Browsing by Author "Lopes, Elisa"
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- Detection of subtelomeric rearrangements in 1180 patients: FISH and MLPA contributionPublication . Mota Freitas, Manuela; Ribeiro, Joana; Candeias, Cristina; Lopes, Elisa; Oliveira, Fernanda Paula; Aguiar, Joaquim; Ribeiro, Maria Céu; Pires, Sílvia; Oliva Teles, Natália; Correia, Hildeberto; Fonseca Silva, Maria LuzMental retardation (MR) is a major social, educational, and health problem affecting 3% of the population. Subtelomeric chromosome aberrations are one of the major causes of MR with or without multiple anomalies; previous studies have shown that these rearrangements are responsible for 3-6% of unexplained mental retardation. Between 2000-2010 in the Cytogenetics Unit, Centro de Genética Médica Jacinto de Magalhães, INSA (Portugal), the subtelomeric regions of all the chromosomes were analysed in 1180 individuals, whose karyotype had been considered normal. The reasons for referral included (i) psychomotor development delay or (ii) mental retardation with or without dysmorphisms. Until 2007 the analysis of metaphases, obtained from cultured lymphocytes following standard protocols, were performed by "Fluorescence in situ hybridization” (FISH): the first kit to be used was the Chromoprobe Multiprobe-TM (Cytocell) kit (until 2005), which was followed by the TotelVysion Multi-Color FISH Probe (Vysis). In 2007 the "Multiplex Ligation dependent Probe Amplification” (MLPA) was implemented in the laboratory, using kits P036 and P070 (MRC-Holland). All the unbalanced cases detected by MLPA were confirmed by FISH. Of a total of 1180 individuals, 62 (5.3%) showed chromosomal alterations: 60 in the subtelomeric regions and 2 in the control regions. It was not possible to perform any familial studies in 12 of the 62 cases (1.0%) and therefore the results were considered inconclusive. In the other 50 abnormal cases, the parental investigation allowed us to conclude that 30 (2.5%) of these patients had chromosomal abnormalities “de novo” that might be responsible for the clinical phenotype; the remaining 20 possibly abnormal cases (1.7%) were considered polymorphisms without pathological significance, since the apparent deletion or duplication had been inherited from phenotypically normal parents. The authors compare the results obtained in the individuals in the present study with literature reports and highlight the advantages/disadvantages of each technique.
- Três rearranjos diferentes, três fenótipos diferentes :Estudo Familiar Cromossoma 14Publication . Lopes, Elisa; Silva, Isaltina; Mota Freitas, Manuela; Oliva Teles, Natalia; Fortuna, Ana; Correia, Hildeberto; Fonseca e Silva ML 1., Maria da LuzIntrodução – Cromossomas derivativos são o resultado de rearranjos estruturais que tanto podem ocorrer num só, como entre dois ou mais cromossomas. Estes rearranjos dão origem a cromossomas estruturalmente anormais, podendo resultar um fenótipo normal ou mais ou menos grave, dependendo do tipo de anomalia encontrada. Materiais e métodos – Caso índex: homem de 55 anos, referenciado para estudos de citogenética clássica (cariótipo com bandas GTG de alta resolução) e molecular (MLPA – kits P036 e P070 e FISH com sonda subtelomérica especifica para o cromossoma 14) por apresentar um quadro clínico de atraso mental. Posteriormente realizaram-se estudos citogenéticos a uma irmã com atraso cognitivo e baixa estatura, e a mais quatro familiares com fenótipos normais. Resultados – O cariótipo do caso índex revelou a existência de uma anomalia cromossómica estrutural desequilibrada num dos cromossomas 14, sugerindo uma deleção da banda 14q32, e uma duplicação do braço curto localizada na parte terminal do braço longo. Nos estudos de citogenética molecular, a técnica de MLPA identificou uma deleção da região subtelomérica no braço longo do cromossoma 14, em ambos os kits e, posteriormente, a técnica de FISH comprovou essa deleção. Após estudos familiares, concluiu-se que dois dos irmãos apresentavam anomalias cromossómicas distintas do caso índex, envolvendo igualmente o cromossoma 14. Apesar de não ser possível efetuar o cariótipo à mãe (falecida), presume-se que estas alterações tenham tido origem numa anomalia cromossómica materna, uma vez que o pai deste indivíduo apresentava um cariótipo normal. Conclusões – Os autores apresentam os resultados citogenéticos dos vários indivíduos estudados, e realçam a raridade da existência de três rearranjos diferentes (um deles aparentemente equilibrado e dois desequilibrados), envolvendo o cromossoma 14, encontrados numa mesma família.