Browsing by Author "Palminha, Paula"
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- An Overview of Monkeypox Virus Detection in Different Clinical Samples and Analysis of Temporal Viral Load DynamicsPublication . Cordeiro, Rita; Pelerito, Ana; de Carvalho, Isabel Lopes; Lopo, Sílvia; Neves, Raquel; Rocha, Raquel; Palminha, Paula; Verdasca, Nuno; Palhinhas, Cláudia; Borrego, Maria José; Manita, Carla; Ferreira, Idalina; Bettencourt, Célia; Vieira, Patrícia; Silva, Sónia; Água-Doce, Ivone; Roque, Carla; Cordeiro, Dora; Brondani, Greice; Santos, João Almeida; Martins, Susana; Rodrigues, Irene; Ribeiro, Carlos; Núncio, Maria Sofia; Gomes, João Paulo; Batista, Fernando da ConceiçãoMpox is a zoonotic disease caused by the Monkeypox virus (MPXV), and since May 2022, tens of thousands of cases have been reported in non-endemic countries. We aimed to evaluate the suitability of different sample types for mpox diagnostic and assess the temporal dynamics of viral load. We evaluated 1914 samples from 953 laboratory-confirmed cases. The positivity rate was higher for lesion (91.3%) and rectal swabs (86.1%) when compared with oropharyngeal swabs (69.5%) and urines (41.2%), indicating higher viral loads for the former. Supporting this, lesion and rectal swabs showed lower median PCR C values (C = 23 and C = 24), compared to oropharyngeal swabs and urines (C = 31). Stable MPXV loads were observed in swabs from lesions up to 30 days after symptoms onset, contrasting with a considerable decrease in viral load in rectal and oropharyngeal swabs. Overall, these results point to lesion swabs as the most suitable samples for detecting MPXV in the 2022-2023 multicountry outbreak and show comparable accuracy to rectal swabs up to 8 days after symptoms onset. These findings, together with the observation that about 5% of patients were diagnosed through oropharyngeal swabs while having negative lesions, suggest that multisite testing should be performed to increase diagnostic sensitivity.
- Avaliação Externa da Qualidade em Serologia da Rubéola, PNAEQ (2015-2017)Publication . Correia, Helena; Cardoso, Ana; Pereira, Edna; Ventura, Catarina; Viegas, Sílvia; Vinagre, Elsa; Palminha, Paula; Faria, Ana PaulaA Rubéola é uma infeção viral aguda e contagiosa que pode ser prevenida pela vacinação. A infeção pelo vírus da Rubéola em crianças e adultos provoca sintomas como febre ligeira e exantema. No entanto, a infeção durante a gravidez, especialmente durante o primeiro trimestre, pode provocar aborto, morte fetal, nado-morto, ou crianças com malformações congénitas. Em Portugal, a vacina contra a Rubéola foi introduzida no Plano Nacional de Vacinação (PNV) em 1982 e nos últimos 7 anos foram notificados 3 casos de rubéola congénita, dois dos quais importados e um autóctone. Todos os casos resultaram de infeções sintomáticas em mulheres não vacinadas. O Programa Nacional de Avaliação Externa da Qualidade (PNAEQ) implementou em 1994 o programa de serologia para diagnóstico laboratorial da Rubéola e conta com peritos na área. O objetivo deste trabalho é avaliar o desempenho dos laboratórios participantes no PNAEQ na determinação de IgG, IgM e avidez da IgG para rubéola no período 2015 a 2017.
