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- Vigilância Laboratorial da Tuberculose em Portugal: relatório 2025Publication . Laboratório Nacional de Referência de MicobactériasRelatório de Vigilância Laboratorial da Tuberculose em Portugal referente ao ano de 2025, elaborado pelo Laboratório Nacional de Referência de Micobactérias (LNR-TB) do Departamento de Doenças Infeciosas do INSA. O documento apresenta a análise da vigilância molecular das estirpes do complexo Mycobacterium tuberculosis (MTC), com base em dados acumulados desde 2020, incluindo a caracterização genómica e a identificação de relações filogenéticas relevantes para a deteção de cadeias de transmissão. Na sequência da implementação de metodologias baseadas em sequenciação do genoma total (WGS), o LNR-TB consolidou a sua capacidade para realizar, de forma sistemática, a caracterização genómica das estirpes de MTC. Esta abordagem permite a previsão do perfil de suscetibilidade aos antibacilares, incluindo de primeira linha, com elevado grau de fiabilidade, bem como a identificação precoce de eventos de transmissão. A utilização do WGS constitui, assim, uma ferramenta central para apoiar a decisão clínica e reforçar a resposta das Autoridades de Saúde, em linha com as recomendações europeias para países de baixa incidência de tuberculose. A vigilância laboratorial das micobactérias foi ainda alargada, incluindo de forma continuada a monitorização de Mycobacterium leprae, já integrada desde 2023, e, pela primeira vez, a caracterização de casos de micobactérias não tuberculosas (MNT), refletindo a crescente relevância destas infeções no contexto clínico e epidemiológico. Dos resultados apresentados no relatório, destacam-se os seguintes pontos: - A confirmação bacteriológica da tuberculose mantém-se essencial para a monitorização da doença e para a determinação do perfil de suscetibilidade aos antibacilares, devendo ser sempre complementada com exames laboratoriais adequados; - Os casos de tuberculose resistente à rifampicina ou multirresistente (TB-RR/MR) mantêm-se em vigilância, com variações anuais que justificam acompanhamento contínuo; - A distribuição geográfica dos casos evidencia maior concentração nas regiões de Lisboa e Vale do Tejo e do Norte, à semelhança do observado em anos anteriores; - A análise genómica permitiu identificar múltiplos clusters moleculares, incluindo cadeias de transmissão com persistência temporal, reforçando a importância da vigilância molecular contínua; - Desde 2023, que se confirmam anualmente casos de infeção por Mycobacterium leprae, todos com enquadramento epidemiológico compatível, evidenciando a importância da capacidade diagnóstica instalada; - A inclusão da vigilância das micobactérias não tuberculosas (MNT) constitui um avanço relevante, permitindo uma abordagem mais abrangente das infeções por micobactérias em Portugal; - Em alinhamento com as mais recentes recomendações europeias, nomeadamente do European Reference Laboratory Network for Tuberculosis (ERLTB-Net), está em curso a transição para a utilização sistemática da sequenciação do genoma total (WGS) em todos os isolados de Mycobacterium tuberculosis, com o objetivo de substituir progressivamente os testes fenotípicos de suscetibilidade aos antibacilares de primeira linha. Esta abordagem permitirá uma resposta diagnóstica mais rápida, integrada e preditiva, reforçando a eficiência do sistema e a qualidade da informação disponibilizada a clínicos e autoridades de saúde. Este relatório reforça o papel do INSA enquanto laboratório nacional de referência, evidenciando a importância da integração de ferramentas genómicas na vigilância laboratorial e no apoio à decisão clínica e em saúde pública.
- Predicted no effect concentrations of antifungals for wastewater management and agricultural usePublication . Gil, D.; José, S.; Ascenso, A.; Babič, M. Novak; Segal, E.; Meletiadis, J.; Gangneux, J.P.; Weiskerger, C.J.; Solo-Gabriele, H.M.; Valério, E.; Brandão, J.Antifungal resistance is an on-growing public health concern due to the difficulty in managing or treating medical conditions that often favour fatal fungal infections. The changing climate and globalisation, which increase fungal persistence and propagation, adds to that concern. Wastewater disposal is one potential source to the environment as antifungals are released into it. Considering that most fungal infections originate from the environment and considering the One Health principle, introducing antifungals through wastewater effluents has the potential to promote the emergence and dissemination of antifungal resistance. The objective of this study was to generate knowledge that can assist regulating the release of antifungals in the environment by quantifying predicted no-effect concentrations (PNECs) that would not promote antifungal resistance. For this purpose, a systematic review was performed to consolidate information on antifungals released to the environment and respective concentrations. The systematic literature review followed Preferred Reporting Items for Systematic literature reviews and Meta Analyses extension for Scoping Reviews (PRISMA-SLR). The analysis of 122 reviewed articles using this approach showed high concentrations and dispersion of antifungals in water, wastewater or soil. This highlights their potential dispersion in the environment, thus increasing the potential of fungal antimicrobial resistance. Due to the lack of PNEC values using fungi as model organisms in this review, PNECs for 17 antifungals were calculated using as model, as it is done for clinical purposes. We consider that the antifungal PNECs calculated and consolidated from the literature can be used to prioritise them for regulation and to determine acceptable levels in wastewater effluents.
