http://hdl.handle.net/10400.18/23 Tue, 14 May 2013 22:58:03 GMT 2013-05-14T22:58:03Z http://hdl.handle.net/10400.18/1382 Title: Antimicrobial resistance surveillance in Europe 2011. Annual Report of the European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net) Authors: EARS-Net Management Team & National representatives of EARS-Net Abstract: The results presented in this report are based on antimicrobial resistance data from invasive isolates reported to EARS-Net by 29 EU/EEA countries in 2012 (data referring to 2011), and on trend analyses of EARSS/EARS-Net data reported by the participating countries during the period 2008 to 2011. The results show a general Europe-wide increase of antimicrobial resistance in the gram-negative pathogens under surveillance (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa), whereas the occurrence of resistance in the gram-positive pathogens (Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis) appears to be stabilising or even decreasing in some countries. For most pathogen–antimicrobial combinations, large inter-country variations are evident. In 2011, the most alarming evidence of increasing antimicrobial resistance in Europe came from data on combined resistance (resistance to third-generation cephalosporins, fluoroquinolones and aminoglycosides) in E. coli and in K. pneumoniae. For both of these pathogens, more than one third of the reporting countries had significantly increasing trends of combined resistance over the last four years. The high and increasing percentage of combined resistance observed for K. pneumoniae means that for some patients with life-threatening infections, only a few therapeutic options remain available, e.g. carbapenems. However since 2010, carbapenem-resistance has increased in a number of countries, further aggravating the situation. For P. aeruginosa, combined resistance is also common, with 15% of the isolates resistant to at least three of the antimicrobial classes under surveillance. The seemingly unimpeded increase of antimicrobial resistance in the major gram-negative pathogens will unavoidably lead to loss of therapeutic treatment options. In parallel, other trends of antimicrobial resistance reported to EARS-Net indicate that national efforts on infection control and containment of resistance are effective, as illustrated by the trends for meticillinresistant S. aureus (MRSA), antimicrobial-resistant S. pneumoniae and antimicrobial-resistant enterococci, for which the situation appears generally stable or even improving in some countries. For MRSA, these observations are consistent with reports from the national surveillance programmes of some Member States and recent scientific studies on the results of infection control efforts. Large inter-country variations can be noted for S. pneumoniae, but non-susceptibility to commonly used antimicrobials has remained relatively stable in Europe during recent years, and this observation was confirmed by the 2011 data. High-level aminoglycoside resistance in E. faecalis seems stable in Europe and several countries which previously reported relatively high levels of resistance now have decreasing trends. Likewise, the occurrence of vancomycin-resistance in E. faecium is stabilising or decreasing. For several antimicrobial–pathogen combinations, e.g. fluoroquinolone-resistance in E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa and for MRSA, a north-to-south gradient is evident in Europe. In general, lower resistance percentages are reported in the north and higher percentages in the south of Europe. These geographical differences may reflect differences in infection control practices and antimicrobial use in the reporting countries. Prudent use of antimicrobial agents and comprehensive infection control measures should be cornerstones of effective prevention and control efforts aimed at reducing the selection and transmission of antimicrobial-resistant bacteria. Description: EARS-Net Management Team & National representatives of EARS-Net (Manuela Caniça, Vera Manageiro, Eugénia Ferreira) Sun, 01 Jan 2012 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10400.18/1382 2012-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/10400.18/1183 