- Challenging measles case definition: three measles outbreaks in three Health Regions of Portugal, February to April 2018Publication . Augusto, Gonçalo Figueiredo; Cruz, Diogo; Silva, Andreia; Pereira, Natália; Aguiar, Bárbara; Leça, Ana; Serrada, Elisabete; Valente, Paula; Fernandes, Teresa; Guerra, Fernando; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Lopo, Sílvia; Cordeiro, Rita; Sáez-López, Emma; Neto, Maria; Nogueira, Paulo Jorge; Freitas, GraçaWe report three simultaneous measles outbreaks with 112 confirmed cases in three Health Regions of Portugal, from February to April 2018. The mean age of cases was 30 years, 79% worked in a healthcare setting and 87% were vaccinated. Genotype B3 was identified in 84 cases from the three outbreaks. Primary cases in each outbreak were imported. Several cases presented with modified measles, highlighting the importance of rethinking the measles case definition for vaccinated cases.
- Citomegalovírus: análise retrospetiva de casos suspeitos de infeção do sistema nervoso central, diagnosticados entre 2010 e 2014Publication . Lopo, Sílvia; Reis, Tânia; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Furtado, CristinaEste estudo tem como objetivo descrever as características demográficas e o quadro clínico e imunitário de doentes com suspeita de infeção viral neurotrópica e analisar a frequência das infeções por CMV nas patologias do SNC, cujo diagnóstico foi confirmado no Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) entre janeiro de 2010 e abril de 2014.
- CMV and HCV infections in HIV/non-HIV mothers and newborns: prevalence, frequency and risk factorsPublication . Lopo, Sílvia; Pereira, Maria Amável; Mendonça, Joana; Vinagre, Elsa; Reis, Tânia; Cordeiro, Dora; Almeida, Catarina; Água-Doce, Ivone; Manita, Carla; Palminha, Paula; Pádua, Elizabeth; Paixão, Maria Teresa; Carreiro, Helena; Barroso, Rosalina; Campos, Teresa; Marques, TâniaThe incidence of HIV infections in gestational age is an important Public Health issue as are concerns about co-infection with opportunistic viruses, such as CMV/HCV. Several authors refer higher ratios of congenital CMV infection in children born to HIV infected mother than in uninfected. In the case of HCV, perinatal transmission increases in cases of mothers co-infected with HIV. Aims:To study CMV/HCV infection/co-infection in HIV/non-HIV women and their newborns between 2006-2010, according to epidemiological, laboratory and clinical data; to evaluate frequency of CMV/HIV/HCV maternal-fetal transmission and analyse risk factors for infections. Methods:Plasma and/or urine of 137 HIV and 140 non-HIV women, attending a Lisbon Hospital and their 140 newborns were analysed at NIH. HIV-1 and/or HIV-2 proviral DNA nested-PCR was performed on HIV mothers and their newborn’s plasma. Maternal plasma was screened for CMV and HCV antibodies; RNA determination, genotyping and viral load were performed on women with HCV antibodies, their newborn’s plasma was also screened for HCV. Newborn’s urine was inoculated for CMV detection. Data analysis was performed using SPSS 17.0 and Fisher's exact test. Results:HIV1 vertical transmission was diagnosed in 3/140(2.1%) cases. CMV congenital infection was diagnosed in 4(2.9%) newborns from HIV women and no congenital CMV infection was diagnosed in newborns from non-HIV women. 2/137(1.5%) HIV women and 14/140(10.0%) non-HIV women were CMV seronegative. HCV infection was detected in 6(4.4%) HIV women; all had HCV positive viral load; different genotypes were found. One case of HCV perinatal transmission was diagnosed. No HCV antibodies were found in non-HIV women. No children were HIV/HCV or CMV/HCV coinfected but 2 were HIV/CMV coinfected. There is evidence of significant statistical associations with race/ethnicity and time of pregnancy. Conclusion:In this study HIV women had higher CMV/HCV antibody prevalence and frequency of maternal-fetal transmission than non-HIV women. 2/137 HIV seronegative newborns and 2/3 HIV newborns were CMV congenitally infected; this difference should be further studied, as the consequences of CMV/HCV infections may become increasingly serious and complex in the presence of HIV. This specific group is not representative of the Portuguese infected women, nevertheless the significant risk factors found and other risk factors studied without strong associations should be considered in larger studies.
