek/Jonhson, (2) a interface trabalhofamilia, que incluiu os fatores decorrentes do Conflito Trabalho-Família e (3) características pessoais como o Sentido da Coerência, de Antonovsky e os Traços de Personalidade de Costa e McCrae. Este estudo pretende contribuir para o conhecimento relativo à forma como se comportam ao longo do tempo os determinantes psicossociais relacionados com o trabalho, considerados em separado e em conjunto, como se influenciam mutuamente e de que modo se conjugam na produção de efeitos negativos ou positivos na trajetória do Bem-Estar dos trabalhadores, tendo em conta efeitos populacionais e individuais. Método: Realizou-se um estudo longitudinal com medições repetidas em 3 momentos de observação espaçados de aproximadamente 6 meses, com recolha de dados através de questionário de aplicação CAWI (Computer Assisted Web Interview) a 5344 trabalhadores de uma empresa tecnológica. Estudaram-se os efeitos sobre o Bem-Estar ao longo do tempo exercidos pelas Condições de Trabalho (Exigências, Controlo, Suporte da Chefia e Suporte dos Colegas), Conflito Trabalho-Família (Conflito baseado no Strain e Conflito baseado no Tempo), Traços de Personalidade e Sentido da Coerência, recorrendo a equações de estimação generalizadas (Generalized Estimating Equations – GEE) e modelos de curvas de crescimento latente (Latent Growth Curve Models – LGCM), utilizando uma abordagem de modelos de equações estruturais. Resultados O Bem-Estar aumentou significativamente ao longo do tempo, tanto no estudo por GEE como por LGCM, permitindo este último distinguir que o aumento ocorreu ao nível do grupo (empresa), mas não ao nível do indivíduo. Este aumento não foi influenciado pelo Género ou pelos Traços de Personalidade. Os participantes mais velhos tinham maior probabilidade de apresentar perda de Bem-Estar. Os Traços de Personalidade e o Conflito baseado no Strain revelaram inconsistências diversas pelo que não foram retidos para a fase final do estudo. Ao longo do tempo, as Exigências e o Conflito Baseado no Tempo diminuíram, o Sentido da Coerência e o Suporte dos Colegas aumentaram, e o Controlo e o Suporte da Chefia mantiveram-se estáveis. O aumento do Bem-Estar ao longo do tempo foi influenciado pela diminuição da influência temporal específica das Exigências e do Controlo, respetivamente, e pelo aumento da influência do Suporte da Chefia, não se registando qualquer influência do Suporte dos Colegas. O Conflito Baseado no Tempo diminuiu, influenciando positivamente a trajetória do Bem-Estar. Esta sofreu a maior influência temporal específica positiva por parte do Sentido da Coerência quando comparado com os restantes fatores, embora este efeito tenha diminuído ao longo do tempo. Conclusões: Os resultados obtidos por GEE e por LGCM são consistentes. A GEE é uma técnica de mais fácil execução uma vez acautelada a possibilidade de existência de uma falácia ecológica e a LGCM permite uma análise mais detalhada com distinção entre efeitos de grupo e efeitos individuais. Os resultados sugerem que os fatores do ambiente de trabalho exercem uma intervenção diferenciada independentemente das suas trajetórias, numa dinâmica compatível com um mecanismo sistémico do tipo homeostático e adaptativo, com capacidade de ativar recursos adequados à manutenção do melhor estado de Bem-Estar.
