Percorrer por autor "Soeiro, Vanessa"
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- Caracterização genotípica e fenotípica de estirpes de Escherichia coli patogénicas, Salmonella spp. e Campylobacter spp. isoladas de aves em liberdade em Portugal continentalPublication . Batista, Rita; Saraiva, Margarida; Lopes, Teresa; Silveira, Leonor; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Castro, Rita; Correia, Cristina Belo; Rodrigues, David; Henriques, Pedro; Lóio, Sara; Soeiro, Vanessa; Martins da Costa, Paulo; Oleastro, Mónica; Pista, ÂngelaAs aves são potenciais portadoras de microrganismos patogénicos que afetam os seres humanos, e podem ser disseminadoras de perigos no ambiente de produção primária de géneros alimentícios de origem vege- tal e animal. Este trabalho teve como objetivo avaliar a ocorrência, em fezes de aves em liberdade, em Portugal, de três bactérias zoonóticas causadoras de infeções no Homem. Para tal, foi avaliada a presença de Escherichia coli (E. coli), Salmonella spp. e Campylobacter spp. em 108 amostras individuais de fezes de aves e em uma amostra em pool de 50 amostras de fezes de gaivotas. Foi efetuada a caracterização fenotípica dos isolados (serotipagem e perfis de resistência a antibióticos) e dete- tados genes específicos associados à patogenicidade e à resistência a antimicrobianos, por PCR e/ou sequenciação total do genoma (WGS). Isolados de E. coli patogénicos, Salmonella spp. e Campylobacter spp. foram detetados em 8,9%, 2,8% e 9,9% das amostras, respetivamente. A resistência a antimicrobianos foi testada em 54 isolados de E. coli, tendo sido detetada em 14 (25,9%). Onze destes isolados revelaram a presença de fatores de virulência, E.coli patogénicos. Dez dos isolados de E. coli revelaram ser resistentes a múltiplos antimicrobianos (MDR) e sete eram produtores de β-lactamases de espectro alargado (ESBL). Re- lativamente aos isolados de Salmonella spp. (n=3) e Campylobacter spp. (n=9), apenas uma estirpe de Campylobacter jejuni foi identificada como MDR. A maioria dos serotipos e/ou Sequence Types (ST) identificados já tinham sido referenciados como associados a doença humana. Estes resultados mostram que as aves que fazem parte da fauna portuguesa podem ser portadoras de bactérias patogénicas capazes de causar do- ença humana, algumas delas resistentes a antimicrobianos críticos.
- Escherichia coli patogénica, Salmonella spp. e Campylobacter spp. em dois Centros de Conservação da Vida Selvagem em Portugal: caracterização genotípica e fenotípicaPublication . Pista, Ângela; Silveira, Leonor; Ribeiro, Sofia; Fontes, Mariana; Castro, Rita; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Lopes, Teresa; Maia, Carla; Mixão, Verónica; Borges, Vítor; Sá, Ana; Soeiro, Vanessa; Correia, Cristina Belo; Gomes, João Paulo; Saraiva, Margarida; Oleastro, Mónica; Batista, RitaA coexistência entre humanos e animais selvagens pode aumentar o risco de transmissão direta de agentes patogénicos zoonóticos emergentes ou reemergentes para humanos. Este trabalho teve como objetivo avaliar a ocorrência de três importantes agentes patogénicos de origem alimentar em animais selvagens de dois centros de conservação da vida selvagem, em Portugal. Para tal, foram testadas 132 amostras fecais para a presen- ça de Escherichia coli (E. coli produtora de toxina Shiga (STEC) e não pro- dutora de toxina Shiga (não-STEC)), Salmonella spp. e Campylobacter spp.. Foi realizada a caracterização genotípica (pesquisa de genes de vi- rulência, pesquisa de genes de resistência a antimicrobianos (AMR), se- quenciação total do genoma (WGS)) e fenotípica (serotipagem e perfis de AMR) de todos os isolados de interesse. No geral, 62 amostras testaram positivo para pelo menos uma das espé- cies analisadas: 27,3% para STEC, 11,4% para não-STEC, 3,0% para Sal- monella spp. e 6,8% para Campylobacter spp. Foi detetada resistência a antimicrobianos em quatro isolados de E. coli e no único isolado de Cam- pylobacter coli. A análise de WGS revelou que 57,7% (30/52) das E. coli patogénicas integram agrupamentos genéticos de isolados fortemente relacionados (muitas vezes envolvendo diferentes espécies de animais), indicando a existência de circulação e transmissão de diferentes estirpes patogénicas de E. coli nas áreas estudadas. Estes resultados apoiam a ideia de que a saúde dos seres humanos, dos animais e dos ecossistemas são interdependentes, reforçando a importân- cia de uma abordagem One Health (Uma Só Saúde) para melhor monitori- zar e controlar as ameaças em saúde pública
- Genotypic and Phenotypic Characterization of Pathogenic Escherichia coli, Salmonella spp., and Campylobacter spp., in Free-Living Birds in Mainland PortugalPublication . Batista, Rita; Saraiva, Margarida; Lopes, Teresa; Silveira, Leonor; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Castro, Rita; Correia, Cristina Belo; Rodrigues, David; Henriques, Pedro; Lóio, Sara; Soeiro, Vanessa; da Costa, Paulo Martins; Oleastro, Mónica; Pista, AngelaBirds are potential carriers of pathogens affecting humans and agriculture. Aiming to evaluate the occurrence of the top three most important foodborne pathogens in free-living birds in Portugal, we investigated 108 individual fecal samples from free-living birds and one pooled sample of gull feces (n = 50) for the presence of Escherichia coli (pathogenic and non-pathogenic), Salmonella spp. and Campylobacter spp. Virulence- and antimicrobial resistance- (AMR) associated genes were detected by PCR and Whole-Genome Sequencing (WGS), and phenotypic (serotyping and AMR profiles) characterization was performed. Overall, 8.9% of samples tested positive for pathogenic E. coli, 2.8% for Salmonella spp., and 9.9% for Campylobacter spp. AMR was performed on all pathogenic isolates and in a fraction of non-pathogenic E. coli, being detected in 25.9% of them. Ten of the tested E. coli isolates were multidrug-resistant (MDR), and seven of them were Extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producers. Among Salmonella (n = 3) and Campylobacter (n = 9), only one strain of C. jejuni was identified as MDR. Most of the identified serotypes/sequence types had already been found to be associated with human disease. These results show that free-living birds in Portugal may act as carriers of foodborne pathogens linked to human disease, some of them resistant to critically important antimicrobials.