- Diagnóstico laboratorial do sarampo em Portugal, 2011-2013Publication . Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Cordeiro, Rita; Ribeiro, Carlos; Roque, CarlaObjetivo: Este estudo tem como objetivo descrever os casos prováveis de sarampo enviados ao INSA para confirmação laboratorial entre 2011 e 2013 em Portugal.
- Enterovirus D68 diagnosed in severe respiratory and neurological illness in children during 2015-2016 season in PortugalPublication . Guiomar, Raquel; Costa, Inês; Pechirra, Pedro; Palminha, Paula; Ribeiro, Carlos; Roque, Carla; Peres, Maria João; Viseu, Regina; Balseiro, Maria Jesus; Brito, Maria João; Neves, João; Branquinho, Paula; Côrte-Real, RitaBackground: Enterovirus D68 (EV-D68) was first isolated in 1962, and since then associated with respiratory illness. The report of severe respiratory and neurological disease including deaths associated to EV-D68 in United States and Canada during August 2014 highlighted the need of epidemiological information regarding EV-D68 circulation. In Europe information was scarce, available only for few countries. In Portugal there was no data available and was critical to know the epidemiology of EV-D68, especially in children hospitalized with severe respiratory or neurological disease. This study aims to identify EV-D68 in Enterovirus positive respiratory samples in children under 18 with clinical diagnosis of severe respiratory infection or neurological illness. Methods: During 2015/16 winter season, between November/2015 and March/2016, 29 EV positive cases were reported to the National Influenza and Other Respiratory Virus Reference Laboratory (NIC) by two hospitals located in Lisbon and Setubal districts. EV diagnosis was performed in hospitals by biomolecular methods using commercial kits (real time multiplex-PCR, FTD Respiratory pathogens 21 and CLART Pneumovir, Genomica, respectively). EV-D68 was diagnosed by an in house real-time PCR [1]. Virus isolation in RD cell line and phylogenentic analysis of the VP1/VP3 genomic regions will enable the identification of genetic groups in circulation. All samples were irreversibly anonymized. Demographic and clinical data were collected. Results: EV-D68 was confirmed in 20 respiratory samples previously positive for EV (69%; 20/29). Samples were collected from children with age ranging from 2 months to 6 years old, both genders (9 female; 11 male) with diagnosis of severe respiratory or neurological illness. Eighteen cases were hospitalized (90%; 18/20). Bronchiolitis and pneumonia were the most frequently reported diagnosis, corresponding to 70% (14/20). Two cases have neurologic diagnosis. EV-D68 was identified throughout all study period with the higher number of positive cases detected during January 2016, in week 3. Virus isolation and genetic characterization are under way with expected results in virus phylogeny and evaluation on similarity with recent circulating strains in United States, Canada and European countries. Conclusions: EV-D68 was detected in a high positive rate (69%) among EV positive cases. This positive rate of EV-D68 was higher compared to the positivity rate of 10,2 %, calculated in a European study during 2014 [2]. This finding could be linked to the selection of severe and hospitalized patients in present study, highlighting the involvement of EV-D68 with severe respiratory disease in children. The identification of EV-D68 is also crucial in respiratory samples in children with clinical diagnosis of neurological illness. This study is the first attempt to describe the prevalence of EV-D68 in severe paediatric cases, in Portugal. The strength of EV-D68 surveillance in paediatric and adult population at the national level will be important to understand the epidemiology of EV-D68, age-related susceptibility and association with disease severity.
