Browsing by Author "Henriques, Pedro"
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- Caracterização genotípica e fenotípica de estirpes de Escherichia coli patogénicas, Salmonella spp. e Campylobacter spp. isoladas de aves em liberdade em Portugal continentalPublication . Batista, Rita; Saraiva, Margarida; Lopes, Teresa; Silveira, Leonor; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Castro, Rita; Correia, Cristina Belo; Rodrigues, David; Henriques, Pedro; Lóio, Sara; Soeiro, Vanessa; Martins da Costa, Paulo; Oleastro, Mónica; Pista, ÂngelaAs aves são potenciais portadoras de microrganismos patogénicos que afetam os seres humanos, e podem ser disseminadoras de perigos no ambiente de produção primária de géneros alimentícios de origem vege- tal e animal. Este trabalho teve como objetivo avaliar a ocorrência, em fezes de aves em liberdade, em Portugal, de três bactérias zoonóticas causadoras de infeções no Homem. Para tal, foi avaliada a presença de Escherichia coli (E. coli), Salmonella spp. e Campylobacter spp. em 108 amostras individuais de fezes de aves e em uma amostra em pool de 50 amostras de fezes de gaivotas. Foi efetuada a caracterização fenotípica dos isolados (serotipagem e perfis de resistência a antibióticos) e dete- tados genes específicos associados à patogenicidade e à resistência a antimicrobianos, por PCR e/ou sequenciação total do genoma (WGS). Isolados de E. coli patogénicos, Salmonella spp. e Campylobacter spp. foram detetados em 8,9%, 2,8% e 9,9% das amostras, respetivamente. A resistência a antimicrobianos foi testada em 54 isolados de E. coli, tendo sido detetada em 14 (25,9%). Onze destes isolados revelaram a presença de fatores de virulência, E.coli patogénicos. Dez dos isolados de E. coli revelaram ser resistentes a múltiplos antimicrobianos (MDR) e sete eram produtores de β-lactamases de espectro alargado (ESBL). Re- lativamente aos isolados de Salmonella spp. (n=3) e Campylobacter spp. (n=9), apenas uma estirpe de Campylobacter jejuni foi identificada como MDR. A maioria dos serotipos e/ou Sequence Types (ST) identificados já tinham sido referenciados como associados a doença humana. Estes resultados mostram que as aves que fazem parte da fauna portuguesa podem ser portadoras de bactérias patogénicas capazes de causar do- ença humana, algumas delas resistentes a antimicrobianos críticos.
- Genotypic and Phenotypic Characterization of Pathogenic Escherichia coli, Salmonella spp., and Campylobacter spp., in Free-Living Birds in Mainland PortugalPublication . Batista, Rita; Saraiva, Margarida; Lopes, Teresa; Silveira, Leonor; Coelho, Anabela; Furtado, Rosália; Castro, Rita; Correia, Cristina Belo; Rodrigues, David; Henriques, Pedro; Lóio, Sara; Soeiro, Vanessa; da Costa, Paulo Martins; Oleastro, Mónica; Pista, AngelaBirds are potential carriers of pathogens affecting humans and agriculture. Aiming to evaluate the occurrence of the top three most important foodborne pathogens in free-living birds in Portugal, we investigated 108 individual fecal samples from free-living birds and one pooled sample of gull feces (n = 50) for the presence of Escherichia coli (pathogenic and non-pathogenic), Salmonella spp. and Campylobacter spp. Virulence- and antimicrobial resistance- (AMR) associated genes were detected by PCR and Whole-Genome Sequencing (WGS), and phenotypic (serotyping and AMR profiles) characterization was performed. Overall, 8.9% of samples tested positive for pathogenic E. coli, 2.8% for Salmonella spp., and 9.9% for Campylobacter spp. AMR was performed on all pathogenic isolates and in a fraction of non-pathogenic E. coli, being detected in 25.9% of them. Ten of the tested E. coli isolates were multidrug-resistant (MDR), and seven of them were Extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producers. Among Salmonella (n = 3) and Campylobacter (n = 9), only one strain of C. jejuni was identified as MDR. Most of the identified serotypes/sequence types had already been found to be associated with human disease. These results show that free-living birds in Portugal may act as carriers of foodborne pathogens linked to human disease, some of them resistant to critically important antimicrobials.