Title: Programa Nacional de Vigilância da Gripe - Relatório da Época 2011/2012 Authors: Gonçalves, Paulo; Pechirra, Pedro; Conde, Patrícia; João, Inês; Guiomar, Raquel; Nunes, Baltazar Abstract: O Programa Nacional de Vigilância da Gripe tem como objectivo a recolha, análise e disseminação da informação sobre a atividade gripal, identificando e caracterizando de forma precoce os vírus da gripe em circulação em cada época bem como a identificação de vírus emergentes com potencial pandémico e que constituam um risco para a saúde pública, procurando contribuir, desta forma, para a diminuição da morbilidade e mortalidade associada à infecção e suas complicações. As informações resultantes da vigilância permitem ainda a orientação de medidas de prevenção e controlo da doença de forma precisa. Com a elaboração deste relatório pretende-se proceder à descrição e divulgação dos resultados obtidos na época de inverno de 2011/2012, efectuando uma síntese da atividade gripal em Portugal durante esta época. Na época 2011/2012 foram notificados um total de 962 casos de SG. A atividade gripal foi considerada alta / moderada e o maior número de notificações foi observado entre final de Janeiro e a primeira quinzena de Março, com um pico de ocorrência na semana 9/2012. As taxas de incidência semanais do SG mantiveram-se acima da área de atividade basal durante 9 semanas consecutivas, entre as semanas 4/2012 e 12/2012, com um valor máximo de 137,71 casos de SG por 100 000 habitantes na semana 10/2012. Mais de metade das notificações tiveram origem em indivíduos do género feminino. O grupo etário mais representado foi o correspondente à população jovem/adulta com idades compreendidas entre os 15 e os 44 anos, embora a distribuição semanal das taxas de incidência revele uma maior incidência da doença no grupo etário correspondente às crianças em idade escolar dos 0-4 anos e maiores de 65 anos. O início súbito e o mal-estar, debilidade ou prostração foram os sintomas/sinais mais frequentes. A vacina antigripal foi administrada a 20,7% dos casos notificados, com a maior proporção de casos vacinados a ser observada no grupo etário dos idosos (≥65 anos). A análise laboratorial a 678 exsudados da nasofaringe revelou a presença de vírus influenza em 39,2% dos exsudados. Dos 266 vírus influenza identificados, 97,7% pertenciam ao subtipo A(H3) e 2,3% pertenciam à linhagem Yamagata dos vírus influenza do tipo B. Os vírus dos subtipos A(H1)pdm09 e A(H1) sazonal não foram identificados nos casos estudados. Os vírus influenza A(H3), predominantes na época 2011/2012 foram detetados entre a semana 51/2011 e 18/2012. A maior percentagem de casos de gripe foi verificada nas crianças com idade compreendida entre os 5 e os 14 anos. A análise antigénica e genética realizada revelou que, na sua maioria, os vírus identificados foram semelhantes às estirpes que constituíram a vacina antigripal desta época. As estirpes de vírus influenza estudadas são susceptíveis aos inibidores da neuraminidase e resistentes aos adamantanos. O diagnóstico diferencial de vírus respiratórios detetou a presença em maior frequência de Rhinovírus humano, seguido de Vírus Sincicial Respiratório e vírus Parainfluenza. Tue, 01 Jan 2013 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10400.18/1183 2013-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/10400.18/1147 Title: Desenvolvimento de Ferramentas Analíticas para o Rastreamento de Fontes Fecais: Acção-piloto 3 do Projecto ICREW : sumário executivo Authors: Gawler, Andrew; Brandão, João; Carroll, Nora; Falcão, Leonor; Masterson, Bartholomew; Nunes, Baltazar; Rincé, Alain; Gourmelon, Michele; Rodrigues, Raquel; Thorp, Martin; Walters, Martin; Meijer, Wim Abstract: A Agência Ambiental de Inglaterra e País de Gales assegurou o financiamento EU INTERREG IIIB de um projecto denominado ‘ICREW’ – Melhorar as Águas Costeiras e Recreativas. Pretendia-se com o projecto ajudar cinco estados-membro da UE – Reino Unido, Irlanda, França, Portugal e Espanha – a melhorar a qualidade das referidas águas e preparar a implementação de nova legislação da UE respeitante às mesmas. O projecto ICREW foi avaliado em aproximadamente €8m. e era composto