- Enterovírus não-polio e infeções do sistema nervoso central em crianças: avaliação laboratorial, 2023-2024Publication . Palminha, Paula; Neves, Raquel; Ribeiro, Carlos; Garcia, Ana Margarida; Fontes, Inês Sousa; Gouveia, Catarina; Corte-Real, RitaOs enterovírus não-polio permanecem como os principais agentes patogénicos do sistema nervoso central (SNC) em todo o mundo, especialmente em crianças com idade inferior a 5 anos, causando desde doença ligeira a quadros graves que podem evoluir para desfechos fatais. Entre 2023 e 2024 foram analisadas no INSA fezes de 327 crianças com suspeita de infeção por enterovírus. O diagnóstico laboratorial incluiu a deteção do RNA viral por RT-PCR em tempo real e o isolamento viral. A identificação viral foi realizada por sequenciação genómica. Neste período foram identificados 109 (33,3%) casos de infeção a enterovírus, dos quais 26 casos (23,9%) corresponderam a infeções do SNC, maioritariamente em crianças com menos de 5 anos (88,5%), sem uma evidente distribuição temporal. Os enterovírus mais frequentes foram os echovírus (tipos 5, 6,7, 9, 18, 21, 25, 30, 31 e 32), detetados em 13 casos (52,0%), seguidos pelos Coxsackievírus A (tipos 4, 6, 9, 10 e 16), em 7 casos (28,0%), ambos associados a meningite e meningoencefalite. O Enterovírus 71 (EV71) foi detetado em dois casos, um de romboencefalite e um de paralisia flácida aguda (PFA), e um caso de meningite esteve associado ao EV-C99. Não se observou nenhum padrão de surto nestes dois anos. Estes resultados reforçam a relevância da identificação rápida e dirigida para enterovírus como agentes etiológicos de infeções do SNC, fundamental para uma intervenção clínica direcionada, evitando o uso desnecessário de antibióticos e de múltiplos exames complementares de diagnóstico
- Falência vacinal secundária contra o sarampo: casos identificados em 2024Publication . Neves, Raquel; Ribeiro, Carlos; Palminha, PaulaPortugal alcançou o estatuto de eliminação do sarampo em 2015, no entanto, continuam a ocorrer surtos esporádicos, incluindo casos em indivíduos previamente vacinados. O teste de avidez das IgG avalia a força de ligação das imunoglobulinas ao seu antigénio específico, a qual aumenta ao longo da resposta imunitária, permitindo assim distinguir infeções primárias de respostas imunes pré-existentes. Este estudo teve como objetivo identificar casos de falência vacinal secundária contra o sarampo que ocorreram em 2024 utilizando o teste de avidez das IgG. Em 2024 foram confirmados 35 casos de sarampo em pacientes com idades entre 1 e 61 anos. A avidez de IgG foi avaliada em 17 casos (48,6%): 14 vacinados com duas doses de VASPR e 3 com estado vacinal desconhecido. Todos os soros, exceto um, foram colhidos durante a primeira semana após o início do exantema e utilizados reagentes comerciais com ureia como agente desnaturante. O RNA do vírus do sarampo foi detetado em todos os 16 casos. A IgM foi positiva em 6 pacientes: 5 vacinados e 1 com vacinação desconhecida. IgG de baixa avidez (IA < 40%) ocorreu apenas no paciente com vacinação desconhecida e IgM positiva, indicando infeção primária. Os outros 2 pacientes com vacinação não documentada apresentaram IgG de alta avidez e IgM negativa sugerindo falência vacinal secundária ou reinfeção. Todos os 14 casos vacinados apresentaram IgG de alta avidez (IA > 60%), sendo 5 também positivos para a IgM. O estudo identificou uma infeção primária e dois casos de falência vacinal secundária ou reinfeção em indivíduos com status desconhecido. Todos os casos em vacinados ocorreram em adultos, mais de 10 anos após a segunda dose da VASPR, sendo compatíveis com uma falência vacinal secundária e representando 40% dos casos de 2024. Isso reflete o contexto pós-eliminação em Portugal, onde a baixa exposição ao vírus selvagem reduz o reforço natural da imunidade, permitindo sintomas moderados e replicação viral apesar da vacinação prévia.
- Infeção por parvovírus B19 durante a gravidez: análise retrospetiva de casos suspeitos diagnosticados no INSA (2009-2012)Publication . Lopo, Sílvia; Reis, Tânia; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Gargaté, Maria João
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