- Contributo para o estudo dos efeitos da passagem à situação (e idade) de reforma na frequência das principais doenças crónicas em PortugalPublication . Sousa-Uva, Mafalda; Dias, Carlos Matias[PT] Introdução: A transição para a reforma é um acontecimento que pode acarretar alterações suscetíveis de afetar o estado de saúde. Vários estudos têm investigado os efeitos da reforma no estado de saúde, embora poucos o tenham investigado, especificamente, nas doenças crónicas. As recentes políticas de aumento da idade de reforma, assim como a ausência de consenso sobre os efeitos da reforma na saúde, atribuem-lhe ainda maior importância. Constituem objetivos do presente estudo quantificar a associação entre a Passagem à situação de reforma (e idade de reforma) e a frequência de cada uma das principais doenças crónicas, no sentido dos efeitos da reforma nestes indicadores de saúde (doença respiratória crónica, diabetes, doença cardiovascular, AVC, depressão e cancro). Material e Métodos: Desenvolveu-se um estudo transversal, no qual foram analisados os dados provenientes das amostras representativas da população portuguesa SHARE 2011 e ECOS 2013. As associações foram quantificadas através do cálculo do Odds ratio por Regressão Logística Binária com avaliação do confundimento e modificação de efeito. As variáveis de doença crónica foram medidas por auto-reporte. Foram considerados os reformados que se encontrassem em processo de reforma (ou seja, reformados há 5 anos ou menos) e que não se tivessem reformado por doença. Resultados: A reforma não se encontrou significativamente associada a nenhuma das doenças crónicas consideradas, excetuando-se: i) o cancro (na amostra ECOS), para o qual foi fator protetor; ii) e a doença cardiovascular (na amostra SHARE), para a qual teve um efeito prejudicial, mas apenas em não hipertensos. A reforma em idade antecipada pareceu encontrar-se associada a um pior estado de saúde, relativamente à reforma em idade legal (ou após). Tal observou-se no Cancro (nas amostras ECOS e SHARE), na Diabetes (na amostra SHARE), e no AVC em pessoas sem Doença Cardiovascular (na amostra SHARE). Pelo contrário, em pessoas com Doença Cardiovascular a reforma antecipada pareceu constituir um fator protetor. Discussão e conclusões: As diferenças observadas nos resultados entre amostras poderão, entre outros, atribuir-se às diferentes populações em estudo, dimensões amostrais e desenhos de amostragem. Os resultados obtidos não são muito diferentes dos que têm sido descritos na bibliografia, ainda que haja um número reduzido de estudos sobre esta matéria. Indicam que, eventualmente, as recentes alterações de aumento da idade de reforma poderão expandir o grupo de pessoas que se reformam antecipadamente, podendo resultar, eventualmente, num aumento da prevalência de doenças crónicas na população portuguesa. Os mecanismos através dos quais a reforma poderá influenciar a ocorrência de doenças crónicas permanecem por explicar, embora os seus principais fatores de risco pareçam representar importantes modificadores de efeito.
- Statistical methods for modeling and nowcasting the impacts of influenza epidemicsPublication . Nunes, Baltazar; Carvalho, Maria Lucília Salema e; Natário, Isabel Cristina MacielInfluenza is an acute respiratory infection responsible for epidemics with high impact on human health. Several statistical methods have been applied to data collected from influenza surveillance systems (ISS) to assess the epidemic burden and early detect it. Given the ISS reporting delays, models have recently been developed to correct them by predicting the present situation (nowcasting) using the incomplete information collected. Thus, three objectives were defined. Review and classify the methods that use interrupted mortality time series to estimate influenza excess deaths. They were classified according to the model used to fit the time series and obtain a baseline; the influenza epidemic period estimator and the procedure used to fit the model (iterative or non iterative). This generalization led to the development of user friendly R-package, flubase, implementing all these models. Estimate influenza excess deaths in Portugal between 1980 and 2004. The seasonal excess deaths average by all causes was 2,475, of those 90% occurred in the elderly. These results suggest a similar influenza epidemics profile between Portugal and other countries in the Northern Hemisphere, and represent the first reference to contextualize future epidemics severity and design public health measures. Develop a model to nowcast the influenza epidemic evolution in a weekly basis. A non homogenous hidden Markov model (HMM) was developed to nowcast the current week influenza-like illness (ILI) incidence rate and the probability that the influenza activity is epidemic using as covariates an early estimate of ILI rate and the number of ILI cases tested positive in the previous week. Bayesian inference was used to estimate the model parameters and nowcasted quantities. The results obtained by application to the Portuguese ISS data, demonstrated the additional value of using a non homogenous HMM instead of an homogenous since it improves the ISS timeliness in 2 weeks.