Characterization and Biofilm Assessment of haemophilus influenzae Isolates from Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease and Otitis Media

Cunha Batista, Beatriz

Publication

Characterization and Biofilm Assessment of haemophilus influenzae Isolates from Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease and Otitis Media

2018-10-08Master thesis

dc.contributor.advisor	Bajanca-Lavado, Maria Paula
dc.contributor.advisor	Jordão, Luísa
dc.contributor.author	Cunha Batista, Beatriz
dc.date.accessioned	2019-03-25T14:11:49Z
dc.date.available	2019-03-25T14:11:49Z
dc.date.issued	2018-10-08
dc.description	Dissertação de mestrado em Bioquímica apresentada à Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, 2018	pt_PT
dc.description	Trabalho desenvolvido no Laboratório Nacional de Referência de Infeções Respiratórias, no Departamento de Doenças Infeciosas do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge.	pt_PT
dc.description.abstract	Haemophilus influenzae is a commensal microorganism of the human nasopharynx, responsible for both invasive and non-invasive diseases. This work focused on the study of 93 H. influenzae isolates, collected between 2013 and 2018, from patients with two epidemiologically relevant non-invasive diseases: Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) and Otitis Media (OM). Phenotypical and molecular characterizations were performed for the isolates, regarding capsular typing, β-lactamase production, antibiotic susceptibility, genetic diversity by MLST, presence/absence of virulence factors (pilA, hifA, hmw1A, hmw2A, hia and ompP5) and ability to produce biofilms. COPD isolates were collected from adults (100%), while 98.2% of OM isolates were collected from children. Non-typeable H. influenzae (NTHi) was the aetiological agent in COPD (97.4%) and OM (100%). Regarding antibiotic susceptibility, it should be noticed that 15.1% of the isolates were β-lactamase producers. MLST revealed a high genetic diversity among COPD and OM isolates, with 31 STs in 41 analysed isolates. pilA and ompP5 genes were present in more than 50% of COPD and OM isolates. hifA and hia genes were identified in less than half of the isolates, with a higher prevalence of these among OM isolates. hmw1A and hmw2A genes were respectively identified in 25.5% and 32.7% of OM isolates, while both hmw genes were present in 76.3% of COPD isolates. Biofilm production was observed for 14.0% and 29.0% of all isolates after 24h and 48h, respectively. No relationship between biofilm production and clinical source could be established, as well as with the presence of virulence factors (pilA, hmw1A e hmw2A) involved in biofilm production. COPD and OM are frequently associated with NTHi. Since no vaccines are available, monitoring of these diseases is highly recommended, as these constitute a Public Health threat associated with a high economic and social burden.	pt_PT
dc.description.abstract	Haemophilus influenzae é um microrganismo comensal da nasofaringe humana, responsável por doenças invasivas e não-invasivas. Este trabalho focou-se no estudo de 93 estirpes de H. influenzae, isolados entre 2013 e 2018, de indivíduos com duas doenças nãoinvasivas epidemiologicamente relevantes: Doença Pulmonar Obstrutiva Crónica (DPOC) e Otite Média (OM). As estirpes foram caraterizadas, fenotípica e molecularmente, relativamente à presença de cápsula, produção de β-lactamase, suscetibilidade a antibióticos, diversidade genética por MLST, presença/ausência de fatores de virulência (pilA, hifA, hmw1A, hmw2A, hia e ompP5) e a capacidade para formar biofilmes. A DPOC incidiu numa população adulta (100%), enquanto a OM foi predominante em crianças (98,2%). Verificou-se que o H. influenzae não capsulado (HiNC) foi o agente etiológico responsável pela DPOC (97,4%) e OM (100%). Relativamente à susceptibilidade aos antibióticos, há a destacar a produção de β-lactamase em 15,1% das estirpes. O MLST revelou uma elevada diversidade genética, tanto na DPOC como na OM, com a caraterização de 31 STs em 41 estirpes analisadas. Os genes pilA e ompP5 foram identificados em mais de 50% dos isolados de DPOC e OM. Os genes hifA e hia foram encontrados em menos de metade dos isolados, tendo-se verificado uma maior prevalência na OM. Os genes hmw1A e hmw2A foram identificados, respetivamente, em 25,5% e 32,7% das estirpes de OM, estando ambos presentes em 76,3% das estirpes de DPOC. A formação de biofilmes foi observada em 14,0% e 29,0% das estirpes após 24h e 48h, respetivamente. Não foi possível estabelecer uma relação entre formação de biofilmes e origem clínica, nem com a presença de fatores de virulência (pilA, hmw1A e hmw2A) envolvidos na produção de biofilmes. DPOC e OM são doenças frequentemente associadas a HiNC. Não existindo uma vacina disponível, é importante a sua monitorização, pelo impacto social e económico que representam em Saúde Pública.	pt_PT
dc.description.version	N/A	pt_PT
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10400.18/6292
dc.language.iso	eng	pt_PT
dc.peerreviewed	no	pt_PT
dc.relation.publisherversion	https://run.unl.pt/handle/10362/58090	pt_PT
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	pt_PT
dc.subject	Haemophilus influenzae	pt_PT
dc.subject	Otitis Media	pt_PT
dc.subject	Chronic Obstructive Pulmonary Disease	pt_PT
dc.subject	Virulence Factors	pt_PT
dc.subject	Non-typeable H. influenzae	pt_PT
dc.subject	Biofilms	pt_PT
dc.subject	Doença Pulmonar Obstrutiva Crónica	pt_PT
dc.subject	Otite Média	pt_PT
dc.subject	Fatores de Virulência	pt_PT
dc.subject	Biofilmes	pt_PT
dc.subject	H. influenzae não capsulado	pt_PT
dc.subject	Infecções Respiratórias	pt_PT
dc.title	Characterization and Biofilm Assessment of haemophilus influenzae Isolates from Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease and Otitis Media	pt_PT
dc.type	master thesis
dspace.entity.type	Publication
oaire.citation.conferencePlace	Lisboa, Portugal	pt_PT
oaire.citation.endPage	75	pt_PT
oaire.citation.startPage	xxiv, 1	pt_PT
rcaap.rights	openAccess	pt_PT
rcaap.type	masterThesis	pt_PT