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Perturbação do espectro do autismo: identificação de variantes em genes envolvidos no mecanismo regulador da expressão génica nonsense-mediated mRNA decay

2022-05Journal article Open access
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dc.contributor.authorMarques, Ana Rita
dc.contributor.authorSantos, João Xavier
dc.contributor.authorMartiniano, Hugo
dc.contributor.authorVilela, Joana
dc.contributor.authorRasga, Célia
dc.contributor.authorRomão, Luísa
dc.contributor.authorVicente, Astrid Moura
dc.date.accessioned2022-05-27T16:10:23Z
dc.date.available2022-05-27T16:10:23Z
dc.date.issued2022-05
dc.description.abstractA Perturbação do Espectro do Autismo (PEA) é uma patologia do neurodesenvolvimento caracterizada por dificuldades de socialização e/ou comunicação e por comportamentos estereotipados e repetitivos. Estudos de heritabilidade indicam que fatores genéticos contribuem para 50-80% do risco de desenvolver PEA, mas os mecanismos genéticos não são bem conhecidos. Neste estudo, exploramos a contribuição para o risco de PEA de genes que codificam proteínas envolvidas num mecanismo regulador da expressão génica, o Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD). Para este fim, compilámos uma lista de 46 genes envolvidos no NMD e investigámos a presença de Single Nucleotide Variants (SNVs) e Copy Number Variants (CNV ) nestes genes em duas amostras populacionais de indivíduos diagnosticados com PEA (n=1828 e n=3570, respetivamente). Identificámos variantes raras (MAF<1% em controlos) com efeito deletério de acordo com uma predição in silico, e verificámos se afetam domínios proteicos necessários para o NMD. Identificámos 270 SNVs em 524 pacientes com PEA e 38 CNVs em 38 pacientes com PEA. Destas, 136 variantes (122 SNVs e 11 CNVs) estão localizadas em regiões dos genes que codificam domínios proteicos importantes para o funcionamento do mecanismo de NMD. Deste modo, colocamos a hipótese de que estas variantes possam afetar a função normal do NMD e, consequentemente, contribuir para alterações na expressão dos genes-alvo, podendo assim constituir um fator de risco para a PEA.pt_PT
dc.description.abstractAutism Spectrum Disorder (ASD) is a neurodevelopmental condition characterized by impaired social/communication skills and stereotyped /repetitive behaviors. Genetic factors account for 50-80% of the familial risk of ASD, but genetic determinants are not fully understood. In this study, we explored the contribution to ASD etiology of genes involved in an important post-transcriptional regulatory mechanism, the Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD). We first compiled a group of 46 genes encoding NMD factors and regulators. In these genes, we searched for Single Nucleotide Variants (SNVs) and Copy Number Variants (CNVs) in two samples of ASD patients (n=1828 and n=3570, respectively). In genes with rare variants (MAF<1% in controls) predicted in silico to be deleterious, we further investigated whether these variants affect protein domains required for NMD. We identified 270 SNVs in 524 ASD patients and 38 CNVs in 38 ASD patients. We found 136 variants (122 SNVs and 11 CNVs) located within protein domains that may affect proper NMD function and consequently contribute to changes in the expression of NMD targets. This study suggests that genetic variants that cause NMD impairment may constitute a risk factor to ASD pathophysiology.pt_PT
dc.description.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionpt_PT
dc.identifier.citationBoletim Epidemiológico Observações. 2022 janeiro-abril;11(31):49-54pt_PT
dc.identifier.issn0874-2928
dc.identifier.issn2182-8873 (em linha)
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.18/8028
dc.language.isoporpt_PT
dc.publisherInstituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IPpt_PT
dc.subjectAutismopt_PT
dc.subjectPerturbação do Espectro do Autismopt_PT
dc.subjectPerturbações do Desenvolvimento Infantilpt_PT
dc.subjectMecanismo Reguladorpt_PT
dc.subjectNonsense-mediated mRNA Decaypt_PT
dc.subjectPerturbações do Desenvolvimento Infantil e Saúde Mentalpt_PT
dc.subjectExpressão Génica
dc.subjectGenómica Funcional e Estrutural
dc.titlePerturbação do espectro do autismo: identificação de variantes em genes envolvidos no mecanismo regulador da expressão génica nonsense-mediated mRNA decaypt_PT
dc.title.alternativeAutism spectrum disorder: identification of gene variants involved in the nonsense-mediated mRNA decaypt_PT
dc.typejournal article
dspace.entity.typePublication
oaire.citation.conferencePlaceLisboa, Portugalpt_PT
oaire.citation.endPage54pt_PT
oaire.citation.issue31pt_PT
oaire.citation.startPage49pt_PT
oaire.citation.titleBoletim Epidemiológico Observaçõespt_PT
oaire.citation.volume11pt_PT
rcaap.rightsopenAccesspt_PT
rcaap.typearticlept_PT

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