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Departamento de Doenças Infecciosas

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http://hdl.handle.net/10400.18/2

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Percorrer Departamento de Doenças Infecciosas por Domínios Científicos e Tecnológicos (FOS) "Ciências Naturais::Ciências Biológicas"

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  • Pesquisa de bactérias entéricas multirresistentes em perus produzidos para consumo humano - Existe risco para a Saúde Pública?
    Publication . Martins, Margarida Isidro; Pista, Ângela; Pina, Francisco
    As doenças de origem alimentar constituem um grave problema de saúde pública, e os produtos alimentares de origem animal são uma das principais fontes de contaminação. Igualmente preocupante é o aumento de estirpes multirresistentes. Este estudo teve como objetivo analisar o papel dos perus enquanto reservatórios e potenciais fontes de transmissão de Escherichia coli (E. coli), Salmonella spp. e Shigella spp. ao Homem, através do isolamento e caracterização fenotípica e genotípica destas bactérias de fezes (n = 108) e carnes cruas de peru (n = 33), em Portugal. Em nenhuma das matrizes foi isolada Shigella spp., enquanto Salmonella spp. foi apenas isolada numa amostra de fezes (0,9%). Isolou-se E. coli em todas as amostras de fezes e em 90,9% das amostras de carne. E. coli enteropatogénica foi identificada em 0,9% dos isolados de fezes. Os 138 isolados de E. coli sequenciados apresentaram genes de virulência de E. coli patogénica extraintestinal e 31,2% foram classificados como E. coli patogénica aviária. Foi observada uma grande diversidade de serotipos e sequências tipo. Salmonella Newport foi suscetível aos antibióticos testados. Em E. coli, foram observadas resistências em 74,1% dos isolados de fezes e 90,0% dos de carne, e, respetivamente, 52,8% e 70,0% foram multirresistentes. No geral, as resistências mais frequentes foram à ampicilina, tetraciclina e ciprofloxacina, e foram identificados cinco isolados produtores de beta-lactamases de espetro alargado. Oito isolados de E. coli apresentaram genes de resistência para a colistina (mcr-1.1). A análise filogenética dos isolados de E. coli permitiu identificar 13 clusters. Foi identificado um cluster entre o isolado de Salmonella Newport e outro isolado nacional. Os resultados deste estudo realçam o papel dos perus como uma potencial fonte de doenças zoonóticas para o Homem e a importância da abordagem One Health, de forma a garantir a segurança alimentar e promover a saúde pública.
    2025-02-19Dissertação de mestrado Acesso embargado Ver mais
  • Unraveling the genome-wide repertoire of the novel chromosomally encoded mcr-8.6 gene variant in Klebsiella michiganensis isolated from manure
    Publication . Rivière, Rani; Teixeira, Pedro; Silva, Catarina; Ramos, Miguel; Dias, Elsa; Manageiro, Vera; Caniça, Manuela
    The increasing rates of colistin resistance worldwide poses a significant threat to public health. While the most commonly described variant is , other variants such as have been detected, typically associated with . However, little is known about the prevalence of in other bacterial species and environmental reservoirs. This study aimed to characterize a novel subvariant identified in a strain isolated from manure in Portugal, collected during an annual longitudinal survey at an Open Air laboratory, as well as to depict its genomic context and potential mobility mechanisms. The strain was subjected to phenotypic susceptibility testing, whole-genome sequencing and hybrid genome assembly. analysis included identification of resistance genes and mobile genetic element. The new gene variant and its genetic environment were characterized. The F731 strain presented susceptibility to colistin with a MIC = 0.25 mg/L, despite carrying a novel subvariant, , which was located within a 61.6 kb chromosomal genomic island. This variant presented 23-24 amino acid substitutions compared to previous characterized MCR-8 proteins. The genomic island also harbored multiple insertion sequences (IS, IS, IS), virulence factors, and metabolic and regulatory proteins, among others. Synteny analysis revealed high sequence identity between this genomic island and both chromosomal and plasmid regions from other bacterial strains isolated from different reservoirs worldwide, indicating prior mobility. Furthermore, other antimicrobial resistance genes were detected [e.g., ', ], but no plasmid replicons were identified. This is the first report of a gene in a , as well as the first occurrence in Portugal. Although F731 remains colistin-susceptible, the presence of a novel chromosomally encoded but located in a mobile genomic island underscores the risk of future horizontal gene transfer. These findings highlight the importance of further monitoring and continued surveillance in environmental and animal compartments in order to track the dissemination of antimicrobial resistance.
    2025-12-03Artigo científico Acesso aberto Ver mais