Percorrer por autor "Papuc, Alexandru-Marian"
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- Infeções fúngicas: estudo retrospetivo sobre casos de infeção e colonização por leveduras diagnosticados no INSA entre 2019 e 2025Publication . Papuc, Alexandru-Marian; Pimenta, Márcia; Simões, Helena; Veríssimo, Cristina; Sabino, Raquel; Gargaté, Maria JoãoNo presente estudo retrospetivo analisaram-se 1521 casos de infeção/colonização por leveduras diagnosticadas pelo Laboratório Nacional de Referência (LNR) de Infeções Parasitárias e Fúngicas do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) no período compreendido entre 2019 e 2025, dos quais 40 (2,6%) casos corresponderam a infeções mistas. As infeções/colonizações por leveduras afetaram predominantemente indivíduos de idade igual ou superior a 60 anos, tendo-se verificado um aumento de casos diagnosticados em 2024 (n=290/1521; 19,1%). Relativamente ao sexo feminino, a maior parte dos casos teve origem em exsudados vaginais, associando-se a um padrão bimodal de frequência por idade, com um pico durante a idade reprodutiva (18-44 anos) e outro na faixa etária dos 60+ anos, enquanto que no sexo masculino, as secreções respiratórias foram a principal origem biológica. Relativamente aos agentes etiológicos isolados, Candida albicans manteve-se a espécie predominante durante todo o período (51,6%, n=805/1561), e Candida parapsilosis, a segunda espécie mais frequente, com 22,7% (n=355/1561). Considerando as atuais espécies emergentes, destaca-se um aumento de isolados de Candidozyma auris, atingindo, desde o primeiro caso, isolado em 2022, 0,7% (n=11/1561) do total de isolados. Este perfil epidemiológico dos agentes etiológicos estudados está alinhado com as tendências globais e reforça a necessidade da vigilância contínua, do preciso e específico diagnóstico laboratorial e subsequente classificação taxonómica, tendo em conta o risco de diferentes perfis de resistência aos antifúngicos de espécies emergentes.
- Phenotypic and genomic characterization of azole resistance in Portuguese isolatesPublication . Papuc, Alexandru-Marian; Veríssimo, Cristina; Simões, Helena; Toscano, Cristina; Gomes, João Paulo; Mixão, Verónica; Sabino, RaquelIntroduction: Candida parapsilosis is a clinically important etiological agent of systemic infections associated with hospital outbreaks, which prevalence has been increasing in the last decade. Moreover, in recent years, fluconazole resistance in this species has been emerging in different countries, being a subject of significant interest and concern. In this context, the present study aims to determine the frequency of fluconazole resistance in C. parapsilosis sensu stricto isolates collected in Portugal (2003-2007 and 2017-2024), understand its associated molecular mechanisms, and relate it all with worldwide genomic data. Methods: To this end, we performed phenotypic assays of 145 isolates of C. parapsilosis collected from different biological and environmental products in Portugal (majority from the Lisbon Metropolitan area), and explored the genomic features of the fluconazole-resistant ones. Results: We found eight C. parapsilosis fluconazole-resistant isolates between 2017 and 2024, corresponding to a frequency of 8.5% in this period, and contrasting with the absence of fluconazole-resistant isolates collected before 2007. Sequencing of the ERG11 gene showed that all fluconazole-resistant isolates had the Y132F and R398I mutations. Discussion: A phylogenomic analysis including publicly available isolates from other countries revealed that our Portuguese isolates are more closely related to those from the USA and Germany than to the isolates sequenced thus far from the neighbor country, Spain. Furthermore, although three distinct C. parapsilosis genetic clades were found in our dataset, all the fluconazole-resistant isolates detected in this study cluster together, raising the question of whether the increased fluconazole-resistance in the country could possibly be associated with the emergence or introduction of this particular lineage. Altogether, these results provide valuable insights on fluconazole resistance in a set of Portuguese C. parapsilosis isolates and their associated mechanisms, representing an important step towards a better understanding of the increasing C. parapsilosis fluconazole resistance in Southern Europe.