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  • A Global Survey Of Genetic Testing Methods For Familial Hypercholesterolemia. A Study From The EAS FHSC Registry
    Publication . Karungi, Irene, On behalf of the EAS FHSC Investigators; Chora, Joana Rita; Elshorbagy, A.; Stevens, C.A.T.; Vallejo-Vaz, A. J.; Ray, K. K.; Raal, F. J.; Humphries, S. E.; Freiberger, T.; Bourbon, M.
    Contexto: A hipercolesterolemia familiar (HF) é causada principalmente por variantes patogénicas nos genes LDLR, APOB ou PCSK9, levando a um LDL-C elevado ao longo da vida e a um aumento do risco de doenças cardiovasculares. Os testes genéticos oferecem um diagnóstico definitivo da HF, no entanto, falta uma abordagem padronizada para os métodos de teste genético da FH a nível global. Métodos: Foi enviado um inquérito estruturado a investigadores nacionais de 68 países ativos no registo da Colaboração de Estudos EAS-FH. Os domínios do inquérito incluíram critérios para encaminhamento para testes genéticos, técnicas de teste, triagem genética e interpretação da patogenicidade variante. Os dados foram analisados descritivamente, e foram feitas comparações entre casos índice e não-índice e países de rendimento elevado versus não elevado. Resultados: Dos 68 países convidados, 55 (81%) responderam. Entre os países com critérios clínicos estabelecidos para adultos (85%) e crianças (76%), a rede holandesa de clínicas de lípidos foi o critério mais utilizado para o encaminhamento de adultos e crianças (72% e 57%, respetivamente) para testes genéticos. Os critérios de Simon-Broome e MedPed foram usados com menor frequência, reportados apenas por países de rendimento elevado para adultos (7% e 2%, respetivamente) e crianças (12% e 2%, respetivamente). Para testes de casos índice, a maioria dos países utilizou painel génico de sequenciação de próxima geração (NGS) (62%), enquanto para casos não indexados, a maioria baseou-se em variantes específicas por sequenciação Sanger (71%). Este padrão era semelhante tanto em países de rendimento elevado como não elevado; no entanto, alguns países usaram a mesma abordagem de teste tanto para casos índice como não indexados (Figura). As variantes de número de cópia (CNVs) foram avaliadas em 65% dos países, dos quais 86% incorporaram análise CNV em plataformas NGS, enquanto 14% utilizaram amplificação de sonda dependente de ligação multiplex (MLPA) e testes de microarray. Todos os países testados para LDLR, 97% para APOB, e 95% para PCSK9. Em 96% dos países, os relatórios de testes incluíram interpretação de patogenicidade variante (com a maioria a seguir as diretrizes do American College of Medical Genetics and Genomics). Conclusões: A variabilidade generalizada nas práticas de testes genéticos destaca a necessidade crítica de padronização para garantir um diagnóstico de FH eficaz, consistente e comparável a nível global.
    2025-05-07Documento de conferência Acesso restrito Ver mais
  • Genome wide analysis of methylation changes in Caco 2 intestinal cells after exposure to undigested and digested titanium dioxide nanoparticles
    Publication . Ventura, Célia
    Titanium dioxide nanoparticles (TiO2NPs) are nanomaterials with relevant properties for several applications in biomedicine and industry, where they are primarily used as a white pigment to improve the opacity, brightness, and whiteness of several products, such as paint, food, cosmetics, and pharmaceutics. Nevertheless, there are still concerns about its effects on human health, particularly through ingestion of the food-grade TiO2NPs, which caused its ban from all food products in the European Union. Moreover, in recent years, there has been a great interest in the role of epigenetics in the biological response to chemical exposure, including the study of DNA methylation. This study aimed at identifying changes in DNA methylation of Caco-2 intestinal cells caused by exposure to anatase (NM-102), rutile (NM-103) and anatase/rutile (NM-105) TiO2NPs, either after a simulated in vitro digestion or the undigested counterparts. Using Reduced Representative Bissulfite Sequencing, significant differential methylation of 209 and 319 genomic regions in cells exposed to undigested and digested NMs was identified, respectively. These included 48, 41 and 55 differentially methylated genes for undigested NM-102, NM-103 and NM-105, and 71, 65 and 55 for the digested counterparts. Reactome pathways and Gene Ontology (GO) analyses showed that both undigested and digested TiO2NPs have a functional impact on intestinal cells, often cancer-related, and that digestion seems to reduce this impact. Different TiO2NPs caused enrichment of different pathways and GO terms, probably due to their specific physicochemical properties. A trend towards CpG hypermethylation was observed upon NM-105 exposure, unlike the other TiO2NPs. This study highlights the importance of DNA methylation analysis in assessing the adverse effects of nanomaterials on human cells.
    2025-05-07Recurso educativo Acesso restrito Ver mais