Percorrer por autor "Pinto da Costa, Eurico"
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- Further contributions towards the molecular analysis of NIPBL and SMC1A genes in a cohort of patients with Cornelia de Lange SyndromePublication . Pinto da Costa, Eurico; Sousa, Mário; Oliveira, JorgeA Síndrome Cornélia de Lange [CdLS (MIM#122470)] é uma doença multissistémica rara, caracterizada por um fenótipo típico que inclui um dismorfismo facial característico, hirsutismo, atraso no crescimento e desenvolvimento psicomotor, defeitos nos membros, problemas associados a múltiplos sistemas de órgãos, sendo os mais frequentes problemas cardíacos, e refluxo gastrointestinal. A CdLS está associada a defeitos nos genes NIPBL e SMC1A genes (identificados em ~50% e 5% dos doentes, respectivamente), mas outras mutações mais raras foram descritos em outros genes (SMC3, HDCA8, RAD21). A heterogeneidade genética nesta síndrome é explicada ao nível celular, pela proximidade funcional das proteínas codificadas por estes genes, estando envolvidas no complexo das coesinas que unem os cromatídeos irmãos. Em 2005, iniciou-se em Portugal a caracterização clínica e molecular dos doentes com CdLS. A parte inicial deste projecto permitiu a descrição detalhada de treze doentes com novas mutações no gene NIPBL e o desenvolvimento de uma base de dados de mutações específica para este locus (Oliveira et al., 2010). Com a realização desta dissertação de mestrado pretende-se contribuir na caracterização molecular dos restantes 40 doentes Portugueses do grupo de estudo. Os casos não esclarecidos molecularmente foram analisados por outras técnicas nomeadamente, multiplex ligation-dependent probe amplification technique aplicada ao gene NIPBL, e por high resolution melting curve analysis (hrMCA) desenvolvida para o gene SMC1A. A análise do gene NIPBL permitiu a identificação de oito mutações anteriormente descritas na literatura (incluindo um caso com suspeita de mosaicismo somático), três novas mutações (c.86del, c.6983C>G e c.7307C>T), bem como duas grandes delecções neste gene. O desenvolvimento da técnica hrMCA aplicada ao gene SMC1A demonstrou ser eficaz, tratando-se de um método rápido e rentável, tendo permitido a identificação de uma mutação (c.1487G>A). Considerando todos os dados obtidos, foram identificadas mutações em 51% dos doentes Portugueses com CdLS. A utilização de diferentes técnicas moleculares foi essencial para atingir uma taxa de detecção de mutações mais elevada. Devido à recente descoberta de dois genes envolvidos na doença, (HDCA8, RAD21), e existindo ainda uma percentagem razoável de casos sem mutação identificada, é possível que novas causas genéticas de CdLS sejam identificadas neste doentes.
- Further contributions towards the molecular analysis of NIPBL and SMC1A genes in a cohort of patients with Cornelia de Lange SyndromePublication . Pinto da Costa, Eurico; Oliveira, Jorge; Silva, João; Santos, RosárioCornelia de Lange Syndrome [CdLS (MIM#122470)] is a rare multisystemic disorder, characterized by a typical phenotype that includes distinctive facial dysmorphism, hirsutism, growth and psychomotor developmental delay, abnormalities of the upper extremities, and relatively frequent gastrointestinal and congenital heart defects. CdLS is essentially caused by mutations in the NIPBL and SMC1A genes (~50% and 5% of cases, respectively), but mutations have been also described in other genes (PDS5A, PDS5B, SMC3) (http://www.lovd.nl/CDLS). This genetic heterogeneity in CdLS can however be explained by a close functional relationship at the cellular level, since all these proteins are involved in chromatid cohesion. The molecular and clinical characterization of 42 Portuguese CdLS patients has been previously described (Oliveira et al., 2010). In this work we conducted the molecular analysis of NIPBL gene and more recently expanded this study to other 20 patients. Subsequently, all the molecularly unresolved patients were screened for large deletions and duplications in NIPBL by MLPA, and point mutations in SMC1A by high resolution melting curve analysis and sequencing. Preliminary results allowed us to identify 4 previously known mutations (including a case with somatic mosaicism), 3 novel mutations (c.3316C>T, c.6983C>G and c.7307C>T) and 2 large deletions in the NIPBL gene. Mutation screening in SMC1A is still ongoing. Our results, at least for NIPBL gene analysis, suggest that the use of several different techniques is essential for attaining a high mutation detection rate. CdLS cases with somatic mosaicism are probably underestimated in the literature and may explain some degree of phenotypical variability.