por sete projectos, ou “acções piloto”. O projecto ICREW decorreu entre Abril de 2003 e Abril 2006. Uma dessas acções piloto, Acção Piloto 3, que envolvia parceiros da Irlanda, França, Portugal e RU, abordou o tema do rastreamento da fonte microbial da poluição fecal, do ponto de vista regulamentar. O seu objectivo foi “gerar uma ferramenta de trabalho que pode ser usada para distinguir as fontes de poluição que contribuem para uma amostra ambiental”. Sun, 01 Jan 2006 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10400.18/1147 2006-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/10400.18/1146 Title: Melhor qualidade para as àguas balneares e de recreio. Desenvolvimento do rastreamento de fontes de poluição: Ação-Piloto 3 do Projecto ICREW : sumário executivo Authors: Brandão, João; Rodrigues, Raquel; Falcão, Leonor; Gawler, Andy; Meijers, Wim; Rince, Alain; Thorp, Martin; Walters, Martin; Carroll, Nora; Gourmelon, Michele; Masterson, Bartholomew; Nunes, Baltazar Abstract: A Agência Ambiental de Inglaterra e País de Gales candidatou-se ao programa INTERREG IIIB, da União Europeia (UE), para financiamento de um projecto denominado ‘ICREW’ – Melhorar a Qualidade das Águas Balneares e de Recreio. Pretendia-se com o projecto ajudar cinco estados-membros da UE – Reino Unido, República da Irlanda, França, Portugal e Espanha – a melhorar a qualidade das referidas águas e preparar a implementação de nova legislação da UE respeitante às mesmas. O projecto ICREW foi avaliado em aproximadamente oito milhões de Euros e era composto por sete sub-projectos, ou “acções piloto”. O projecto ICREW decorreu entre Abril de 2003 e Abril 2006. Uma dessas acções piloto, a Acção Piloto 3, que envolvia parceiros da República da Irlanda, França, Portugal e Reino Unido, abordou o tema investigação da origem de contaminações fecais, microbiológicas numa perspectiva legislativa. O seu objectivo foi criar uma ferramenta de trabalho que possa ser usada para a diferenciação de fontes de poluição que tenham contribuído para a contaminação de amostras ambientais. A qualidade das águas balneares e conquícolas, expressa em termos de concentração de organismos indicadores de contaminação fecal, é normalmente sujeita a uma grande variação num mesmo local. As variações da qualidade são muitas vezes acontecimentos transitórios, pelo que quando controladas pela recolha de amostras de rotina são muitas vezes difíceis de explicar. Esta situação é particularmente frequente em bacias hidrográficas complexas nas quais existe uma grande variedade de fontes de contaminação focais e difusas, umas contínuas, outros intermitentes, com diferentes tempos de percurso até ao ponto de colheita. As técnicas de modelação da qualidade da água podem ser utilizadas para solucionar alguns desses aspectos, dado que cada entrada individual pode ser modelada independentemente ou em combinação com outras. Da mesma forma, podem utilizar-se estudos de rastreio para monitorizar um número limitado de entradas em qualquer momento. Contudo, esses métodos têm as suas limitações e muitas vezes é difícil atribuir a não conformidade a uma fonte ou tipo de fonte individual. A tipagem (caracterização) microbiana permite examinar amostras ambientais de forma tanto qualitativa como quantitativa, atribuindo os indicadores fecais encontrados nas amostras às suas diferentes origens. A bibliografia científica refere vários métodos de caracterização diferentes, contudo nenhum demonstrou ser uma ferramenta geral para a resolução de questões ambientais práticas complexas (neste contexto). O objectivo deste estudo foi criar uma ferramenta prática que pudesse ser usada na diferenciação de fontes de poluição fecal associadas a amostras ambientais. A intenção foi por em prática o uso do rastreio de fontes de contaminação, como uma ferramenta de gestão de bacias hidrográficas na UE. Um dos potenciais benefícios de tal metodologia seria ajudar a atingir os padrões rigorosos relativamente a E. coli e enterococos intestinais, em determinados locais quando for implementada a revisão à actual directiva sobre as águas balneares. Sun, 01 Jan 2006 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10400.18/1146 2006-01-01T00:00:00Z