- Nocturnal Birds of Prey as Carriers of Staphylococcus aureus and Other Staphylococci: Diversity, Antimicrobial Resistance and Clonal LineagesPublication . Silva, Vanessa; Lopes, Ana Filipa; Soeiro, Vanessa; Caniça, Manuela; Manageiro, Vera; Pereira, José Eduardo; Maltez, Luís; Capelo, José Luis; Igrejas, Gilberto; Poeta, PatríciaOwls are nocturnal predators that inhabit urbanized and farmlands. They are in direct contact with other animals, both livestock and small wild rodents that they mostly feed on. Staphylococci can be both commensal and pathogenic bacteria that are widespread across the various ecological niches. We aimed to isolate staphylococci from owls and to characterize their antimicrobial resistance, virulence factors and genetic lineages. Swab samples were collected from the throat and cloaca of 114 owls admitted to two rehabilitation centers in Portugal. The identification of staphylococci species was performed by MALDI-TOF. Staphylococci antimicrobial resistance and virulence genes were investigated by means of the disk diffusion method and PCR. Staphylococcus aureus isolates were characterized by MLST, agr and spa-typing. Of the tested animals, 66 isolates were recovered, including 10 different species of staphylococci, of which 25 were coagulase-positive (CoPS) and 41 were coagulase-negative (CoNS). Twenty-three S. aureus were isolated, of which one mecC-MRSA was identified. The isolates were mainly resistant to penicillin, aminoglycosides, clindamycin and tetracycline. mecC-MRSA belonged to ST1245 and spa-type t843 and the remaining S. aureus were ascribed to 12 STs and 15 spa types. A high diversity of clonal lineages was identified among the S. aureus isolated from wild owls. Owls feed mainly on small rodents often exposed to waste and anthropogenic sources, which may explain the moderate prevalence of S. aureus in these animals.
- Pathogenic Escherichia coli, Salmonella spp. and Campylobacter spp. in Two Natural Conservation Centers of Wildlife in Portugal: Genotypic and Phenotypic CharacterizationPublication . Pista, Angela; Silveira, Leonor; Ribeiro, Sofia; Fontes, Mariana; Castro, Rita; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Lopes, Teresa; Maia, Carla; Mixão, Verónica; Borges, Vítor; Sá, Ana; Soeiro, Vanessa; Correia, Cristina Belo; Gomes, João Paulo; Saraiva, Margarida; Oleastro, Mónica; Batista, RitaHuman–wildlife coexistence may increase the potential risk of direct transmission of emergent or re-emergent zoonotic pathogens to humans. Intending to assess the occurrence of three important foodborne pathogens in wild animals of two wildlife conservation centers in Portugal, we investigated 132 fecal samples for the presence of Escherichia coli (Shiga toxin-producing E. coli (STEC) and non-STEC), Salmonella spp. and Campylobacter spp. A genotypic search for genes having virulence and antimicrobial resistance (AMR) was performed by means of PCR and Whole-Genome Sequencing (WGS) and phenotypic (serotyping and AMR profiles) characterization. Overall, 62 samples tested positive for at least one of these species: 27.3% for STEC, 11.4% for non-STEC, 3.0% for Salmonella spp. and 6.8% for Campylobacter spp. AMR was detected in four E. coli isolates and the only Campylobacter coli isolated in this study. WGS analysis revealed that 57.7% (30/52) of pathogenic E. coli integrated genetic clusters of highly closely related isolates (often involving different animal species), supporting the circulation and transmission of different pathogenic E. coli strains in the studied areas. These results support the idea that the health of humans, animals and ecosystems are interconnected, reinforcing the importance of a One Health approach to better monitor and control public health threats.